unused/appletgui/SliderPanel.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.appletgui;
  22
  23 import jalview.bin.JalviewLite;
  24 import jalview.datamodel.SequenceGroup;
  25 import jalview.schemes.ColourSchemeI;
  26 import jalview.util.MessageManager;
  27
  28 import java.awt.BorderLayout;
  29 import java.awt.Color;
  30 import java.awt.FlowLayout;
  31 import java.awt.event.ActionEvent;
  32 import java.awt.event.ActionListener;
  33 import java.awt.event.AdjustmentEvent;
  34 import java.awt.event.AdjustmentListener;
  35 import java.awt.event.MouseEvent;
  36 import java.awt.event.MouseListener;
  37 import java.awt.event.WindowAdapter;
  38 import java.awt.event.WindowEvent;
  39 import java.util.Iterator;
  40
  41 import javax.swing.JButton;
  42 import javax.swing.JCheckBox;
  43 import javax.swing.JFrame;
  44 import javax.swing.JLabel;
  45 import javax.swing.JPanel;
  46 import javax.swing.JScrollBar;
  47 import javax.swing.JTextField;
  48
  49 public class SliderPanel extends JPanel implements ActionListener,
  50         AdjustmentListener, MouseListener
  51 {
  52   AlignmentPanel ap;
  53
  54   boolean forConservation = true;
  55
  56   ColourSchemeI cs;
  57
  58   static JFrame conservationSlider;
  59
  60   static JFrame PIDSlider;
  61
  62   public static int setConservationSlider(AlignmentPanel ap,
  63           ColourSchemeI cs, String source)
  64   {
  65     SliderPanel sp = null;
  66
  67     if (conservationSlider == null)
  68     {
  69       sp = new SliderPanel(ap, cs.getConservationInc(), true, cs);
  70       conservationSlider = new JFrame();
  71       conservationSlider.add(sp);
  72     }
  73     else
  74     {
  75       sp = (SliderPanel) conservationSlider.getComponent(0);
  76       sp.cs = cs;
  77     }
  78
  79     conservationSlider.setTitle(MessageManager.formatMessage("label.conservation_colour_increment", new String[]{source}));
  80     if (ap.av.getAlignment().getGroups() != null)
  81     {
  82       sp.setAllGroupsCheckEnabled(true);
  83     }
  84     else
  85     {
  86       sp.setAllGroupsCheckEnabled(false);
  87     }
  88
  89     return sp.getValue();
  90   }
  91
  92   public static void showConservationSlider()
  93   {
  94     try
  95     {
  96       PIDSlider.setVisible(false);
  97       PIDSlider = null;
  98     } catch (Exception ex)
  99     {
 100     }
 101
 102     if (!conservationSlider.isVisible())
 103     {
 104       JalviewLite.addFrame(conservationSlider,
 105               conservationSlider.getTitle(), 420, 100);
 106       conservationSlider.addWindowListener(new WindowAdapter()
 107       {
 108         public void windowClosing(WindowEvent e)
 109         {
 110           conservationSlider = null;
 111         }
 112       });
 113
 114     }
 115
 116   }
 117
 118   public static int setPIDSliderSource(AlignmentPanel ap, ColourSchemeI cs,
 119           String source)
 120   {
 121     SliderPanel pid = null;
 122     if (PIDSlider == null)
 123     {
 124       pid = new SliderPanel(ap, 50, false, cs);
 125       PIDSlider = new JFrame();
 126       PIDSlider.add(pid);
 127     }
 128     else
 129     {
 130       pid = (SliderPanel) PIDSlider.getComponent(0);
 131       pid.cs = cs;
 132     }
 133     PIDSlider.setTitle(MessageManager.formatMessage("label.percentage_identity_thereshold", new String[]{source}));
 134
 135     if (ap.av.getAlignment().getGroups() != null)
 136     {
 137       pid.setAllGroupsCheckEnabled(true);
 138     }
 139     else
 140     {
 141       pid.setAllGroupsCheckEnabled(false);
 142     }
 143
 144     return pid.getValue();
 145
 146   }
 147
