Jalview 2.6 source licence
[jalview.git] / src / vamsas / objects / simple / MsaResult.java
index e4af81e..173a2e7 100755 (executable)
-/**
- * MsaResult.java
+/*
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.6)
+ * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
+ * 
+ * This file is part of Jalview.
+ * 
+ * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
+ * modify it under the terms of the GNU General Public License 
+ * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
+ * 
+ * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
+ * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
+ * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
+ * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
+ * 
+ * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ */
+/*
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer
+ * Copyright (C) 2007 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle
+ *
+ * This program is free software; you can redistribute it and/or
+ * modify it under the terms of the GNU General Public License
+ * as published by the Free Software Foundation; either version 2
+ * of the License, or (at your option) any later version.
+ *
+ * This program is distributed in the hope that it will be useful,
+ * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+ * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
+ * GNU General Public License for more details.
  *
- * This file was auto-generated from WSDL
- * by the Apache Axis 1.2RC2 Nov 16, 2004 (12:19:44 EST) WSDL2Java emitter.
+ * You should have received a copy of the GNU General Public License
+ * along with this program; if not, write to the Free Software
+ * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA
  */
+package vamsas.objects.simple;
 
-/*
-* Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer
-* Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle
-*
-* This program is free software; you can redistribute it and/or
-* modify it under the terms of the GNU General Public License
-* as published by the Free Software Foundation; either version 2
-* of the License, or (at your option) any later version.
-*
-* This program is distributed in the hope that it will be useful,
-* but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
-* MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
-* GNU General Public License for more details.
-*
-* You should have received a copy of the GNU General Public License
-* along with this program; if not, write to the Free Software
-* Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA
-*/
+public class MsaResult extends vamsas.objects.simple.Result implements
+        java.io.Serializable
+{
+  private vamsas.objects.simple.Alignment msa;
 
-package vamsas.objects.simple;
+  private java.lang.Object __equalsCalc = null;
 
-public class MsaResult  extends vamsas.objects.simple.Result  implements java.io.Serializable {
-    private vamsas.objects.simple.Alignment msa;
+  private boolean __hashCodeCalc = false;
 
-    public MsaResult() {
-    }
+  public MsaResult()
+  {
+  }
+
+  public MsaResult(vamsas.objects.simple.Alignment msa)
+  {
+    this.msa = msa;
+  }
 
-    public MsaResult(
-           vamsas.objects.simple.Alignment msa) {
-           this.msa = msa;
+  /**
+   * Gets the msa value for this MsaResult.
+   * 
+   * @return msa
+   */
+  public vamsas.objects.simple.Alignment getMsa()
+  {
+    return msa;
+  }
+
+  /**
+   * Sets the msa value for this MsaResult.
+   * 
+   * @param msa
+   */
+  public void setMsa(vamsas.objects.simple.Alignment msa)
+  {
+    this.msa = msa;
+  }
+
+  public synchronized boolean equals(java.lang.Object obj)
+  {
+    if (!(obj instanceof MsaResult))
+    {
+      return false;
     }
 
+    MsaResult other = (MsaResult) obj;
 
-    /**
-     * Gets the msa value for this MsaResult.
-     *
-     * @return msa
-     */
-    public vamsas.objects.simple.Alignment getMsa() {
-        return msa;
+    if (obj == null)
+    {
+      return false;
     }
 
+    if (this == obj)
+    {
+      return true;
+    }
 
-    /**
-     * Sets the msa value for this MsaResult.
-     *
-     * @param msa
-     */
-    public void setMsa(vamsas.objects.simple.Alignment msa) {
-        this.msa = msa;
+    if (__equalsCalc != null)
+    {
+      return (__equalsCalc == obj);
     }
 
-    private java.lang.Object __equalsCalc = null;
-    public synchronized boolean equals(java.lang.Object obj) {
-        if (!(obj instanceof MsaResult)) return false;
-        MsaResult other = (MsaResult) obj;
-        if (obj == null) return false;
-        if (this == obj) return true;
-        if (__equalsCalc != null) {
-            return (__equalsCalc == obj);
-        }
-        __equalsCalc = obj;
-        boolean _equals;
-        _equals = super.equals(obj) &&
-            ((this.msa==null && other.getMsa()==null) ||
-             (this.msa!=null &&
-              this.msa.equals(other.getMsa())));
-        __equalsCalc = null;
-        return _equals;
+    __equalsCalc = obj;
+
+    boolean _equals;
+    _equals = super.equals(obj)
+            && (((this.msa == null) && (other.getMsa() == null)) || ((this.msa != null) && this.msa
+                    .equals(other.getMsa())));
+    __equalsCalc = null;
+
+    return _equals;
+  }
+
+  public synchronized int hashCode()
+  {
+    if (__hashCodeCalc)
+    {
+      return 0;
     }
 
-    private boolean __hashCodeCalc = false;
-    public synchronized int hashCode() {
-        if (__hashCodeCalc) {
-            return 0;
-        }
-        __hashCodeCalc = true;
-        int _hashCode = super.hashCode();
-        if (getMsa() != null) {
-            _hashCode += getMsa().hashCode();
-        }
-        __hashCodeCalc = false;
-        return _hashCode;
+    __hashCodeCalc = true;
+
+    int _hashCode = super.hashCode();
+
+    if (getMsa() != null)
+    {
+      _hashCode += getMsa().hashCode();
     }
 
+    __hashCodeCalc = false;
+
+    return _hashCode;
+  }
 }