JAL-1683 replace year/version strings with tokens in source
[jalview.git] / help / html / memory.html
index 857c29a..f35c457 100755 (executable)
@@ -1,21 +1,24 @@
 <html>
 <!--
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.6.1)
- * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
+ * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
  * 
  * This file is part of Jalview.
  * 
  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
- * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
- * 
+ * as published by the Free Software Foundation, either version 3
+ * of the License, or (at your option) any later version.
+ *  
  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  * 
- * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
--->
+ * You should have received a copy of the GNU General Public License
+ * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
+ -->
 <head><title>Memory Settings</title></head>
 <body>
 <h2>
 The way you increase the memory settings for the JVM depends on which installation
   of Jalview you use:</p>
 <ul>
-  <li><em><font size="3">Web Start Version</font></em>
-    <p>JavaWS sets the JVM parameters through special tags in the JNLP file. You'll
-      need to <a href="jalviewjnlp.html">make your own jnlp file</a> and add the following parameter into the
-      &lt;resources&gt; element.
-    <pre>
-&lt;j2se version="1.5+" initial-heap-size="500M" max-heap-size="1000M"/&gt;
-</pre>
-    Save the jnlp file somewhere and then - if you start Jalview through your
-    web browser, point your browser at the file's url, othewise simply run javaws
-    with the file location as its argument. The file's url is something like :<br>
-    <pre>
+               <li><em><font size="3">Web Start Version</font></em>
+                       <p>
+                               JavaWS sets the JVM parameters through special tags in the JNLP
+                               file. You can obtain a JNLP file with modified memory settings from
+                               our service with the following link (replace 2G with desired memory
+                               in G or M):<br /> <a
+                                       href="http://www.jalview.org/services/launchApp?jvm-max-heap=2G">http://www.jalview.org/services/launchApp?jvm-max-heap=2G</a>
+                       </p>
+                       <p>
+                               Alternatively, if you want to create your own JNLP file then please
+                               download the latest JNLP file from <a
+                                       href="http://www.jalview.org/webstart/jalview.jnlp">http://www.jalview.org/webstart/jalview.jnlp</a>
+                               and modify the max-heap-size parameter for the j2se tag in the
+                               &lt;resources&gt; element. e.g.
+                       <pre>
+&lt;j2se version="1.7+" initial-heap-size="500M" max-heap-size="1000M"/&gt;
+</pre> In both cases, you should save your new jnlp file somewhere and
+                       then either point your web browser at the file's url, launch it from
+                       your file browser, or from a terminal window run javaws (located in
+                       your Java installation's bin directory) with the file location as its
+                       argument. The file's url is something like :<br> <pre>
 file://&lt;full path to file&gt;
-</pre>
-    If jalview doesn't start up, see <a href="#memsetting">below</a>. You'll have
-    to edit the above settings in the JNLP file using a text editor, save it,
-    and try starting Jalview with it once more.
-    <p></li>
-  <li><em><font size="3">Install Anywhere version</font></em>
+</pre> If jalview doesn't start up, see <a href="#memsetting">below</a>.
+                       You'll have to edit the above settings in the JNLP file using a text
+                       editor, save it, and try starting Jalview with it once more.
+                       </p></li>
+               <li><em><font size="3">Install Anywhere version</font></em>
     <p> You need to change the InstallAnywhere configuration settings for the
       application. These are found in different places depending upon which operating
       system you have :