JAL-1551 spotlessApply
[jalview.git] / src / jalview / renderer / ContactGeometry.java
index ad741ff..9fd4de6 100644 (file)
@@ -16,9 +16,9 @@ import jalview.renderer.ContactGeometry.contactInterval;
  */
 public class ContactGeometry
 {
-  
+
   final ContactListI contacts;
-  
+
   final int pixels_step;
 
   final double contacts_per_pixel;
@@ -29,7 +29,7 @@ public class ContactGeometry
 
   public ContactGeometry(final ContactListI contacts, int graphHeight)
   {
-    this.contacts=contacts;
+    this.contacts = contacts;
     this.graphHeight = graphHeight;
     contact_height = contacts.getContactHeight();
     // fractional number of contacts covering each pixel
@@ -70,14 +70,18 @@ public class ContactGeometry
     public final int pEnd;
 
   }
+
   /**
    * 
    * @param columnSelection
    * @param ci
-   * @param visibleOnly - when true, only test intersection of visible columns given matrix range 
-   * @return true if the range on the matrix specified by ci intersects with selected columns in the ContactListI's reference frame.
+   * @param visibleOnly
+   *          - when true, only test intersection of visible columns given
+   *          matrix range
+   * @return true if the range on the matrix specified by ci intersects with
+   *         selected columns in the ContactListI's reference frame.
    */
-  
+
   boolean intersects(contactInterval ci, ColumnSelection columnSelection,
           HiddenColumns hiddenColumns, boolean visibleOnly)
   {