src/jalview/javascript/JsSelectionSender.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
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   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
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  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.javascript;
  22
  23 import jalview.appletgui.AlignFrame;
  24 import jalview.appletgui.AlignViewport;
  25 import jalview.bin.JalviewLite;
  26 import jalview.datamodel.ColumnSelection;
  27 import jalview.datamodel.SequenceGroup;
  28 import jalview.structure.SelectionListener;
  29 import jalview.structure.SelectionSource;
  30
  31 import netscape.javascript.JSException;
  32
  33 public class JsSelectionSender extends JSFunctionExec implements
  34         SelectionListener, JsCallBack
  35 {
  36
  37   AlignFrame _af;
  38
  39   String _listener;
  40
  41   public JsSelectionSender(JalviewLite jvlite, AlignFrame af,
  42           String listener)
  43   {
  44     super(jvlite);
  45     _af = af;
  46     _listener = listener;
  47   }
  48
  49   @Override
  50   public void selection(SequenceGroup seqsel, ColumnSelection colsel,
  51           SelectionSource source)
  52   {
  53     // System.err.println("Testing selection event relay to jsfunction:"+_listener);
  54     try
  55     {
  56       String setid = "";
  57       String viewid = "";
  58       AlignFrame src = _af;
  59       if (source != null)
  60       {
  61         if (source instanceof AlignViewport
  62                 && ((AlignViewport) source).applet.currentAlignFrame.viewport == source)
  63         {
  64           // should be valid if it just generated an event!
  65           src = ((AlignViewport) source).applet.currentAlignFrame;
  66
  67         }
  68       }
  69       String[] seqs = new String[]
  70       {};
  71       String[] cols = new String[]
  72       {};
  73       int strt = 0, end = (src == null) ? -1 : src.alignPanel.av
  74               .getAlignment().getWidth();
  75       if (seqsel != null && seqsel.getSize() > 0)
  76       {
  77         seqs = new String[seqsel.getSize()];
  78         for (int i = 0; i < seqs.length; i++)
  79         {
  80           seqs[i] = seqsel.getSequenceAt(i).getName();
  81         }
  82         if (strt < seqsel.getStartRes())
  83         {
  84           strt = seqsel.getStartRes();
  85         }
  86         if (end == -1 || end > seqsel.getEndRes())
  87         {
  88           end = seqsel.getEndRes();
  89         }
  90       }
  91       if (colsel != null && colsel.size() > 0)
  92       {
  93         if (end == -1)
  94         {
  95           end = colsel.getMax() + 1;
  96         }
  97         cols = new String[colsel.getSelected().size()];
  98         int d = 0, r = -1;
  99         for (int i = 0; i < cols.length; i++)
 100         {
 101           cols[i] = ""
 102                   + (1 + colsel.getSelected().elementAt(i)
 103                           .intValue());
 104         }
 105       }
 106       else
 107       {
 108         if (seqsel != null && seqsel.getSize() > 0)
 109         {
 110           // send a valid range, otherwise we send the empty selection
 111           cols = new String[2];
 112           cols[0] = "" + (1 + strt) + "-" + (1 + end);
 113         }
 114         ;
 115
 116       }
 117       System.err.println("Relaying selection to jsfunction:" + _listener);
 118       executeJavascriptFunction(
 119               _listener,
 120               new Object[]
 121               { src, setid, jvlite.arrayToSeparatorList(seqs),
 122                   jvlite.arrayToSeparatorList(cols) });
 123     } catch (Exception ex)
 124     {
 125       System.err
 126               .println("Jalview Javascript exec error: Couldn't send selection message using function '"
 127                       + _listener + "'");
 128       ex.printStackTrace();
 129       if (ex instanceof netscape.javascript.JSException)
 130       {
 131         System.err.println("Javascript Exception: "
 132                 + ((netscape.javascript.JSException) ex).getCause()
 133                         .toString());
 134       }
 135
 136     }
 137   }
 138
 139   @Override
 140   public AlignFrame getAlignFrame()
 141   {
 142     return _af;
 143   }
 144
 145   @Override
 146   public String getListenerFunction()
 147   {
 148     return _listener;
 149   }
 150
 151 }