fixes JAL-778 - flag to indicate binding between an alignment panel and Jmol view...
[jalview.git] / src / jalview / schemabinding / version2 / Mapping.java
index 5ae5031..8dbc12f 100644 (file)
@@ -1,24 +1,14 @@
 /*\r
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.6)\r
- * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle\r
- * \r
- * This file is part of Jalview.\r
- * \r
- * Jalview is free software: you can redistribute it and/or\r
- * modify it under the terms of the GNU General Public License \r
- * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.\r
- * \r
- * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but \r
- * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty \r
- * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR \r
- * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.\r
- * \r
- * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.\r
+ * This class was automatically generated with \r
+ * <a href="http://www.castor.org">Castor 1.1</a>, using an XML\r
+ * Schema.\r
+ * $Id$\r
  */\r
+\r
 package jalview.schemabinding.version2;\r
 \r
-//---------------------------------/\r
-//- Imported classes and packages -/\r
+  //---------------------------------/\r
+ //- Imported classes and packages -/\r
 //---------------------------------/\r
 \r
 import org.exolab.castor.xml.Marshaller;\r
@@ -29,155 +19,147 @@ import org.exolab.castor.xml.Unmarshaller;
  * \r
  * @version $Revision$ $Date$\r
  */\r
-public class Mapping extends jalview.schemabinding.version2.MapListType\r
-        implements java.io.Serializable\r
+public class Mapping extends jalview.schemabinding.version2.MapListType \r
+implements java.io.Serializable\r
 {\r
 \r
-  // --------------------------/\r
-  // - Class/Member Variables -/\r
-  // --------------------------/\r
-\r
-  /**\r
-   * Internal choice value storage\r
-   */\r
-  private java.lang.Object _choiceValue;\r
-\r
-  /**\r
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-   */\r
-  private jalview.schemabinding.version2.MappingChoice _mappingChoice;\r
-\r
-  // ----------------/\r
-  // - Constructors -/\r
-  // ----------------/\r
-\r
-  public Mapping()\r
-  {\r
-    super();\r
-  }\r
-\r
-  // -----------/\r
-  // - Methods -/\r
-  // -----------/\r
-\r
-  /**\r
-   * Returns the value of field 'choiceValue'. The field 'choiceValue' has the\r
-   * following description: Internal choice value storage\r
-   * \r
-   * @return the value of field 'ChoiceValue'.\r
-   */\r
-  public java.lang.Object getChoiceValue()\r
-  {\r
-    return this._choiceValue;\r
-  }\r
-\r
-  /**\r
-   * Returns the value of field 'mappingChoice'.\r
-   * \r
-   * @return the value of field 'MappingChoice'.\r
-   */\r
-  public jalview.schemabinding.version2.MappingChoice getMappingChoice()\r
-  {\r
-    return this._mappingChoice;\r
-  }\r
-\r
-  /**\r
-   * Method isValid.\r
-   * \r
-   * @return true if this object is valid according to the schema\r
-   */\r
-  public boolean isValid()\r
-  {\r
-    try\r
-    {\r
-      validate();\r
-    } catch (org.exolab.castor.xml.ValidationException vex)\r
-    {\r
-      return false;\r
+\r
+      //--------------------------/\r
+     //- Class/Member Variables -/\r
+    //--------------------------/\r
+\r
+    /**\r
+     * Internal choice value storage\r
+     */\r
+    private java.lang.Object _choiceValue;\r
+\r
+    /**\r
+     * Field _mappingChoice.\r
+     */\r
+    private jalview.schemabinding.version2.MappingChoice _mappingChoice;\r
+\r
+\r
+      //----------------/\r
+     //- Constructors -/\r
+    //----------------/\r
+\r
+    public Mapping() {\r
+        super();\r
+    }\r
+\r
+\r
+      //-----------/\r
+     //- Methods -/\r
+    //-----------/\r
+\r
+    /**\r
+     * Returns the value of field 'choiceValue'. The field\r
+     * 'choiceValue' has the following description: Internal choice\r
+     * value storage\r
+     * \r
+     * @return the value of field 'ChoiceValue'.\r
+     */\r
+    public java.lang.Object getChoiceValue(\r
+    ) {\r
+        return this._choiceValue;\r
+    }\r
+\r
+    /**\r
+     * Returns the value of field 'mappingChoice'.\r
+     * \r
+     * @return the value of field 'MappingChoice'.\r
+     */\r
+    public jalview.schemabinding.version2.MappingChoice getMappingChoice(\r
+    ) {\r
+        return this._mappingChoice;\r
+    }\r
+\r
+    /**\r
+     * Method isValid.\r
+     * \r
+     * @return true if this object is valid according to the schema\r
+     */\r
+    public boolean isValid(\r
+    ) {\r
+        try {\r
+            validate();\r
+        } catch (org.exolab.castor.xml.ValidationException vex) {\r
+            return false;\r
+        }\r
+        return true;\r
+    }\r
+\r
+    /**\r
+     * \r
+     * \r
+     * @param out\r
+     * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException if object is\r
+     * null or if any SAXException is thrown during marshaling\r
+     * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException if this\r
+     * object is an invalid instance according to the schema\r
+     */\r
+    public void marshal(\r
+            final java.io.Writer out)\r
+    throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException {\r
+        Marshaller.marshal(this, out);\r
+    }\r
+\r
+    /**\r
+     * \r
+     * \r
