JAL-2675 release notes entry for 2.10.2b1, updated what’s new and link to latest...
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index 23cfb84..485cf73 100755 (executable)
@@ -70,6 +70,24 @@ li:before {
     <tr>
       <td width="60" nowrap>
         <div align="center">
+          <strong><a name="Jalview.2.10.2b1">2.10.2b1</a><br />
+            <em>TBA</em></strong>
+        </div>
+      </td>
+      <td><div align="left">
+          <em></em>
+          <ul>
+          </ul>
+        </div></td>
+      <td><div align="left">
+          <em></em>
+          <ul>
+          </ul>
+        </div></td>
+    
+    <tr>
+      <td width="60" nowrap>
+        <div align="center">
           <strong><a name="Jalview.2.10.2">2.10.2</a><br /> <em>17/8/2017</em></strong>
         </div>
       </td>
@@ -122,10 +140,6 @@ li:before {
               with alignment and overview windows
             </li>
             <li>
-              <!--  JAL-2491 -->Linked scrolling of CDS/Protein views
-              via Overview or sequence motif search operations
-            </li>
-            <li>
               <!-- JAL-2514 -->Scrolling of wrapped alignment views via
               overview
             </li>
@@ -167,6 +181,10 @@ li:before {
               the application.
             </li>
             <li>
+              <!--  JAL-2491 -->Linked scrolling of CDS/Protein views
+              via Overview or sequence motif search operations
+            </li>
+            <li>
               <!-- JAL-2547 -->Amend sequence features dialog box can be
               opened by double clicking gaps within sequence feature
               extent
@@ -180,6 +198,10 @@ li:before {
           <em>3D Structure</em>
           <ul>
             <li>
+              <!-- JAL-2430 -->Hidden regions in alignment views are not
+              coloured in linked structure views
+            </li>
+            <li>
               <!-- JAL-1596 -->Faster Chimera/Jalview communication by
               file-based command exchange
             </li>
@@ -197,7 +219,7 @@ li:before {
               <!-- JAL-2295, JAL-2296 -->New entries in the Chimera menu
               to transfer Chimera's structure attributes as Jalview
               features, and vice-versa (<strong>Experimental
-                Feauture</strong>)
+                Feature</strong>)
             </li>
           </ul>
           <em>Web Services</em>
@@ -237,7 +259,7 @@ li:before {
           <em>Documentation</em>
           <ul>
             <li>
-              <!-- JAL-2339 -->Release notes reformatted for readibility
+              <!-- JAL-2339 -->Release notes reformatted for readability
               with the built-in Java help viewer
             </li>
             <li>
@@ -268,7 +290,7 @@ li:before {
               matrix - C->R should be '-3'<br />Old matrix restored
               with this one-line groovy script:<br />jalview.analysis.scoremodels.ScoreModels.instance.BLOSUM62.@matrix[4][1]=3
             </li>
-            <li>
+            <li><a name="2102scoremodelbugs"/>
               <!-- JAL-2397 -->Fixed Jalview's treatment of gaps in PCA
               and substitution matrix based Tree calculations.<br /> <br />In
               earlier versions of Jalview, gaps matching gaps were
@@ -418,10 +440,6 @@ li:before {
           <em>Rendering</em>
           <ul>
             <li>
-              <!-- JAL-2430 -->Hidden regions in alignment views are not
-              coloured in linked structure views
-            </li>
-            <li>
               <!-- JAL-2421 -->Overview window visible region moves
               erratically when hidden rows or columns are present
             </li>
@@ -627,11 +645,11 @@ li:before {
             <li>
               <!-- JAL-2550 -->Importing annotation file with rows
               containing just upper and lower case letters are
-              interpreted as WUSS rna secondary structure symbols
+              interpreted as WUSS RNA secondary structure symbols
             </li>
             <li>
-              <!-- JAL-2590 -->Cannot load Newick trees from eggnog
-              ortholog database
+              <!-- JAL-2590 -->Cannot load and display Newick trees
+              reliably from eggnog Ortholog database
             </li>
             <li>
               <!-- JAL-2468 -->Status bar shows 'Marked x columns