JWS-112 Bumping version of ClustalO (src, binaries and windows) to version 1.2.4.
[jabaws.git] / binaries / src / clustalo / config.status
1 #! /bin/sh
2 # Generated by configure.
3 # Run this file to recreate the current configuration.
4 # Compiler output produced by configure, useful for debugging
5 # configure, is in config.log if it exists.
6
7 debug=false
8 ac_cs_recheck=false
9 ac_cs_silent=false
10 SHELL=${CONFIG_SHELL-/bin/sh}
11 ## --------------------- ##
12 ## M4sh Initialization.  ##
13 ## --------------------- ##
14
15 # Be more Bourne compatible
16 DUALCASE=1; export DUALCASE # for MKS sh
17 if test -n "${ZSH_VERSION+set}" && (emulate sh) >/dev/null 2>&1; then
18   emulate sh
19   NULLCMD=:
20   # Pre-4.2 versions of Zsh do word splitting on ${1+"$@"}, which
21   # is contrary to our usage.  Disable this feature.
22   alias -g '${1+"$@"}'='"$@"'
23   setopt NO_GLOB_SUBST
24 else
25   case `(set -o) 2>/dev/null` in
26   *posix*) set -o posix ;;
27 esac
28
29 fi
30
31
32
33
34 # PATH needs CR
35 # Avoid depending upon Character Ranges.
36 as_cr_letters='abcdefghijklmnopqrstuvwxyz'
37 as_cr_LETTERS='ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ'
38 as_cr_Letters=$as_cr_letters$as_cr_LETTERS
39 as_cr_digits='0123456789'
40 as_cr_alnum=$as_cr_Letters$as_cr_digits
41
42 as_nl='
43 '
44 export as_nl
45 # Printing a long string crashes Solaris 7 /usr/bin/printf.
46 as_echo='\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\'
47 as_echo=$as_echo$as_echo$as_echo$as_echo$as_echo
48 as_echo=$as_echo$as_echo$as_echo$as_echo$as_echo$as_echo
49 if (test "X`printf %s $as_echo`" = "X$as_echo") 2>/dev/null; then
50   as_echo='printf %s\n'
51   as_echo_n='printf %s'
52 else
53   if test "X`(/usr/ucb/echo -n -n $as_echo) 2>/dev/null`" = "X-n $as_echo"; then
54     as_echo_body='eval /usr/ucb/echo -n "$1$as_nl"'
55     as_echo_n='/usr/ucb/echo -n'
56   else
57     as_echo_body='eval expr "X$1" : "X\\(.*\\)"'
58     as_echo_n_body='eval
59       arg=$1;
60       case $arg in
61       *"$as_nl"*)
62         expr "X$arg" : "X\\(.*\\)$as_nl";
63         arg=`expr "X$arg" : ".*$as_nl\\(.*\\)"`;;
64       esac;
65       expr "X$arg" : "X\\(.*\\)" | tr -d "$as_nl"
66     '
67     export as_echo_n_body
68     as_echo_n='sh -c $as_echo_n_body as_echo'
69   fi
70   export as_echo_body
71   as_echo='sh -c $as_echo_body as_echo'
72 fi
73
74 # The user is always right.
75 if test "${PATH_SEPARATOR+set}" != set; then
76   PATH_SEPARATOR=:
77   (PATH='/bin;/bin'; FPATH=$PATH; sh -c :) >/dev/null 2>&1 && {
78     (PATH='/bin:/bin'; FPATH=$PATH; sh -c :) >/dev/null 2>&1 ||
79       PATH_SEPARATOR=';'
80   }
81 fi
82
83 # Support unset when possible.
84 if ( (MAIL=60; unset MAIL) || exit) >/dev/null 2>&1; then
85   as_unset=unset
86 else
87   as_unset=false
88 fi
89
90
91 # IFS
92 # We need space, tab and new line, in precisely that order.  Quoting is
93 # there to prevent editors from complaining about space-tab.
94 # (If _AS_PATH_WALK were called with IFS unset, it would disable word
95 # splitting by setting IFS to empty value.)
96 IFS=" ""        $as_nl"
97
98 # Find who we are.  Look in the path if we contain no directory separator.