+     * @param handler\r
+     * @throws java.io.IOException if an IOException occurs during\r
+     * marshaling\r
+     * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException if this\r
+     * object is an invalid instance according to the schema\r
+     * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException if object is\r
+     * null or if any SAXException is thrown during marshaling\r
+     */\r
+    public void marshal(\r
+            final org.xml.sax.ContentHandler handler)\r
+    throws java.io.IOException, org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException {\r
+        Marshaller.marshal(this, handler);\r
+    }\r
+\r
+    /**\r
+     * Sets the value of field 'mappingChoice'.\r
+     * \r
+     * @param mappingChoice the value of field 'mappingChoice'.\r
+     */\r
+    public void setMappingChoice(\r
+            final jalview.schemabinding.version2.MappingChoice mappingChoice) {\r
+        this._mappingChoice = mappingChoice;\r
+        this._choiceValue = mappingChoice;\r
+    }\r
+\r
+    /**\r
+     * Method unmarshal.\r
+     * \r
+     * @param reader\r
+     * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException if object is\r
+     * null or if any SAXException is thrown during marshaling\r
+     * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException if this\r
+     * object is an invalid instance according to the schema\r
+     * @return the unmarshaled\r
+     * jalview.schemabinding.version2.MapListType\r
+     */\r
+    public static jalview.schemabinding.version2.MapListType unmarshal(\r
+            final java.io.Reader reader)\r
+    throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException {\r
+        return (jalview.schemabinding.version2.MapListType) Unmarshaller.unmarshal(jalview.schemabinding.version2.Mapping.class, reader);\r
+    }\r
+\r
+    /**\r
+     * \r
+     * \r
+     * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException if this\r
+     * object is an invalid instance according to the schema\r
+     */\r
+    public void validate(\r
+    )\r
+    throws org.exolab.castor.xml.ValidationException {\r
+        org.exolab.castor.xml.Validator validator = new org.exolab.castor.xml.Validator();\r
+        validator.validate(this);\r
     }\r
-    return true;\r
-  }\r
-\r
-  /**\r
-   * \r
-   * \r
-   * @param out\r
-   * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException\r
-   *           if object is null or if any SAXException is thrown during\r
-   *           marshaling\r
-   * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
-   *           if this object is an invalid instance according to the schema\r
-   */\r
-  public void marshal(final java.io.Writer out)\r
-          throws org.exolab.castor.xml.MarshalException,\r
-          org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
-  {\r
-    Marshaller.marshal(this, out);\r
-  }\r
-\r
-  /**\r
-   * \r
-   * \r
-   * @param handler\r
-   * @throws java.io.IOException\r
-   *           if an IOException occurs during marshaling\r
-   * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
-   *           if this object is an invalid instance according to the schema\r
-   * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException\r
-   *           if object is null or if any SAXException is thrown during\r
-   *           marshaling\r
-   */\r
-  public void marshal(final org.xml.sax.ContentHandler handler)\r
-          throws java.io.IOException,\r
-          org.exolab.castor.xml.MarshalException,\r
-          org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
-  {\r
-    Marshaller.marshal(this, handler);\r
-  }\r
-\r
-  /**\r
-   * Sets the value of field 'mappingChoice'.\r
-   * \r
-   * @param mappingChoice\r
-   *          the value of field 'mappingChoice'.\r
-   */\r
-  public void setMappingChoice(\r
-          final jalview.schemabinding.version2.MappingChoice mappingChoice)\r
-  {\r
-    this._mappingChoice = mappingChoice;\r
-    this._choiceValue = mappingChoice;\r
-  }\r
-\r
-  /**\r
-   * Method unmarshal.\r
-   * \r
-   * @param reader\r
-   * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException\r
-   *           if object is null or if any SAXException is thrown during\r
-   *           marshaling\r
-   * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
-   *           if this object is an invalid instance according to the schema\r
-   * @return the unmarshaled jalview.schemabinding.version2.MapListType\r
-   */\r
-  public static jalview.schemabinding.version2.MapListType unmarshal(\r
-          final java.io.Reader reader)\r
-          throws org.exolab.castor.xml.MarshalException,\r
-          org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
-  {\r
-    return (jalview.schemabinding.version2.MapListType) Unmarshaller\r
-            .unmarshal(jalview.schemabinding.version2.Mapping.class, reader);\r
-  }\r
-\r
-  /**\r
-   * \r
-   * \r
-   * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
-   *           if this object is an invalid instance according to the schema\r
-   */\r
-  public void validate() throws org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
-  {\r
-    org.exolab.castor.xml.Validator validator = new org.exolab.castor.xml.Validator();\r
-    validator.validate(this);\r
-  }\r
 \r
 }\r