git://source.jalview.org / jalview.git / blobdiff
? search:
summary | shortlog | log | commit | commitdiff | tree
raw | inline | side by side
JAL-1645 Version-Rel Version 2.9 Year-Rel 2015 Licensing glob
[jalview.git] / help / html / colourSchemes / abovePID.html
diff --git a/help/html/colourSchemes/abovePID.html b/help/html/colourSchemes/abovePID.html
index d39772b..80d45f4 100755 (executable)
--- a/help/html/colourSchemes/abovePID.html
+++ b/help/html/colourSchemes/abovePID.html
@@ -1,22 +1,26 @@
 <html>
 <!--
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)
- * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.9)
+ * Copyright (C) 2015 The Jalview Authors
  * 
  * This file is part of Jalview.
  * 
  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
- * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
- * 
+ * as published by the Free Software Foundation, either version 3
+ * of the License, or (at your option) any later version.
+ *  
  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  * 
- * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
--->
-<head><title>Above PID Colours</title>
+ * You should have received a copy of the GNU General Public License
+ * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
+ -->
+<head>
+<title>Above PID Colours</title>
 <style type="text/css">
 <!--
 td {
@@ -27,11 +31,14 @@ td {
 </head>
 
 <body>
-<p> <em>Colouring above a percentage identity threshold</em></p>
-<p> Selecting this option causes the colour scheme to be applied to only those
-  residues that occur in that column more than a certain percentage of the time.
-  For instance selecting the threshold to be 100 will only colour those columns
-  with 100 % identity. This threshold option can be applied to the Zappo, Taylor,
-  Hydrophobicity and User colour schemes. </p>
+  <p>
+    <strong>Colouring above a percentage identity threshold</strong>
+  </p>
+  <p>Selecting this option causes the colour scheme to be applied to
+    only those residues that occur in that column more than a certain
+    percentage of the time. For instance selecting the threshold to be
+    100 will only colour those columns with 100 % identity. This
+    threshold option can be applied to the Zappo, Taylor, Hydrophobicity
+    and User colour schemes.</p>
 </body>
 </html>