apply version 2.7 copyright
[jalview.git] / src / jalview / util / Format.java
index 49e4027..89d5a5c 100755 (executable)
@@ -1,20 +1,19 @@
 /*
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Development Version 2.4.1)
- * Copyright (C) 2009 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)
+ * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
  * 
- * This program is free software; you can redistribute it and/or
- * modify it under the terms of the GNU General Public License
- * as published by the Free Software Foundation; either version 2
- * of the License, or (at your option) any later version.
+ * This file is part of Jalview.
  * 
- * This program is distributed in the hope that it will be useful,
- * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
- * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
- * GNU General Public License for more details.
+ * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
+ * modify it under the terms of the GNU General Public License 
+ * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  * 
- * You should have received a copy of the GNU General Public License
- * along with this program; if not, write to the Free Software
- * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA
+ * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
+ * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
+ * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
+ * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
+ * 
+ * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  */
 /**
  * A class for formatting numbers that follows printf conventions.
@@ -56,7 +55,7 @@ public class Format
    * Creates a new Format object.
    * 
    * @param s
-   *                DOCUMENT ME!
+   *          DOCUMENT ME!
    */
   public Format(String s)
   {
@@ -212,60 +211,57 @@ public class Format
    * more than one number
    * 
    * @param s
-   *                the format string following printf conventions The string
-   *                has a prefix, a format code and a suffix. The prefix and
-   *                suffix become part of the formatted output. The format code
-   *                directs the formatting of the (single) parameter to be
-   *                formatted. The code has the following structure
-   *                <ul>
-   *                <li> a % (required)
-   *                <li> a modifier (optional)
-   *                <dl>
-   *                <dt> +
-   *                <dd> forces display of + for positive numbers
-   *                <dt> 0
-   *                <dd> show leading zeroes
-   *                <dt> -
-   *                <dd> align left in the field
-   *                <dt> space
-   *                <dd> prepend a space in front of positive numbers
-   *                <dt> #
-   *                <dd> use "alternate" format. Add 0 or 0x for octal or
-   *                hexadecimal numbers. Don't suppress trailing zeroes in
-   *                general floating point format.
-   *                </dl>
-   *                <li> an integer denoting field width (optional)
-   *                <li> a period followed by an integer denoting precision
-   *                (optional)
-   *                <li> a format descriptor (required)
-   *                <dl>
-   *                <dt>f
-   *                <dd> floating point number in fixed format
-   *                <dt>e, E
-   *                <dd> floating point number in exponential notation
-   *                (scientific format). The E format results in an uppercase E
-   *                for the exponent (1.14130E+003), the e format in a lowercase
-   *                e.
-   *                <dt>g, G
-   *                <dd> floating point number in general format (fixed format
-   *                for small numbers, exponential format for large numbers).
-   *                Trailing zeroes are suppressed. The G format results in an
-   *                uppercase E for the exponent (if any), the g format in a
-   *                lowercase e.
-   *                <dt>d, i
-   *                <dd> integer in decimal
-   *                <dt>x
-   *                <dd> integer in hexadecimal
-   *                <dt>o
-   *                <dd> integer in octal
-   *                <dt>s
-   *                <dd> string
-   *                <dt>c
-   *                <dd> character
-   *                </dl>
-   *                </ul>
+   *          the format string following printf conventions The string has a
+   *          prefix, a format code and a suffix. The prefix and suffix become
+   *          part of the formatted output. The format code directs the
+   *          formatting of the (single) parameter to be formatted. The code has
+   *          the following structure
+   *          <ul>
+   *          <li>a % (required)
+   *          <li>a modifier (optional)
+   *          <dl>
+   *          <dt>+
+   *          <dd>forces display of + for positive numbers
+   *          <dt>0
+   *          <dd>show leading zeroes
+   *          <dt>-
+   *          <dd>align left in the field
+   *          <dt>space
+   *          <dd>prepend a space in front of positive numbers
+   *          <dt>#
+   *          <dd>use "alternate" format. Add 0 or 0x for octal or hexadecimal
+   *          numbers. Don't suppress trailing zeroes in general floating point
+   *          format.
+   *          </dl>
+   *          <li>an integer denoting field width (optional)
+   *          <li>a period followed by an integer denoting precision (optional)
+   *          <li>a format descriptor (required)
+   *          <dl>
+   *          <dt>f
+   *          <dd>floating point number in fixed format
+   *          <dt>e, E
+   *          <dd>floating point number in exponential notation (scientific
+   *          format). The E format results in an uppercase E for the exponent
+   *          (1.14130E+003), the e format in a lowercase e.
+   *          <dt>g, G
+   *          <dd>floating point number in general format (fixed format for
+   *          small numbers, exponential format for large numbers). Trailing
+   *          zeroes are suppressed. The G format results in an uppercase E for
+   *          the exponent (if any), the g format in a lowercase e.