 148   public static void showPIDSlider()
 149   {
 150     try
 151     {
 152       conservationSlider.setVisible(false);
 153       conservationSlider = null;
 154     } catch (Exception ex)
 155     {
 156     }
 157
 158     if (!PIDSlider.isVisible())
 159     {
 160       JalviewLite.addFrame(PIDSlider, PIDSlider.getTitle(),
 161               420, 100);
 162       PIDSlider.addWindowListener(new WindowAdapter()
 163       {
 164         public void windowClosing(WindowEvent e)
 165         {
 166           PIDSlider = null;
 167         }
 168       });
 169     }
 170
 171   }
 172
 173   public SliderPanel(AlignmentPanel ap, int value, boolean forConserve,
 174           ColourSchemeI cs)
 175   {
 176     try
 177     {
 178       jbInit();
 179     } catch (Exception e)
 180     {
 181       e.printStackTrace();
 182     }
 183     this.ap = ap;
 184     this.cs = cs;
 185     forConservation = forConserve;
 186     undoButton.setVisible(false);
 187     applyButton.setVisible(false);
 188     if (forConservation)
 189     {
 190       label.setText(MessageManager
 191               .getString("label.modify_conservation_visibility"));
 192       slider.setMinimum(0);
 193       slider.setMaximum(50 + slider.getVisibleAmount());
 194       slider.setUnitIncrement(1);
 195     }
 196     else
 197     {
 198       label.setText(MessageManager
 199               .getString("label.colour_residues_above_occurence"));
 200       slider.setMinimum(0);
 201       slider.setMaximum(100 + slider.getVisibleAmount());
 202       slider.setBlockIncrement(1);
 203     }
 204
 205     slider.addAdjustmentListener(this);
 206     slider.addMouseListener(this);
 207
 208     slider.setValue(value);
 209     valueField.setText(value + "");
 210   }
 211
 212   public void valueChanged(int i)
 213   {
 214     if (cs == null)
 215     {
 216       return;
 217     }
 218
 219     ColourSchemeI toChange = cs;
 220     Iterator<SequenceGroup> allGroups = null;
 221
 222     if (allGroupsCheck.isSelected())
 223     {
 224       allGroups = ap.av.getAlignment().getGroups().listIterator();
 225     }
 226
 227     while (toChange != null)
 228     {
 229       if (forConservation)
 230       {
 231         toChange.setConservationInc(i);
 232       }
 233       else
 234       {
 235         toChange.setThreshold(i, ap.av.isIgnoreGapsConsensus());
 236       }
 237       if (allGroups != null && allGroups.hasNext())
 238       {
 239         while ((toChange = allGroups.next().cs) == null
 240                 && allGroups.hasNext())
 241         {
 242           ;
 243         }
 244       }
 245       else
 246       {
 247         toChange = null;
 248       }
 249     }
 250
 251     ap.seqPanel.seqCanvas.repaint();
 252
 253   }
 254
 255   public void setAllGroupsCheckEnabled(boolean b)
 256   {
 257     allGroupsCheck.setEnabled(b);
 258   }
 259
 260   public void actionPerformed(ActionEvent evt)
 261   {
 262     if (evt.getSource() == applyButton)
 263     {
 264       applyButton_actionPerformed();
 265     }
 266     else if (evt.getSource() == undoButton)
 267     {
 268       undoButton_actionPerformed();
 269     }
 270     else if (evt.getSource() == valueField)
 271     {
 272       valueField_actionPerformed();
 273     }
 274   }
 275
 276   public void adjustmentValueChanged(AdjustmentEvent evt)
 277   {
 278     valueField.setText(slider.getValue() + "");
 279     valueChanged(slider.getValue());
 280   }
 281
 282   public void valueField_actionPerformed()
 283   {
 284     try
 285     {
 286       int i = Integer.parseInt(valueField.getText());
 287       slider.setValue(i);
 288     } catch (Exception ex)
