JAL-1645 Version-Rel Version 2.9 Year-Rel 2015 Licensing glob
[jalview.git] / test / jalview / ext / rbvi / chimera / JalviewChimeraView.java
index 34e07f2..d7da606 100644 (file)
@@ -1,3 +1,23 @@
+/*
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.9)
+ * Copyright (C) 2015 The Jalview Authors
+ * 
+ * This file is part of Jalview.
+ * 
+ * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
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+ *  
+ * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
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+ * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
+ * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
+ * 
+ * You should have received a copy of the GNU General Public License
+ * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
+ */
 package jalview.ext.rbvi.chimera;
 
 import static org.testng.AssertJUnit.assertEquals;
@@ -26,8 +46,7 @@ public class JalviewChimeraView
   @BeforeClass(alwaysRun = true)
   public static void setUpBeforeClass() throws Exception
   {
-    jalview.bin.Jalview.main(new String[]
- {
+    jalview.bin.Jalview.main(new String[] {
         "-noquestionnaire -nonews -props",
         "test/jalview/ext/rbvi/chimera/testProps.jvprops" });
   }
@@ -41,7 +60,7 @@ public class JalviewChimeraView
     jalview.gui.Desktop.instance.closeAll_actionPerformed(null);
   }
 
-  @Test(groups ={ "Functional" })
+  @Test(groups = { "Functional" })
   public void testSingleSeqViewChimera()
   {
     Cache.setProperty(Preferences.STRUCTURE_DISPLAY,
@@ -58,7 +77,8 @@ public class JalviewChimeraView
       {
         dsq = dsq.getDatasetSequence();
       }
-      if (dsq.getAllPDBEntries() != null && dsq.getAllPDBEntries().size() > 0)
+      if (dsq.getAllPDBEntries() != null
+              && dsq.getAllPDBEntries().size() > 0)
       {
         for (int q = 0; q < dsq.getAllPDBEntries().size(); q++)
         {
@@ -67,8 +87,8 @@ public class JalviewChimeraView
           structureViewer.setViewerType(ViewerType.CHIMERA);
           JalviewStructureDisplayI chimeraViewer = structureViewer
                   .viewStructures(dsq.getAllPDBEntries().elementAt(q),
-                          new SequenceI[]
-                          { sq }, af.getCurrentView().getAlignPanel());
+                          new SequenceI[] { sq }, af.getCurrentView()
+                                  .getAlignPanel());
           /*
            * Wait for viewer load thread to complete
            */