JAL-1645 Version-Rel Version 2.9 Year-Rel 2015 Licensing glob
[jalview.git] / help / html / colourSchemes / pid.html
index f46b10c..20e8330 100755 (executable)
@@ -1,43 +1,58 @@
 <html>
 <!--
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.5)
- * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.9)
+ * Copyright (C) 2015 The Jalview Authors
  * 
  * This file is part of Jalview.
  * 
  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
- * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
- * 
+ * as published by the Free Software Foundation, either version 3
+ * of the License, or (at your option) any later version.
+ *  
  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  * 
- * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ * You should have received a copy of the GNU General Public License
+ * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
+ -->
+<head>
+<title>Percentage Identity Colour Scheme</title>
+<style type="text/css">
+<!--
+td {
+       text-align: center;
+}
 -->
 </style>
 </head>
 
 <body>
-<p><em>PID Colours</em><br>
-  <br>
-  The PID option colours the residues (boxes and/or text) according to the percentage
-  of the residues in each column that agree with the consensus sequence. Only
-  the residues that agree with the consensus residue for each column are coloured.</p>
-<table width="200" border="1">
-  <tr>
-    <td bgcolor="#6464FF">&gt; 80 %</td>
-  </tr>
-  <tr>
-    <td bgcolor="#9999FF">&gt; 60 %</td>
-  </tr>
-  <tr>
-    <td bgcolor="#CCCCFF">&gt; 40%</td>
-  </tr>
-  <tr>
-    <td>&lt; 40%</td>
-  </tr>
-</table>
+  <p>
+    <strong>PID Colours</strong><br> <br> The PID option
+    colours the residues (boxes and/or text) according to the percentage
+    of the residues in each column that agree with the consensus
+    sequence. Only the residues that agree with the consensus residue
+    for each column are coloured.
+  </p>
+  <div align="center">
+    <table width="200" border="1">
+      <tr>
+        <td bgcolor="#6464FF">&gt; 80 %</td>
+      </tr>
+      <tr>
+        <td bgcolor="#9999FF">&gt; 60 %</td>
+      </tr>
+      <tr>
+        <td bgcolor="#CCCCFF">&gt; 40%</td>
+      </tr>
+      <tr>
+        <td>&lt; 40%</td>
+      </tr>
+    </table>
+  </div>
 </body>
 </html>