 289     {
 290       valueField.setText(slider.getValue() + "");
 291     }
 292   }
 293
 294   public void setValue(int value)
 295   {
 296     slider.setValue(value);
 297   }
 298
 299   public int getValue()
 300   {
 301     return Integer.parseInt(valueField.getText());
 302   }
 303
 304   // this is used for conservation colours, PID colours and redundancy threshold
 305   protected JScrollBar slider = new JScrollBar();
 306
 307   protected JTextField valueField = new JTextField();
 308
 309   protected JLabel label = new JLabel();
 310
 311   JPanel jPanel1 = new JPanel();
 312
 313   JPanel jPanel2 = new JPanel();
 314
 315   protected JButton applyButton = new JButton();
 316
 317   protected JButton undoButton = new JButton();
 318
 319   FlowLayout flowLayout1 = new FlowLayout();
 320
 321   protected JCheckBox allGroupsCheck = new JCheckBox();
 322
 323   BorderLayout borderLayout1 = new BorderLayout();
 324
 325   BorderLayout borderLayout2 = new BorderLayout();
 326
 327   FlowLayout flowLayout2 = new FlowLayout();
 328
 329   private void jbInit() throws Exception
 330   {
 331     this.setLayout(borderLayout2);
 332
 333     // slider.setMajorTickSpacing(10);
 334     // slider.setMinorTickSpacing(1);
 335     // slider.setPaintTicks(true);
 336     slider.setBackground(Color.white);
 337     slider.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));
 338     slider.setOrientation(0);
 339     valueField.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));
 340     valueField.setText("   ");
 341     valueField.addActionListener(this);
 342     valueField.setColumns(3);
 343     label.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));
 344     label.setText(MessageManager.getString("label.set_this_label_text"));
 345     jPanel1.setLayout(borderLayout1);
 346     jPanel2.setLayout(flowLayout1);
 347     applyButton.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));
 348     applyButton.setLabel(MessageManager.getString("action.apply"));
 349     applyButton.addActionListener(this);
 350     undoButton.setEnabled(false);
 351     undoButton.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));
 352     undoButton.setLabel(MessageManager.getString("action.undo"));
 353     undoButton.addActionListener(this);
 354     allGroupsCheck.setEnabled(false);
 355     allGroupsCheck.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));
 356     allGroupsCheck.setLabel(MessageManager
 357             .getString("action.apply_threshold_all_groups"));
 358     allGroupsCheck.setName(MessageManager
 359             .getString("action.apply_all_groups"));
 360     this.setBackground(Color.white);
 361     this.setForeground(Color.black);
 362     jPanel2.add(label, null);
 363     jPanel2.add(applyButton, null);
 364     jPanel2.add(undoButton, null);
 365     jPanel2.add(allGroupsCheck);
 366     jPanel1.add(valueField, java.awt.BorderLayout.EAST);
 367     jPanel1.add(slider, java.awt.BorderLayout.CENTER);
 368     this.add(jPanel1, java.awt.BorderLayout.SOUTH);
 369     this.add(jPanel2, java.awt.BorderLayout.CENTER);
 370   }
 371
 372   protected void applyButton_actionPerformed()
 373   {
 374   }
 375
 376   protected void undoButton_actionPerformed()
 377   {
 378   }
 379
 380   public void mousePressed(MouseEvent evt)
 381   {
 382   }
 383
 384   public void mouseReleased(MouseEvent evt)
 385   {
 386     ap.paintAlignment(true);
 387   }
 388
 389   public void mouseClicked(MouseEvent evt)
 390   {
 391   }
 392
 393   public void mouseEntered(MouseEvent evt)
 394   {
 395   }
 396
 397   public void mouseExited(MouseEvent evt)
 398   {
 399   }
 400 }