update author list in license for (JAL-826)
[jalview.git] / help / html / menus / popupMenu.html
index af20b39..19dd51a 100755 (executable)
@@ -1,4 +1,21 @@
 <html>
+<!--
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)
+ * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle
+ * 
+ * This file is part of Jalview.
+ * 
+ * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
+ * modify it under the terms of the GNU General Public License 
+ * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
+ * 
+ * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
+ * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
+ * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
+ * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
+ * 
+ * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+-->
 <head>
 <title>Popup Menu</title>
 </head>
@@ -71,7 +88,8 @@ not be accessible when in 'Cursor Mode' (toggled with the F2 key).</em></p>
        </em></li>
                    </ul>
       </li>
-      <li><strong>Group Links<br>
+<!-- not available in 2.5 yet
+    <li><strong>Group Links<br>
     </strong><em>This menu is only visible if there are group links available for the current selection.
     </em> 
     <ul>
@@ -79,8 +97,8 @@ not be accessible when in 'Cursor Mode' (toggled with the F2 key).</em></p>
     <li><em>Sequence links</em> allow you to send the sequences in the currently selected region to a web server.</li>
     <li><em>Sequence and ID links</em> allow you to send sets of IDs and sequences associated with the current selection to a web server.</li>
     </ul>
-    <em>Group Links were added in Jalview 2.4.1</em></li>
-    </ul>
+    <em>Group Links were added in Jalview 2.5</em></li>
+-->    </ul>
   </li>
   <li><strong>Sequence Id<br>
     </strong><em>This menu is only visible if you right-click on a sequence name. 
@@ -101,7 +119,7 @@ not be accessible when in 'Cursor Mode' (toggled with the F2 key).</em></p>
         Connections tab.<br>
         Since Jalview 2.4, links will also be made for database cross 
         references (where the database name exactly matches the link name set up in <a href="../features/preferences.html">Preferences</a>).
-        <br>Since Jalview 2.4.1, links are also shown for non-positional sequence features attached to 
+        <br>Since Jalview 2.5, links are also shown for non-positional sequence features attached to 
         the sequence, and any regular-expression based URL links that 
         matched the description line.
         </em><strong><br>
@@ -132,8 +150,8 @@ not be accessible when in 'Cursor Mode' (toggled with the F2 key).</em></p>
       </li>
       <li><strong>View Structure<br>
         </strong><em> If the sequence has an associated PDB file added by one 
-        of the methods described above, Jalview will display a 3D interactive 
-        viewer of the file.<br>
+        of the methods described above, Jalview will open a 3D interactive 
+        view of the file.<br>
         These entries will only be present if the sequence has <a
                        href="../features/viewingpdbs.html">associated PDB structures</a>.</em><br>
       </li>