Formatted source
[jalview.git] / src / jalview / datamodel / HistoryItem.java
index bb18b66..ed119e8 100755 (executable)
 * along with this program; if not, write to the Free Software\r
 * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
 */\r
-\r
 package jalview.datamodel;\r
 \r
 import java.util.*;\r
 \r
-public class HistoryItem\r
-{\r
-  public static final int EDIT = 0;\r
-  public static final int SORT = 1;\r
-  public static final int HIDE = 2;\r
-  public static final int PASTE= 3;\r
 \r
-  final int type;\r
-  Vector sequences;\r
-  Vector alignIndex;\r
-  String description;\r
-  Vector hiddenSeqs;\r
+public class HistoryItem {\r
+    public static final int EDIT = 0;\r
+    public static final int SORT = 1;\r
+    public static final int HIDE = 2;\r
+    public static final int PASTE = 3;\r
+    final int type;\r
+    Vector sequences;\r
+    Vector alignIndex;\r
+    String description;\r
+    Vector hiddenSeqs;\r
 \r
-  public HistoryItem(String description, AlignmentI al, int type)\r
-  {\r
-    this.type = type;\r
-    this.description = description;\r
-    sequences = new Vector();\r
-    alignIndex = new Vector();\r
-    hiddenSeqs = new Vector();\r
+    public HistoryItem(String description, AlignmentI al, int type) {\r
+        this.type = type;\r
+        this.description = description;\r
+        sequences = new Vector();\r
+        alignIndex = new Vector();\r
+        hiddenSeqs = new Vector();\r
 \r
-    for (int i = 0; i < al.getHeight(); i++)\r
-    {\r
-      SequenceI seq = al.getSequenceAt(i);\r
-      sequences.addElement(seq);\r
-      alignIndex.addElement(i + "");\r
-      hiddenSeqs.addElement(seq.getSequence().toString());\r
+        for (int i = 0; i < al.getHeight(); i++) {\r
+            SequenceI seq = al.getSequenceAt(i);\r
+            sequences.addElement(seq);\r
+            alignIndex.addElement(i + "");\r
+            hiddenSeqs.addElement(seq.getSequence().toString());\r
+        }\r
     }\r
-  }\r
-\r
-  public int getType()\r
-  {return type;}\r
 \r
-  public Vector getSequences()\r
-  {return sequences;}\r
+    public int getType() {\r
+        return type;\r
+    }\r
 \r
-  public String getDescription()\r
-  {return description; }\r
+    public Vector getSequences() {\r
+        return sequences;\r
+    }\r
 \r
-  public Vector getHidden()\r
-  { return hiddenSeqs; }\r
+    public String getDescription() {\r
+        return description;\r
+    }\r
 \r
-  public int getAlignIndex(int seq)\r
-  {\r
-    return Integer.parseInt(alignIndex.elementAt(seq).toString());\r
-  }\r
+    public Vector getHidden() {\r
+        return hiddenSeqs;\r
+    }\r
 \r
+    public int getAlignIndex(int seq) {\r
+        return Integer.parseInt(alignIndex.elementAt(seq).toString());\r
+    }\r
 }\r