99 case $0 in
100   *[\\/]* ) as_myself=$0 ;;
101   *) as_save_IFS=$IFS; IFS=$PATH_SEPARATOR
102 for as_dir in $PATH
103 do
104   IFS=$as_save_IFS
105   test -z "$as_dir" && as_dir=.
106   test -r "$as_dir/$0" && as_myself=$as_dir/$0 && break
107 done
108 IFS=$as_save_IFS
109
110      ;;
111 esac
112 # We did not find ourselves, most probably we were run as `sh COMMAND'
113 # in which case we are not to be found in the path.
114 if test "x$as_myself" = x; then
115   as_myself=$0
116 fi
117 if test ! -f "$as_myself"; then
118   $as_echo "$as_myself: error: cannot find myself; rerun with an absolute file name" >&2
119   { (exit 1); exit 1; }
120 fi
121
122 # Work around bugs in pre-3.0 UWIN ksh.
123 for as_var in ENV MAIL MAILPATH
124 do ($as_unset $as_var) >/dev/null 2>&1 && $as_unset $as_var
125 done
126 PS1='$ '
127 PS2='> '
128 PS4='+ '
129
130 # NLS nuisances.
131 LC_ALL=C
132 export LC_ALL
133 LANGUAGE=C
134 export LANGUAGE
135
136 # Required to use basename.
137 if expr a : '\(a\)' >/dev/null 2>&1 &&
138    test "X`expr 00001 : '.*\(...\)'`" = X001; then
139   as_expr=expr
140 else
141   as_expr=false
142 fi
143
144 if (basename -- /) >/dev/null 2>&1 && test "X`basename -- / 2>&1`" = "X/"; then
145   as_basename=basename
146 else
147   as_basename=false
148 fi
149
150
151 # Name of the executable.
152 as_me=`$as_basename -- "$0" ||
153 $as_expr X/"$0" : '.*/\([^/][^/]*\)/*$' \| \
154          X"$0" : 'X\(//\)$' \| \
155          X"$0" : 'X\(/\)' \| . 2>/dev/null ||
156 $as_echo X/"$0" |
157     sed '/^.*\/\([^/][^/]*\)\/*$/{
158             s//\1/
159             q
160           }
161           /^X\/\(\/\/\)$/{
162             s//\1/
163             q
164           }
165           /^X\/\(\/\).*/{
166             s//\1/
167             q
168           }
169           s/.*/./; q'`
170
171 # CDPATH.
172 $as_unset CDPATH
173
174
175
176   as_lineno_1=$LINENO
177   as_lineno_2=$LINENO
178   test "x$as_lineno_1" != "x$as_lineno_2" &&
179   test "x`expr $as_lineno_1 + 1`" = "x$as_lineno_2" || {
180
181   # Create $as_me.lineno as a copy of $as_myself, but with $LINENO
182   # uniformly replaced by the line number.  The first 'sed' inserts a
183   # line-number line after each line using $LINENO; the second 'sed'
184   # does the real work.  The second script uses 'N' to pair each
185   # line-number line with the line containing $LINENO, and appends
186   # trailing '-' during substitution so that $LINENO is not a special
187   # case at line end.
188   # (Raja R Harinath suggested sed '=', and Paul Eggert wrote the
189   # scripts with optimization help from Paolo Bonzini.  Blame Lee
190   # E. McMahon (1931-1989) for sed's syntax.  :-)
191   sed -n '
192     p
193     /[$]LINENO/=
194   ' <$as_myself |
195     sed '
196       s/[$]LINENO.*/&-/
197       t lineno
198       b
199       :lineno
200       N
201       :loop
202       s/[$]LINENO\([^'$as_cr_alnum'_].*\n\)\(.*\)/\2\1\2/
203       t loop
204       s/-\n.*//
205     ' >$as_me.lineno &&
206   chmod +x "$as_me.lineno" ||
207     { $as_echo "$as_me: error: cannot create $as_me.lineno; rerun with a POSIX shell" >&2
208    { (exit 1); exit 1; }; }
209
210   # Don't try to exec as it changes $[0], causing all sort of problems
211   # (the dirname of $[0] is not the place where we might find the
212   # original and so on.  Autoconf is especially sensitive to this).
213   . "./$as_me.lineno"
214   # Exit status is that of the last command.
