update author list in license for (JAL-826)
[jalview.git] / src / jalview / io / JalviewFileFilter.java
index 3252a98..fad3dab 100755 (executable)
-/*\r
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
- * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
- *\r
- * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
- * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
- * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
- * of the License, or (at your option) any later version.\r
- *\r
- * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
- * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
- * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
- * GNU General Public License for more details.\r
- *\r
- * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
- * along with this program; if not, write to the Free Software\r
- * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
- */\r
-package jalview.io;\r
-\r
-import java.io.*;\r
-import java.util.*;\r
-\r
-import javax.swing.filechooser.FileFilter;\r
-\r
-public class JalviewFileFilter\r
-    extends FileFilter\r
-{\r
-  public static Hashtable suffixHash = new Hashtable();\r
-  private Hashtable filters = null;\r
-  private String description = "no description";\r
-  private String fullDescription = "full description";\r
-  private boolean useExtensionsInDescription = true;\r
-\r
-  public JalviewFileFilter(String extension, String description)\r
-  {\r
-    StringTokenizer st = new StringTokenizer(extension, ",");\r
-\r
-    while (st.hasMoreElements())\r
-    {\r
-      addExtension(st.nextToken().trim());\r
-    }\r
-\r
-    setDescription(description);\r
-  }\r
-\r
-  public JalviewFileFilter(String[] filts)\r
-  {\r
-    this(filts, null);\r
-  }\r
-\r
-  public JalviewFileFilter(String[] filts, String description)\r
-  {\r
-    for (int i = 0; i < filts.length; i++)\r
-    {\r
-      // add filters one by one\r
-      addExtension(filts[i]);\r
-    }\r
-\r
-    if (description != null)\r
-    {\r
-      setDescription(description);\r
-    }\r
-  }\r
-\r
-  public String getAcceptableExtension()\r
-  {\r
-    return filters.keys().nextElement().toString();\r
-  }\r
-\r
-  // takes account of the fact that database is a directory\r
-  public boolean accept(File f)\r
-  {\r
-    if (f != null)\r
-    {\r
-      String extension = getExtension(f);\r
-\r
-      if (f.isDirectory())\r
-      {\r
-          return true;\r
-      }\r
-\r
-      if ( (extension != null) && (filters.get(getExtension(f)) != null))\r
-      {\r
-        return true;\r
-      }\r
-    }\r
-\r
-    return false;\r
-  }\r
-\r
-  public String getExtension(File f)\r
-  {\r
-    if (f != null)\r
-    {\r
-      String filename = f.getName();\r
-      int i = filename.lastIndexOf('.');\r
-\r
-      if ( (i > 0) && (i < (filename.length() - 1)))\r
-      {\r
-        return filename.substring(i + 1).toLowerCase();\r
-      }\r
-\r
-      ;\r
-    }\r
-\r
-    return "";\r
-  }\r
-\r
-  public void addExtension(String extension)\r
-  {\r
-    if (filters == null)\r
-    {\r
-      filters = new Hashtable(5);\r
-    }\r
-\r
-    filters.put(extension.toLowerCase(), this);\r
-    fullDescription = null;\r
-  }\r
-\r
-  public String getDescription()\r
-  {\r
-    if (fullDescription == null)\r
-    {\r
-      if ( (description == null) || isExtensionListInDescription())\r
-      {\r
-        fullDescription = (description == null) ? "(" : (description +\r
-            " (");\r
-\r
-        // build the description from the extension list\r
-        Enumeration extensions = filters.keys();\r
-\r
-        if (extensions != null)\r
-        {\r
-          fullDescription += ("." +\r
-                              (String) extensions.nextElement());\r
-\r
-          while (extensions.hasMoreElements())\r
-          {\r
-            fullDescription += (", " +\r
-                                (String) extensions.nextElement());\r
-          }\r
-        }\r
-\r
-        fullDescription += ")";\r
-      }\r
-      else\r
-      {\r
-        fullDescription = description;\r
-      }\r
-    }\r
-\r
-    return fullDescription;\r
-  }\r
-\r
-  public void setDescription(String description)\r
-  {\r
-    this.description = description;\r
-    fullDescription = null;\r
-  }\r
-\r
-  public void setExtensionListInDescription(boolean b)\r
-  {\r
-    useExtensionsInDescription = b;\r
-    fullDescription = null;\r
-  }\r
-\r
-  public boolean isExtensionListInDescription()\r
-  {\r
-    return useExtensionsInDescription;\r
-  }\r
-}\r
+/*
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)
+ * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle
+ * 
+ * This file is part of Jalview.
