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[jalview.git] / src / jalview / io / NewickFile.java
index 8e374ac..769f9bd 100755 (executable)
@@ -1,6 +1,6 @@
 /*
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.5)
- * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)
+ * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle
  * 
  * This file is part of Jalview.
  * 
@@ -215,8 +215,8 @@ public class NewickFile extends FileParse
             + " at position "
             + p
             + " ( "
-            + s.substring(((p - r) < 0) ? 0 : (p - r), ((p + r) > s
-                    .length()) ? s.length() : (p + r)) + " )\n";
+            + s.substring(((p - r) < 0) ? 0 : (p - r),
+                    ((p + r) > s.length()) ? s.length() : (p + r)) + " )\n";
   }
 
   // @tree annotations
@@ -470,8 +470,8 @@ public class NewickFile extends FileParse
             } catch (Exception e)
             {
               Error = ErrorStringrange(Error,
-                      "Can't parse bootstrap value", 4, ncp
-                              + nbootstrap.matchedFrom(), nf);
+                      "Can't parse bootstrap value", 4,
+                      ncp + nbootstrap.matchedFrom(), nf);
             }
           }
         }
@@ -488,8 +488,8 @@ public class NewickFile extends FileParse
           } catch (Exception e)
           {
             Error = ErrorStringrange(Error,
-                    "Can't parse node distance value", 7, ncp
-                            + ndist.matchedFrom(), nf);
+                    "Can't parse node distance value", 7,
+                    ncp + ndist.matchedFrom(), nf);
           }
         }