JAL-3992 fix path
[jalview.git] / doc / developing.html
index b081e86..bba990e 100644 (file)
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-<!DOCTYPE html SYSTEM "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">\r
-<!--\r
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.5)\r
- * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle\r
- * \r
- * This file is part of Jalview.\r
- * \r
- * Jalview is free software: you can redistribute it and/or\r
- * modify it under the terms of the GNU General Public License \r
- * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.\r
- * \r
- * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but \r
- * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty \r
- * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR \r
- * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.\r
- * \r
- * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.\r
---!>\r
-<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml">\r
-  <head>Developing Jalview</head>\r
-  <body>\r
-<p><h1>Developing Jalview</h1>\r
-</p>\r
-<ul>\r
-<li>Basic Source Structure Guidelines</li>\r
-<li>The Applet and The Application - whats the difference ?</li>\r
-<li>Package Architecture<br>\r
-</li>\r
-<li>Specific  Development Guidelines\r
-<ul>\r
-<li><a href="newdmobj.html">Adding new datamodel objects to Jalview</a></li>\r
-<li>Adding new IO capabilities to Jalview</li>\r
-<li>Adding new database types to Jalview</li>\r
-<li>Working with the Jalview DAS annotation fetcher</li>\r
-<li>Adding new analysis methods to jalview</li>\r
-<li>Adding new web service functionality to jalview</li>\r
-</ul>\r
-</li>\r
-</ul>\r
-</body>\r
-</html>\r
+<!--
+ *Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
+ *Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
+ *
+ *This file is part of Jalview.
+ *
+ *Jalview is free software: you can redistribute it and/or
+ *modify it under the terms of the GNU General Public License 
+ *as published by the Free Software Foundation, either version 3
+ *of the License, or (at your option) any later version.
+ * 
+ *Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
+ *WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
+ *of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
+ *PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
+ *
+ *You should have received a copy of the GNU General Public License
+ *along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ *The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
+-->
+<!DOCTYPE html SYSTEM "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
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+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
+ * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
+ * 
+ * This file is part of Jalview.
+ * 
+ * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
+ * modify it under the terms of the GNU General Public License 
+ * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
+ *  
+ * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
+ * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
+ * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
+ * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
+ * 
+ * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
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+<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml">
+  <head>Developing Jalview</head>
+  <body>
+<p><h1>Developing Jalview</h1>
+</p>
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+<li>Basic Source Structure Guidelines</li>
+<li>The Applet and The Application - whats the difference ?</li>
+<li>Package Architecture<br>
+</li>
+<li>Specific  Development Guidelines
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+<li><a href="newdmobj.html">Adding new datamodel objects to Jalview</a></li>
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