website/archive/binaries/mac/src/clustalo/ChangeLog

   1 2010-06-17 Release 0.0.1 (Dubliniensis)
   2
   3                 First "release" as program has been able for a while to perform
   4                 all basic tasks without problems.
   5
   6                 Non-standard features already built-in include:
   7                 HMM-iteration (using HMMER for building an HMM) and guide-tree
   8                 iteration. On top of that HMM input works fine and
   9                 background-frequencies are added to the HHalign process.
  10
  11                 Known issues: RNA/DNA alignment is considered buggy. Aligned
  12                 sequences have to be dealigned for HHalign to work properly.
  13
  14                 The HMMER version message can be ignored if no HMM-iteration
  15                 was used.