website/archive/binaries/mac/src/tcoffee/t_coffee_source/util_domain_constraints_list.c

   1 #include <stdlib.h>
   2 #include <stdio.h>
   3 #include <math.h>
   4 #include <stdarg.h>
   5 #include <string.h>
   6
   7 #include "io_lib_header.h"
   8 #include "util_lib_header.h"
   9 #include "define_header.h"
  10
  11 /*********************************************************************/
  12 /*                                                                   */
  13 /*                         MISCEANELLOUS                             */
  14 /*                                                                   */
  15 /*                                                                   */
  16 /*********************************************************************/
  17 int ** get_undefined_list (Constraint_list *CL)
  18          {
  19          int **list;
  20          int a;
  21          CLIST_TYPE x;
  22          int *e;
  23          list=declare_int ( (CL->S)->nseq+1, (CL->S)->max_len+1);
  24
  25
  26          while (e=extract_entry (CL))
  27            {
  28              x=e[WE];
  29              list[e[SEQ1]][e[R1]]=(x==UNDEFINED);
  30              list[e[SEQ2]][e[R2]]=(x==UNDEFINED);
  31            }
  32          return list;
  33          }
  34
  35
  36
  37 /******************************COPYRIGHT NOTICE*******************************/
  38 /*© Centro de Regulacio Genomica */
  39 /*and */
  40 /*Cedric Notredame */
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  49 /**/
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  53 /*    GNU General Public License for more details.*/
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  56 /*    along with Foobar; if not, write to the Free Software*/
  57 /*    Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307  USA*/
  58 /*...............................................                                                                                      |*/
  59 /*  If you need some more information*/
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  61 /*...............................................                                                                                                                                     |*/
  62 /**/
  63 /**/
  64 /*      */
  65 /******************************COPYRIGHT NOTICE*******************************/