Jalview 2.6 source licence
[jalview.git] / src / jalview / gui / WebserviceInfo.java
index a0eeedf..4d0c634 100755 (executable)
@@ -1,20 +1,19 @@
 /*
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.4)
- * Copyright (C) 2008 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.6)
+ * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
  * 
- * This program is free software; you can redistribute it and/or
- * modify it under the terms of the GNU General Public License
- * as published by the Free Software Foundation; either version 2
- * of the License, or (at your option) any later version.
+ * This file is part of Jalview.
  * 
- * This program is distributed in the hope that it will be useful,
- * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
- * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
- * GNU General Public License for more details.
+ * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
+ * modify it under the terms of the GNU General Public License 
+ * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  * 
- * You should have received a copy of the GNU General Public License
- * along with this program; if not, write to the Free Software
- * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA
+ * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
+ * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
+ * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
+ * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
+ * 
+ * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  */
 package jalview.gui;
 
@@ -123,9 +122,9 @@ public class WebserviceInfo extends GWebserviceInfo
    * Creates a new WebserviceInfo object.
    * 
    * @param title
-   *                short name and job type
+   *          short name and job type
    * @param info
-   *                reference or other human readable description
+   *          reference or other human readable description
    */
   public WebserviceInfo(String title, String info)
   {
@@ -136,13 +135,13 @@ public class WebserviceInfo extends GWebserviceInfo
    * Creates a new WebserviceInfo object.
    * 
    * @param title
-   *                DOCUMENT ME!
+   *          DOCUMENT ME!
    * @param info
-   *                DOCUMENT ME!
+   *          DOCUMENT ME!
    * @param width
-   *                DOCUMENT ME!
+   *          DOCUMENT ME!
    * @param height
-   *                DOCUMENT ME!
+   *          DOCUMENT ME!
    */
   public WebserviceInfo(String title, String info, int width, int height)
   {
@@ -164,7 +163,7 @@ public class WebserviceInfo extends GWebserviceInfo
    * cancellable, whether the 'merge results' button is shown.
    * 
    * @param newservice
-   *                service client to query for capabilities
+   *          service client to query for capabilities
    */
   public void setthisService(jalview.ws.WSClientI newservice)
   {
@@ -196,13 +195,13 @@ public class WebserviceInfo extends GWebserviceInfo
    * DOCUMENT ME!
    * 
    * @param title
-   *                DOCUMENT ME!
+   *          DOCUMENT ME!
    * @param info
-   *                DOCUMENT ME!
+   *          DOCUMENT ME!
    * @param width
-   *                DOCUMENT ME!
+   *          DOCUMENT ME!
    * @param height
-   *                DOCUMENT ME!
+   *          DOCUMENT ME!
    */
   void init(String title, String info, int width, int height)
   {
@@ -233,20 +232,20 @@ public class WebserviceInfo extends GWebserviceInfo
     Thread thread = new Thread(ap);
     thread.start();
     final WebserviceInfo thisinfo = this;
-    frame
-            .addInternalFrameListener(new javax.swing.event.InternalFrameAdapter()
-            {
-              public void internalFrameClosed(
-                      javax.swing.event.InternalFrameEvent evt)
-              {
-                // System.out.println("Shutting down webservice client");
-                WSClientI service = thisinfo.getthisService();
-                if (service != null && service.isCancellable())
-                {
-                  service.cancelJob();
-                }
-              };
-            });
+    frame.addInternalFrameListener(new javax.swing.event.InternalFrameAdapter()
+    {
+      public void internalFrameClosed(
+              javax.swing.event.InternalFrameEvent evt)
+      {
+        // System.out.println("Shutting down webservice client");
+        WSClientI service = thisinfo.getthisService();
+        if (service != null && service.isCancellable())
+        {
+          service.cancelJob();
+        }
+      };
+    });
+    frame.validate();
 
   }
 
@@ -254,7 +253,7 @@ public class WebserviceInfo extends GWebserviceInfo
    * DOCUMENT ME!
    * 
    * @param status
-   *                integer status from state constants
+   *          integer status from state constants
    */
   public void setStatus(int status)
   {
@@ -313,7 +312,7 @@ public class WebserviceInfo extends GWebserviceInfo
    * DOCUMENT ME!
    * 
    * @param text
-   *                DOCUMENT ME!
+   *          DOCUMENT ME!
    */
   public void setInfoText(String text)
   {
@@ -324,7 +323,7 @@ public class WebserviceInfo extends GWebserviceInfo
    * DOCUMENT ME!
    * 
    * @param text
-   *                DOCUMENT ME!
+   *          DOCUMENT ME!
    */
   public void appendInfoText(String text)
   {
@@ -350,7 +349,7 @@ public class WebserviceInfo extends GWebserviceInfo
    * DOCUMENT ME!
    * 
    * @param text
-   *                DOCUMENT ME!
+   *          DOCUMENT ME!
    */
   public void setProgressText(int which, String text)
   {
@@ -366,7 +365,7 @@ public class WebserviceInfo extends GWebserviceInfo
    * DOCUMENT ME!
    * 
    * @param text
-   *                DOCUMENT ME!
+   *          DOCUMENT ME!
    */
   public void appendProgressText(int which, String text)
   {
@@ -406,7 +405,7 @@ public class WebserviceInfo extends GWebserviceInfo
    * get the tab title for a subjob
    * 
    * @param which
-   *                int
+   *          int
    * @return String
    */
   public String getProgressName(int which)
@@ -430,9 +429,9 @@ public class WebserviceInfo extends GWebserviceInfo
    * set the tab title for a subjob
    * 
    * @param name
-   *                String
+   *          String
    * @param which
-   *                int
+   *          int
    */
   public void setProgressName(String name, int which)
   {
@@ -451,7 +450,7 @@ public class WebserviceInfo extends GWebserviceInfo
    * Gui action for cancelling the current job, if possible.
    * 
    * @param e
-   *                DOCUMENT ME!
+   *          DOCUMENT ME!
    */
   protected void cancel_actionPerformed(ActionEvent e)
   {
@@ -461,9 +460,8 @@ public class WebserviceInfo extends GWebserviceInfo
       // anyhow - it has to stop threads and clean up
       // JBPNote : TODO: Instead of a warning, we should have an optional 'Are
       // you sure?' prompt
-      JOptionPane.showInternalMessageDialog(Desktop.desktop,
-              "This job cannot be cancelled.\nJust close the window.",
-              "Cancel job", JOptionPane.WARNING_MESSAGE);
+      warnUser("This job cannot be cancelled.\nJust close the window.",
+              "Cancel job");
     }
     else
     {
@@ -473,6 +471,26 @@ public class WebserviceInfo extends GWebserviceInfo
   }
 
   /**
+   * Spawns a thread that pops up a warning dialog box with the given message
+   * and title.
+   * 
+   * @param message
+   * @param title
+   */
+  public void warnUser(final String message, final String title)
+  {
+    javax.swing.SwingUtilities.invokeLater(new Runnable()
+    {
+      public void run()
+      {
+        JOptionPane.showInternalMessageDialog(Desktop.desktop, message,
+                title, JOptionPane.WARNING_MESSAGE);
+
+      }
+    });
+  }
+
+  /**
    * Set up GUI for user to get at results - and possibly automatically display
    * them if viewResultsImmediatly is set.
    */