JAL-3949 Complete new abstracted logging framework in jalview.log. Updated log calls...
[jalview.git] / src / jalview / structure / StructureSelectionManager.java
index b4bd781..e4dc137 100644 (file)
@@ -441,8 +441,8 @@ public class StructureSelectionManager
     } catch (SiftsException e)
     {
       isMapUsingSIFTs = false;
-      Cache.log.error("SIFTS mapping failed", e);
-      Cache.log.error("Falling back on Needleman & Wunsch alignment");
+      Cache.error("SIFTS mapping failed", e);
+      Cache.error("Falling back on Needleman & Wunsch alignment");
       siftsClient = null;
     }
 
@@ -556,7 +556,7 @@ public class StructureSelectionManager
           } catch (SiftsException e)
           {
             // fall back to NW alignment
-            Cache.log.error(e.getMessage());
+            Cache.error(e.getMessage());
             StructureMapping nwMapping = getNWMappings(seq, pdbFile,
                     targetChainId, maxChain, pdb, maxAlignseq);
             seqToStrucMapping.add(nwMapping);