JAL-2920 revised TODO for JAL-3025
[jalview.git] / THIRDPARTYLIBS
index 7d12783..e2baa85 100644 (file)
@@ -6,11 +6,14 @@ A number of sources have also been adapted for incorporation into Jalview's sour
 
 ext.edu.ucsf.rbvi.strucviz2 includes sources originally developed by Scooter Morris and Nadezhda Doncheva for the Cytoscape StructureViz2 plugin. It is released under the Berkley license and we hereby acknowledge its original copyright is held by the UCSF Computer Graphics Laboratory
  and the software was developed with support by the NIH National Center for Research Resources, grant P41-RR01081. 
+ jalview.ext.android includes code taken from the Android Open Source Project (https://android.googlesource.com/platform/frameworks/base/+/master/core/java/android/util).
+ The Apache 2.0 Licence (http://www.apache.org/licenses/LICENSE-2.0) is acknowledged in the source code.
 
-Licencing information for each library is given below:
+Licensing information for each library is given below:
 
 JGoogleAnalytics_0.3.jar       APL 2.0 License - http://code.google.com/p/jgoogleanalytics/
-Jmol-14.2.14_2015.06.11.jar    GPL/LGPLv2 http://sourceforge.net/projects/jmol/files/
+Jmol-14.6.4_2016.10.26.jar     GPL/LGPLv2 http://sourceforge.net/projects/jmol/files/
 VARNAv3-93.jar GPL licenced software by K�vin Darty, Alain Denise and Yann Ponty. http://varna.lri.fr
 activation.jar 
 apache-mime4j-0.6.jar
@@ -46,6 +49,8 @@ jfreesvg-2.1.jar : GPL v3 licensed library from the JFree suite: http://www.jfre
 
 quaqua: v.8.0 (latest stable) by Randel S Hofer. LGPL and BSD Modified license: downloaded from http://www.randelshofer.ch/quaqua/ 
 
+vaqua: v4 (latest stable) by Alan Snyder et al. GPLv2 with Classpathe xception, also includes contributions from Quaqua: ownloaded from http://violetlib.org/vaqua/overview.html
+
 lib/htsjdk-1.120-SNAPSHOT.jar: (currently not required for 2.10) built from maven master at https://github.com/samtools/htsjdk MIT License to Broad Institute
 
 lib/biojava-core-4.1.0.jar LGPLv2.1 - latest license at https://github.com/biojava/biojava/blob/master/LICENSE