git://source.jalview.org / jalview.git / blobdiff
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update author list in license for (JAL-826)
[jalview.git] / help / html / webServices / dbreffetcher.html
diff --git a/help/html/webServices/dbreffetcher.html b/help/html/webServices/dbreffetcher.html
index 516f106..39c499f 100644 (file)
--- a/help/html/webServices/dbreffetcher.html
+++ b/help/html/webServices/dbreffetcher.html
@@ -1,4 +1,21 @@
 <!DOCTYPE html SYSTEM "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">\r
+<!--\r
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)\r
+ * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle\r
+ * \r
+ * This file is part of Jalview.\r
+ * \r
+ * Jalview is free software: you can redistribute it and/or\r
+ * modify it under the terms of the GNU General Public License \r
+ * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.\r
+ * \r
+ * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but \r
+ * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty \r
+ * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR \r
+ * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.\r
+ * \r
+ * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.\r
+-->\r
 <html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml">\r
 <head>\r
 Database Reference Fetching\r
@@ -15,7 +32,9 @@ DNA sequence.</p>
 <p><strong>Initiating reference retrieval</strong><br>\r
 The application provides three ways to access the retrieval function. Either:\r
 <ul><li>select the <strong>Discover PDB IDs</strong> option from the structure submenu of the sequence's popup menu</li>\r
-<li>Select one of the options from the alignment window's <strong>Web Services</strong> menu to fetch references from either the EBI databases plus currently selected DAS sources, or an individual database source</li>\r
+<li>Choose one of the options from the 'Fetch DB Refs' submenu in the alignment window's <strong>Web Services</strong> menu:<ul>\r
+<li><em>Standard Databases</em> will fetch references from the EBI databases plus currently selected DAS sources</li>\r
+<li>The other entries submenus leading to lists of individual database sources that Jalview can access.</li></ul></li>\r
 <li>Answer 'Yes' when asked if you wish to retrieve database references for your sequences after initiating a DAS Sequence Feature fetch.</li>\r
 </ul> \r
 <p>Jalview discovers references for a sequence by generating a set\r
@@ -55,4 +74,4 @@ Name</strong>).
        retrieval process.</li>\r
 </ul>\r
 <body></body>\r
-</html>
\ No newline at end of file
+</html>\r