215   exit
216 }
217
218
219 if (as_dir=`dirname -- /` && test "X$as_dir" = X/) >/dev/null 2>&1; then
220   as_dirname=dirname
221 else
222   as_dirname=false
223 fi
224
225 ECHO_C= ECHO_N= ECHO_T=
226 case `echo -n x` in
227 -n*)
228   case `echo 'x\c'` in
229   *c*) ECHO_T=' ';;     # ECHO_T is single tab character.
230   *)   ECHO_C='\c';;
231   esac;;
232 *)
233   ECHO_N='-n';;
234 esac
235 if expr a : '\(a\)' >/dev/null 2>&1 &&
236    test "X`expr 00001 : '.*\(...\)'`" = X001; then
237   as_expr=expr
238 else
239   as_expr=false
240 fi
241
242 rm -f conf$$ conf$$.exe conf$$.file
243 if test -d conf$$.dir; then
244   rm -f conf$$.dir/conf$$.file
245 else
246   rm -f conf$$.dir
247   mkdir conf$$.dir 2>/dev/null
248 fi
249 if (echo >conf$$.file) 2>/dev/null; then
250   if ln -s conf$$.file conf$$ 2>/dev/null; then
251     as_ln_s='ln -s'
252     # ... but there are two gotchas:
253     # 1) On MSYS, both `ln -s file dir' and `ln file dir' fail.
254     # 2) DJGPP < 2.04 has no symlinks; `ln -s' creates a wrapper executable.
255     # In both cases, we have to default to `cp -p'.
256     ln -s conf$$.file conf$$.dir 2>/dev/null && test ! -f conf$$.exe ||
257       as_ln_s='cp -p'
258   elif ln conf$$.file conf$$ 2>/dev/null; then
259     as_ln_s=ln
260   else
261     as_ln_s='cp -p'
262   fi
263 else
264   as_ln_s='cp -p'
265 fi
266 rm -f conf$$ conf$$.exe conf$$.dir/conf$$.file conf$$.file
267 rmdir conf$$.dir 2>/dev/null
268
269 if mkdir -p . 2>/dev/null; then
270   as_mkdir_p=:
271 else
272   test -d ./-p && rmdir ./-p
273   as_mkdir_p=false
274 fi
275
276 if test -x / >/dev/null 2>&1; then
277   as_test_x='test -x'
278 else
279   if ls -dL / >/dev/null 2>&1; then
280     as_ls_L_option=L
281   else
282     as_ls_L_option=
283   fi
284   as_test_x='
285     eval sh -c '\''
286       if test -d "$1"; then
287         test -d "$1/.";
288       else
289         case $1 in
290         -*)set "./$1";;
291         esac;
292         case `ls -ld'$as_ls_L_option' "$1" 2>/dev/null` in
293         ???[sx]*):;;*)false;;esac;fi
294     '\'' sh
295   '
296 fi
297 as_executable_p=$as_test_x
298
299 # Sed expression to map a string onto a valid CPP name.
300 as_tr_cpp="eval sed 'y%*$as_cr_letters%P$as_cr_LETTERS%;s%[^_$as_cr_alnum]%_%g'"
301
302 # Sed expression to map a string onto a valid variable name.
303 as_tr_sh="eval sed 'y%*+%pp%;s%[^_$as_cr_alnum]%_%g'"
304
305
306 exec 6>&1
307
308 # Save the log message, to keep $[0] and so on meaningful, and to
309 # report actual input values of CONFIG_FILES etc. instead of their
310 # values after options handling.
311 ac_log="
312 This file was extended by Clustal Omega $as_me 1.2.4, which was
313 generated by GNU Autoconf 2.63.  Invocation command line was
314
315   CONFIG_FILES    = $CONFIG_FILES
316   CONFIG_HEADERS  = $CONFIG_HEADERS
317   CONFIG_LINKS    = $CONFIG_LINKS
318   CONFIG_COMMANDS = $CONFIG_COMMANDS
319   $ $0 $@
320
321 on `(hostname || uname -n) 2>/dev/null | sed 1q`
322 "
323
324 # Files that config.status was made for.
