JAL-2418 source formatting
[jalview.git] / src / jalview / json / binding / biojson / v1 / SequencePojo.java
index 112a54b..56e9bcb 100644 (file)
@@ -1,6 +1,6 @@
 /*
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.9)
- * Copyright (C) 2015 The Jalview Authors
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
+ * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
  * 
  * This file is part of Jalview.
  * 
@@ -28,14 +28,17 @@ public class SequencePojo
     required = true,
     minLength = 3,
     maxLength = 2147483647,
-    description = "Sequence residue characters. An aligned sequence may contain <br>one of the following gap characters â\80\9c\80?, â\80\9c\80? or â\80\9c â\80?")
+    description = "Sequence residue characters. An aligned sequence may contain <br>one of the following gap characters &#x201c;.&#x201d;, &#x201c;-&#x201d; or &#x201c;&nbsp;&#x201d;")
   private String seq;
 
   @Attributes(required = true, description = "Sequence name")
   private String name;
 
-  @Attributes(required = false, description = "Sequence type", enums = {
-      "DNA", "RNA", "Protein" })
+  @Attributes(
+    required = false,
+    description = "Sequence type",
+    enums =
+    { "DNA", "RNA", "Protein" })
   private String type;
 
   @Attributes(
@@ -62,7 +65,8 @@ public class SequencePojo
   {
   }
 
-  public SequencePojo(int start, int end, String id, String name, String seq)
+  public SequencePojo(int start, int end, String id, String name,
+          String seq)
   {
     this.id = id;
     this.name = name;