+ * 
+ * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
+ * modify it under the terms of the GNU General Public License 
+ * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
+ * 
+ * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
+ * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
+ * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
+ * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
+ * 
+ * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ */
+package jalview.io;
+
+import java.io.*;
+import java.util.*;
+
+import javax.swing.filechooser.FileFilter;
+
+public class JalviewFileFilter extends FileFilter
+{
+  public static Hashtable suffixHash = new Hashtable();
+
+  private Hashtable filters = null;
+
+  private String description = "no description";
+
+  private String fullDescription = "full description";
+
+  private boolean useExtensionsInDescription = true;
+
+  public JalviewFileFilter(String extension, String description)
+  {
+    StringTokenizer st = new StringTokenizer(extension, ",");
+
+    while (st.hasMoreElements())
+    {
+      addExtension(st.nextToken().trim());
+    }
+
+    setDescription(description);
+  }
+
+  public JalviewFileFilter(String[] filts)
+  {
+    this(filts, null);
+  }
+
+  public JalviewFileFilter(String[] filts, String description)
+  {
+    for (int i = 0; i < filts.length; i++)
+    {
+      // add filters one by one
+      addExtension(filts[i]);
+    }
+
+    if (description != null)
+    {
+      setDescription(description);
+    }
+  }
+
+  public String getAcceptableExtension()
+  {
+    return filters.keys().nextElement().toString();
+  }
+
+  // takes account of the fact that database is a directory
+  public boolean accept(File f)
+  {
+    if (f != null)
+    {
+      String extension = getExtension(f);
+
+      if (f.isDirectory())
+      {
+        return true;
+      }
+
+      if ((extension != null) && (filters.get(getExtension(f)) != null))
+      {
+        return true;
+      }
+    }
+
+    return false;
+  }
+
+  public String getExtension(File f)
+  {
+    if (f != null)
+    {
+      String filename = f.getName();
+      int i = filename.lastIndexOf('.');
+
+      if ((i > 0) && (i < (filename.length() - 1)))
+      {
+        return filename.substring(i + 1).toLowerCase();
+      }
+
+      ;
+    }
+
+    return "";
+  }
+
+  public void addExtension(String extension)
+  {
+    if (filters == null)
+    {
+      filters = new Hashtable(5);
+    }
+
+    filters.put(extension.toLowerCase(), this);
+    fullDescription = null;
+  }
+
+  public String getDescription()
+  {
+    if (fullDescription == null)
+    {
+      if ((description == null) || isExtensionListInDescription())
+      {
+        fullDescription = (description == null) ? "("
+                : (description + " (");
+
+        // build the description from the extension list
+        Enumeration extensions = filters.keys();
+
+        if (extensions != null)
+        {
+          fullDescription += ("." + (String) extensions.nextElement());
+
+          while (extensions.hasMoreElements())
+          {
+            fullDescription += (", " + (String) extensions.nextElement());
+          }
+        }
+
+        fullDescription += ")";
+      }
+      else
+      {
+        fullDescription = description;
+      }
+    }
+
+    return fullDescription;
+  }
+
+  public void setDescription(String description)
+  {
+    this.description = description;
+    fullDescription = null;
+  }
+
+  public void setExtensionListInDescription(boolean b)
+  {
+    useExtensionsInDescription = b;
+    fullDescription = null;
+  }
+
+  public boolean isExtensionListInDescription()
+  {
+    return useExtensionsInDescription;
+  }
+}