325 config_files=" Makefile src/Makefile clustalo.pc Doxyfile src/clustal/Makefile src/hhalign/Makefile src/kmpp/Makefile src/squid/Makefile"
326 config_headers=" src/config.h"
327 config_commands=" src/clustal-omega-config.h depfiles libtool"
328
329 ac_cs_usage="\
330 \`$as_me' instantiates files from templates according to the
331 current configuration.
332
333 Usage: $0 [OPTION]... [FILE]...
334
335   -h, --help       print this help, then exit
336   -V, --version    print version number and configuration settings, then exit
337   -q, --quiet, --silent
338                    do not print progress messages
339   -d, --debug      don't remove temporary files
340       --recheck    update $as_me by reconfiguring in the same conditions
341       --file=FILE[:TEMPLATE]
342                    instantiate the configuration file FILE
343       --header=FILE[:TEMPLATE]
344                    instantiate the configuration header FILE
345
346 Configuration files:
347 $config_files
348
349 Configuration headers:
350 $config_headers
351
352 Configuration commands:
353 $config_commands
354
355 Report bugs to <bug-autoconf@gnu.org>."
356
357 ac_cs_version="\
358 Clustal Omega config.status 1.2.4
359 configured by ./configure, generated by GNU Autoconf 2.63,
360   with options \"\"
361
362 Copyright (C) 2008 Free Software Foundation, Inc.
363 This config.status script is free software; the Free Software Foundation
364 gives unlimited permission to copy, distribute and modify it."
365
366 ac_pwd='/homes/fmmarquesmadeira/Projects/jabaws/binaries/src/clustalo'
367 srcdir='.'
368 INSTALL='/usr/bin/install -c'
369 MKDIR_P='/bin/mkdir -p'
370 AWK='gawk'
371 test -n "$AWK" || AWK=awk
372 # The default lists apply if the user does not specify any file.
373 ac_need_defaults=:
374 while test $# != 0
375 do
376   case $1 in
377   --*=*)
378     ac_option=`expr "X$1" : 'X\([^=]*\)='`
379     ac_optarg=`expr "X$1" : 'X[^=]*=\(.*\)'`
380     ac_shift=:
381     ;;
382   *)
383     ac_option=$1
384     ac_optarg=$2
385     ac_shift=shift
386     ;;
387   esac
388
389   case $ac_option in
390   # Handling of the options.
391   -recheck | --recheck | --rechec | --reche | --rech | --rec | --re | --r)
392     ac_cs_recheck=: ;;
393   --version | --versio | --versi | --vers | --ver | --ve | --v | -V )
394     $as_echo "$ac_cs_version"; exit ;;
395   --debug | --debu | --deb | --de | --d | -d )
396     debug=: ;;
397   --file | --fil | --fi | --f )
398     $ac_shift
399     case $ac_optarg in
400     *\'*) ac_optarg=`$as_echo "$ac_optarg" | sed "s/'/'\\\\\\\\''/g"` ;;
401     esac
402     CONFIG_FILES="$CONFIG_FILES '$ac_optarg'"
403     ac_need_defaults=false;;
404   --header | --heade | --head | --hea )
405     $ac_shift
406     case $ac_optarg in
407     *\'*) ac_optarg=`$as_echo "$ac_optarg" | sed "s/'/'\\\\\\\\''/g"` ;;
408     esac
409     CONFIG_HEADERS="$CONFIG_HEADERS '$ac_optarg'"
410     ac_need_defaults=false;;
411   --he | --h)
412     # Conflict between --help and --header
413     { $as_echo "$as_me: error: ambiguous option: $1
414 Try \`$0 --help' for more information." >&2
415    { (exit 1); exit 1; }; };;
416   --help | --hel | -h )
417     $as_echo "$ac_cs_usage"; exit ;;
418   -q | -quiet | --quiet | --quie | --qui | --qu | --q \
419   | -silent | --silent | --silen | --sile | --sil | --si | --s)
420     ac_cs_silent=: ;;
421
422   # This is an error.
