git://source.jalview.org / jalview.git / blobdiff
? search:
summary | shortlog | log | commit | commitdiff | tree
raw | inline | side by side
get the html header comment right!
[jalview.git] / help / html / features / seqmappings.html
diff --git a/help/html/features/seqmappings.html b/help/html/features/seqmappings.html
index 46fcd59..f2a9dbd 100644 (file)
--- a/help/html/features/seqmappings.html
+++ b/help/html/features/seqmappings.html
@@ -1,13 +1,29 @@
-<html>
+<html>\r
+<!--\r
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.5)\r
+ * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle\r
+ * \r
+ * This file is part of Jalview.\r
+ * \r
+ * Jalview is free software: you can redistribute it and/or\r
+ * modify it under the terms of the GNU General Public License \r
+ * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.\r
+ * \r
+ * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but \r
+ * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty \r
+ * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR \r
+ * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.\r
+ * \r
+ * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.\r
+-->
 <head>\r
 <title>Mapping Between Different Sequences</title>\r
 </head>\r
-<body>
+<body>\r
 <p><strong>Mapping Between Different Sequences</strong></p>\r
-<p>A new feature in Jalview 2.8 is the ability to map \r
-between sequences in different domains, based on alignment, \r
-or by the use of explicit mappings provided by databases.\r
-</p>\r
+<p>A new feature in Jalview 2.3 is the ability to map between sequences in different \r
+  domains, based on alignment, or by the use of explicit mappings provided by \r
+  databases. </p>\r
 <p>The most familiar mapping is the one used to identify\r
 the coordinates corresponding to a displayed sequence when\r
 viewing a PDB file associated with a sequence (see \r
@@ -16,7 +32,8 @@ for more information.</p>
 <p>The newest form of mapping supported by Jalview is the \r
 correspondence between DNA and protein sequences. This mapping\r
 can be imported directly from EMBL and EMBLCDS database records \r
-retrieved by the <a href="seqfetch.html">Sequence Fetcher</a>,\r
-or by the definition of <a href="codingfeatures.html">coding regions</a>. \r
-</body>
-</html>
\ No newline at end of file
+retrieved by the <a href="seqfetch.html">Sequence Fetcher</a>, \r
+and allows sequence features to be mapped directly from Uniprot \r
+das sources to their coding region on EMBL sequence records.\r
+</body>\r
+</html>\r