binaries/matrices/BLOSUM55

   1 #  Matrix made by matblas from blosum55.iij
   2 #  * column uses minimum score
   3 #  BLOSUM Clustered Scoring Matrix in 1/3 Bit Units
   4 #  Blocks Database = /data/blocks_5.0/blocks.dat
   5 #  Cluster Percentage: >= 55
   6 #  Entropy =   0.5637, Expected =  -0.4179
   7    A  R  N  D  C  Q  E  G  H  I  L  K  M  F  P  S  T  W  Y  V  B  Z  X  *
   8 A  5 -2 -2 -2  0 -1 -1  0 -2 -2 -2 -1 -1 -3 -1  2  0 -4 -2  0 -2 -1 -1 -5
   9 R -2  8 -1 -2 -4  1  0 -3  0 -4 -3  3 -2 -3 -3 -1 -1 -3 -2 -3 -1  0 -1 -5
  10 N -2 -1  8  2 -3  0  0  0  1 -4 -4  0 -3 -4 -2  1  0 -5 -2 -4  4  0 -1 -5
  11 D -2 -2  2  8 -4  0  2 -2 -1 -4 -5 -1 -4 -5 -2  0 -1 -5 -3 -4  5  1 -2 -5
  12 C  0 -4 -3 -4 13 -4 -4 -3 -4 -2 -2 -4 -2 -3 -3 -1 -1 -4 -3 -1 -4 -4 -2 -5
  13 Q -1  1  0  0 -4  7  2 -2  1 -4 -3  2  0 -4 -1  0 -1 -2 -1 -3  0  4 -1 -5
  14 E -1  0  0  2 -4  2  7 -3 -1 -4 -4  1 -3 -4 -1  0 -1 -3 -2 -3  1  5 -1 -5
  15 G  0 -3  0 -2 -3 -2 -3  8 -2 -5 -5 -2 -3 -4 -3  0 -2 -3 -4 -4 -1 -3 -2 -5
  16 H -2  0  1 -1 -4  1 -1 -2 11 -4 -3  0 -2 -1 -3 -1 -2 -3  2 -4  0  0 -1 -5
  17 I -2 -4 -4 -4 -2 -4 -4 -5 -4  6  2 -4  2  0 -3 -3 -1 -3 -1  4 -4 -4 -1 -5
  18 L -2 -3 -4 -5 -2 -3 -4 -5 -3  2  6 -3  3  1 -4 -3 -2 -3 -1  1 -4 -3 -1 -5
  19 K -1  3  0 -1 -4  2  1 -2  0 -4 -3  6 -2 -4 -1  0 -1 -4 -2 -3  0  1 -1 -5
  20 M -1 -2 -3 -4 -2  0 -3 -3 -2  2  3 -2  8  0 -3 -2 -1 -2 -1  1 -3 -2 -1 -5
  21 F -3 -3 -4 -5 -3 -4 -4 -4 -1  0  1 -4  0  9 -5 -3 -3  2  4 -1 -5 -4 -2 -5
  22 P -1 -3 -2 -2 -3 -1 -1 -3 -3 -3 -4 -1 -3 -5 10 -1 -1 -5 -4 -3 -2 -1 -2 -5
  23 S  2 -1  1  0 -1  0  0  0 -1 -3 -3  0 -2 -3 -1  5  2 -4 -2 -2  0  0 -1 -5
  24 T  0 -1  0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -2 -1 -1 -3 -1  2  6 -3 -2  0 -1 -1 -1 -5
  25 W -4 -3 -5 -5 -4 -2 -3 -3 -3 -3 -3 -4 -2  2 -5 -4 -3 15  3 -4 -5 -3 -3 -5
  26 Y -2 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -4  2 -1 -1 -2 -1  4 -4 -2 -2  3  9 -2 -3 -2 -1 -5
  27 V  0 -3 -4 -4 -1 -3 -3 -4 -4  4  1 -3  1 -1 -3 -2  0 -4 -2  5 -4 -3 -1 -5
  28 B -2 -1  4  5 -4  0  1 -1  0 -4 -4  0 -3 -5 -2  0 -1 -5 -3 -4  5  2 -1 -5
  29 Z -1  0  0  1 -4  4  5 -3  0 -4 -3  1 -2 -4 -1  0 -1 -3 -2 -3  2  5 -1 -5
  30 X -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -3 -1 -1 -1 -1 -1 -5
  31 * -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5  1