423   -*) { $as_echo "$as_me: error: unrecognized option: $1
424 Try \`$0 --help' for more information." >&2
425    { (exit 1); exit 1; }; } ;;
426
427   *) ac_config_targets="$ac_config_targets $1"
428      ac_need_defaults=false ;;
429
430   esac
431   shift
432 done
433
434 ac_configure_extra_args=
435
436 if $ac_cs_silent; then
437   exec 6>/dev/null
438   ac_configure_extra_args="$ac_configure_extra_args --silent"
439 fi
440
441 if $ac_cs_recheck; then
442   set X '/bin/sh' './configure'  $ac_configure_extra_args --no-create --no-recursion
443   shift
444   $as_echo "running CONFIG_SHELL=/bin/sh $*" >&6
445   CONFIG_SHELL='/bin/sh'
446   export CONFIG_SHELL
447   exec "$@"
448 fi
449
450 exec 5>>config.log
451 {
452   echo
453   sed 'h;s/./-/g;s/^.../## /;s/...$/ ##/;p;x;p;x' <<_ASBOX
454 ## Running $as_me. ##
455 _ASBOX
456   $as_echo "$ac_log"
457 } >&5
458
459 #
460 # INIT-COMMANDS
461 #
462 PACKAGE="clustal-omega"
463 AMDEP_TRUE="" ac_aux_dir="."
464
465
466 # The HP-UX ksh and POSIX shell print the target directory to stdout
467 # if CDPATH is set.
468 (unset CDPATH) >/dev/null 2>&1 && unset CDPATH
469
470 sed_quote_subst='s/\(["`$\\]\)/\\\1/g'
471 double_quote_subst='s/\(["`\\]\)/\\\1/g'
472 delay_variable_subst='s/\\\\\\\\\\\$/\\\\\\$/g'
473 macro_version='2.2.6'
474 macro_revision='1.3012'
475 enable_shared='yes'
476 enable_static='yes'
477 pic_mode='default'
478 enable_fast_install='yes'
479 host_alias=''
480 host='x86_64-unknown-linux-gnu'
481 host_os='linux-gnu'
482 build_alias=''
483 build='x86_64-unknown-linux-gnu'
484 build_os='linux-gnu'
485 SED='/bin/sed'
486 Xsed='/bin/sed -e 1s/^X//'
487 GREP='/bin/grep'
488 EGREP='/bin/grep -E'
489 FGREP='/bin/grep -F'
490 LD='/usr/bin/ld -m elf_x86_64'
491 NM='/usr/bin/nm -B'
492 LN_S='ln -s'
493 max_cmd_len='1966080'
494 ac_objext='o'
495 exeext=''
496 lt_unset='unset'
497 lt_SP2NL='tr \040 \012'
498 lt_NL2SP='tr \015\012 \040\040'
499 reload_flag=' -r'
500 reload_cmds='$LD$reload_flag -o $output$reload_objs'
501 OBJDUMP='objdump'
502 deplibs_check_method='pass_all'
503 file_magic_cmd='$MAGIC_CMD'
504 AR='ar'
505 AR_FLAGS='cru'
506 STRIP='strip'
507 RANLIB='ranlib'
508 old_postinstall_cmds='chmod 644 $oldlib~$RANLIB $oldlib'
509 old_postuninstall_cmds=''
510 old_archive_cmds='$AR $AR_FLAGS $oldlib$oldobjs~$RANLIB $oldlib'
511 CC='gcc'
512 CFLAGS='-g -O2'
513 compiler='g++'
514 GCC='yes'
515 lt_cv_sys_global_symbol_pipe='sed -n -e '\''s/^.*[       ]\([ABCDGIRSTW][ABCDGIRSTW]*\)[         ][      ]*\([_A-Za-z][_A-Za-z0-9]*\)$/\1 \2 \2/p'\'''
516 lt_cv_sys_global_symbol_to_cdecl='sed -n -e '\''s/^T .* \(.*\)$/extern int \1();/p'\'' -e '\''s/^[ABCDGIRSTW]* .* \(.*\)$/extern char \1;/p'\'''
517 lt_cv_sys_global_symbol_to_c_name_address='sed -n -e '\''s/^: \([^ ]*\) $/  {\"\1\", (void *) 0},/p'\'' -e '\''s/^[ABCDGIRSTW]* \([^ ]*\) \([^ ]*\)$/  {"\2", (void *) \&\2},/p'\'''