+   *          <dt>d, i
+   *          <dd>integer in decimal
+   *          <dt>x
+   *          <dd>integer in hexadecimal
+   *          <dt>o
+   *          <dd>integer in octal
+   *          <dt>s
+   *          <dd>string
+   *          <dt>c
+   *          <dd>character
+   *          </dl>
+   *          </ul>
    * @exception IllegalArgumentException
-   *                    if bad format
+   *              if bad format
    * 
    */
   public static String getHexString(java.awt.Color color)
@@ -301,11 +297,11 @@ public class Format
    * prints a formatted number following printf conventions
    * 
    * @param s
-   *                a PrintStream
+   *          a PrintStream
    * @param fmt
-   *                the format string
+   *          the format string
    * @param x
-   *                the double to print
+   *          the double to print
    */
   public static void print(java.io.PrintStream s, String fmt, double x)
   {
@@ -316,11 +312,11 @@ public class Format
    * prints a formatted number following printf conventions
    * 
    * @param s
-   *                a PrintStream
+   *          a PrintStream
    * @param fmt
-   *                the format string
+   *          the format string
    * @param x
-   *                the long to print
+   *          the long to print
    */
   public static void print(java.io.PrintStream s, String fmt, long x)
   {
@@ -331,11 +327,11 @@ public class Format
    * prints a formatted number following printf conventions
    * 
    * @param s
-   *                a PrintStream
+   *          a PrintStream
    * @param fmt
-   *                the format string
+   *          the format string
    * @param x
-   *                the character to
+   *          the character to
    */
   public static void print(java.io.PrintStream s, String fmt, char x)
   {
@@ -346,9 +342,9 @@ public class Format
    * prints a formatted number following printf conventions
    * 
    * @param s
-   *                a PrintStream, fmt the format string
+   *          a PrintStream, fmt the format string
    * @param x
-   *                a string that represents the digits to print
+   *          a string that represents the digits to print
    */
   public static void print(java.io.PrintStream s, String fmt, String x)
   {
@@ -359,7 +355,7 @@ public class Format
    * Converts a string of digits (decimal, octal or hex) to an integer
    * 
    * @param s
-   *                a string
+   *          a string
    * @return the numeric value of the prefix of s representing a base 10 integer
    */
   public static int atoi(String s)
@@ -371,7 +367,7 @@ public class Format
    * Converts a string of digits (decimal, octal or hex) to a long integer
    * 
    * @param s
-   *                a string
+   *          a string
    * @return the numeric value of the prefix of s representing a base 10 integer
    */
   public static long atol(String s)
@@ -405,9 +401,9 @@ public class Format
    * DOCUMENT ME!
    * 
    * @param s
-   *                DOCUMENT ME!
+   *          DOCUMENT ME!
    * @param base
-   *                DOCUMENT ME!
+   *          DOCUMENT ME!
    * 
    * @return DOCUMENT ME!
    */
@@ -463,7 +459,7 @@ public class Format
    * Converts a string of digits to an double
    * 
    * @param s
-   *                a string
+   *          a string
    */
   public static double atof(String s)
   {
@@ -537,10 +533,10 @@ public class Format
    * Formats a double into a string (like sprintf in C)
    * 
    * @param x
-   *                the number to format
+   *          the number to format
    * @return the formatted string
    * @exception IllegalArgumentException
-   *                    if bad argument
+   *              if bad argument
    */
   public String form(double x)
   {
@@ -579,7 +575,7 @@ public class Format
    * Formats a long integer into a string (like sprintf in C)
    * 
    * @param x
-   *                the number to format
+   *          the number to format
    * @return the formatted string
    */
   public String form(long x)
@@ -624,7 +620,7 @@ public class Format
    * Formats a character into a string (like sprintf in C)
    * 
    * @param x
-   *                the value to format
+   *          the value to format
    * @return the formatted string
    */
   public String form(char c)
@@ -643,7 +639,7 @@ public class Format
    * Formats a string into a larger string (like sprintf in C)
    * 
    * @param x
-   *                the value to format
+   *          the value to format
    * @return the formatted string
    */
   public String form(String s)
@@ -665,9 +661,9 @@ public class Format
    * DOCUMENT ME!
    * 
    * @param c
-   *                DOCUMENT ME!
+   *          DOCUMENT ME!
    * @param n
-   *                DOCUMENT ME!
+   *          DOCUMENT ME!
    * 
    * @return DOCUMENT ME!
    */
@@ -692,13 +688,13 @@ public class Format
    * DOCUMENT ME!
    * 
    * @param x
-   *                DOCUMENT ME!
+   *          DOCUMENT ME!
    * @param n
-   *                DOCUMENT ME!
+   *          DOCUMENT ME!
    * @param m
-   *                DOCUMENT ME!
+   *          DOCUMENT ME!
    * @param d
-   *                DOCUMENT ME!
+   *          DOCUMENT ME!
    * 
    * @return DOCUMENT ME!
    */
@@ -724,7 +720,7 @@ public class Format
    * DOCUMENT ME!
    * 
    * @param r
-   *                DOCUMENT ME!
+   *          DOCUMENT ME!
    * 
    * @return DOCUMENT ME!
    */
@@ -746,9 +742,9 @@ public class Format
    * DOCUMENT ME!
    * 
    * @param s
-   *                DOCUMENT ME!
+   *          DOCUMENT ME!
    * @param r
-   *                DOCUMENT ME!
+   *          DOCUMENT ME!
    * 
    * @return DOCUMENT ME!
    */
@@ -807,7 +803,7 @@ public class Format
    * DOCUMENT ME!
    * 
    * @param d
-   *                DOCUMENT ME!
+   *          DOCUMENT ME!
    * 
    * @return DOCUMENT ME!
    */
@@ -879,7 +875,7 @@ public class Format
    * DOCUMENT ME!
    * 
    * @param d
-   *                DOCUMENT ME!
+   *          DOCUMENT ME!
    * 
    * @return DOCUMENT ME!
    */