update author list in license for (JAL-826)
[jalview.git] / src / jalview / io / AppletFormatAdapter.java
index d42157b..0709a2f 100755 (executable)
@@ -1,6 +1,6 @@
 /*
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.6)
- * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)
+ * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle
  * 
  * This file is part of Jalview.
  * 
@@ -67,7 +67,7 @@ public class AppletFormatAdapter
    */
   public static final String[] READABLE_EXTENSIONS = new String[]
   { "fa, fasta, fastq", "aln", "pfam", "msf", "pir", "blc", "amsa", "jar",
-      "sto" }; // ,
+      "sto,stk" }; // ,
 
   // ".blast"
   // };
@@ -477,8 +477,8 @@ public class AppletFormatAdapter
   public static String checkProtocol(String file)
   {
     String protocol = FILE;
-  
-    if (file.indexOf("http:") > -1 || file.indexOf("file:") > -1)
+    String ft = file.toLowerCase().trim();
+    if (ft.indexOf("http:") ==0 || ft.indexOf("https:") ==0 || ft.indexOf("file:") == 0)
     {
       protocol = URL;
     }