518 lt_cv_sys_global_symbol_to_c_name_address_lib_prefix='sed -n -e '\''s/^: \([^ ]*\) $/  {\"\1\", (void *) 0},/p'\'' -e '\''s/^[ABCDGIRSTW]* \([^ ]*\) \(lib[^ ]*\)$/  {"\2", (void *) \&\2},/p'\'' -e '\''s/^[ABCDGIRSTW]* \([^ ]*\) \([^ ]*\)$/  {"lib\2", (void *) \&\2},/p'\'''
519 objdir='.libs'
520 SHELL='/bin/sh'
521 ECHO='echo'
522 MAGIC_CMD='file'
523 lt_prog_compiler_no_builtin_flag=' -fno-builtin'
524 lt_prog_compiler_wl='-Wl,'
525 lt_prog_compiler_pic=' -fPIC -DPIC'
526 lt_prog_compiler_static='-static'
527 lt_cv_prog_compiler_c_o='yes'
528 need_locks='no'
529 DSYMUTIL=''
530 NMEDIT=''
531 LIPO=''
532 OTOOL=''
533 OTOOL64=''
534 libext='a'
535 shrext_cmds='.so'
536 extract_expsyms_cmds=''
537 archive_cmds_need_lc='no'
538 enable_shared_with_static_runtimes='no'
539 export_dynamic_flag_spec='${wl}--export-dynamic'
540 whole_archive_flag_spec='${wl}--whole-archive$convenience ${wl}--no-whole-archive'
541 compiler_needs_object='no'
542 old_archive_from_new_cmds=''
543 old_archive_from_expsyms_cmds=''
544 archive_cmds='$CC -shared $libobjs $deplibs $compiler_flags ${wl}-soname $wl$soname -o $lib'
545 archive_expsym_cmds='echo "{ global:" > $output_objdir/$libname.ver~
546             cat $export_symbols | sed -e "s/\(.*\)/\1;/" >> $output_objdir/$libname.ver~
547             echo "local: *; };" >> $output_objdir/$libname.ver~
548             $CC -shared $libobjs $deplibs $compiler_flags ${wl}-soname $wl$soname ${wl}-version-script ${wl}$output_objdir/$libname.ver -o $lib'
549 module_cmds=''
550 module_expsym_cmds=''
551 with_gnu_ld='yes'
552 allow_undefined_flag=''
553 no_undefined_flag=''
554 hardcode_libdir_flag_spec='${wl}-rpath ${wl}$libdir'
555 hardcode_libdir_flag_spec_ld=''
556 hardcode_libdir_separator=''
557 hardcode_direct='no'
558 hardcode_direct_absolute='no'
559 hardcode_minus_L='no'
560 hardcode_shlibpath_var='unsupported'
561 hardcode_automatic='no'
562 inherit_rpath='no'
563 link_all_deplibs='unknown'
564 fix_srcfile_path=''
565 always_export_symbols='no'
566 export_symbols_cmds='$NM $libobjs $convenience | $global_symbol_pipe | $SED '\''s/.* //'\'' | sort | uniq > $export_symbols'
567 exclude_expsyms='_GLOBAL_OFFSET_TABLE_|_GLOBAL__F[ID]_.*'
568 include_expsyms=''
569 prelink_cmds=''
570 file_list_spec=''
571 variables_saved_for_relink='PATH LD_LIBRARY_PATH LD_RUN_PATH GCC_EXEC_PREFIX COMPILER_PATH LIBRARY_PATH'
572 need_lib_prefix='no'
573 need_version='no'
574 version_type='linux'
575 runpath_var='LD_RUN_PATH'
576 shlibpath_var='LD_LIBRARY_PATH'
577 shlibpath_overrides_runpath='no'
578 libname_spec='lib$name'
579 library_names_spec='${libname}${release}${shared_ext}$versuffix ${libname}${release}${shared_ext}$major $libname${shared_ext}'
580 soname_spec='${libname}${release}${shared_ext}$major'
581 postinstall_cmds=''
582 postuninstall_cmds=''
583 finish_cmds='PATH="\$PATH:/sbin" ldconfig -n $libdir'
584 finish_eval=''
585 hardcode_into_libs='yes'
586 sys_lib_search_path_spec='/usr/lib/gcc/x86_64-redhat-linux/4.4.7 /usr/lib64 /lib64'
587 sys_lib_dlsearch_path_spec='/lib /usr/lib /usr/lib64/R/lib /usr/lib64/atlas /usr/lib64/mysql /usr/lib64/papi-4.1.3 /usr/lib64/papi-5.1.1/usr/lib /usr/lib64/qt-3.3/lib /opt/dell/srvadmin/lib64 /opt/dell/srvadmin/lib64/openmanage /opt/dell/srvadmin/lib64 /opt/dell/srvadmin/lib64 /opt/dell/srvadmin/lib64/srvadmin-isvc /opt/dell/srvadmin/lib64 /opt/dell/srvadmin/lib64/openmanage /opt/dell/srvadmin/lib64 /opt/dell/srvadmin/lib64/openmanage /usr/lib64/tcl8.5 /usr/lib/wine/ /usr/lib64/wine/ /usr/lib64/xulrunner '
588 hardcode_action='immediate'
589 enable_dlopen='unknown'
590 enable_dlopen_self='unknown'
591 enable_dlopen_self_static='unknown'
592 old_striplib='strip --strip-debug'
593 striplib='strip --strip-unneeded'
594 compiler_lib_search_dirs=''
595 predep_objects=''
596 postdep_objects=''
597 predeps=''
598 postdeps=''
599 compiler_lib_search_path=''
600 LD_CXX='/usr/bin/ld -m elf_x86_64'
601 old_archive_cmds_CXX='$AR $AR_FLAGS $oldlib$oldobjs~$RANLIB $oldlib'
602 compiler_CXX='g++'
603 GCC_CXX='yes'
604 lt_prog_compiler_no_builtin_flag_CXX=' -fno-builtin'
605 lt_prog_compiler_wl_CXX='-Wl,'
606 lt_prog_compiler_pic_CXX=' -fPIC -DPIC'
607 lt_prog_compiler_static_CXX='-static'
608 lt_cv_prog_compiler_c_o_CXX='yes'
609 archive_cmds_need_lc_CXX='no'
610 enable_shared_with_static_runtimes_CXX='no'
611 export_dynamic_flag_spec_CXX='${wl}--export-dynamic'
612 whole_archive_flag_spec_CXX='${wl}--whole-archive$convenience ${wl}--no-whole-archive'
613 compiler_needs_object_CXX='no'
614 old_archive_from_new_cmds_CXX=''
615 old_archive_from_expsyms_cmds_CXX=''
616 archive_cmds_CXX='$CC -shared -nostdlib $predep_objects $libobjs $deplibs $postdep_objects $compiler_flags ${wl}-soname $wl$soname -o $lib'
617 archive_expsym_cmds_CXX='$CC -shared -nostdlib $predep_objects $libobjs $deplibs $postdep_objects $compiler_flags ${wl}-soname $wl$soname ${wl}-retain-symbols-file $wl$export_symbols -o $lib'
618 module_cmds_CXX=''
619 module_expsym_cmds_CXX=''
620 with_gnu_ld_CXX='yes'
621 allow_undefined_flag_CXX=''
622 no_undefined_flag_CXX=''
623 hardcode_libdir_flag_spec_CXX='${wl}-rpath ${wl}$libdir'
624 hardcode_libdir_flag_spec_ld_CXX=''
625 hardcode_libdir_separator_CXX=''
626 hardcode_direct_CXX='no'
627 hardcode_direct_absolute_CXX='no'
628 hardcode_minus_L_CXX='no'
629 hardcode_shlibpath_var_CXX='unsupported'
630 hardcode_automatic_CXX='no'
631 inherit_rpath_CXX='no'
632 link_all_deplibs_CXX='no'
633 fix_srcfile_path_CXX=''
634 always_export_symbols_CXX='no'
635 export_symbols_cmds_CXX='$NM $libobjs $convenience | $global_symbol_pipe | $SED '\''s/.* //'\'' | sort | uniq > $export_symbols'
636 exclude_expsyms_CXX='_GLOBAL_OFFSET_TABLE_|_GLOBAL__F[ID]_.*'
637 include_expsyms_CXX=''
638 prelink_cmds_CXX=''
639 file_list_spec_CXX=''
640 hardcode_action_CXX='immediate'
641 compiler_lib_search_dirs_CXX='/usr/lib/gcc/x86_64-redhat-linux/4.4.7 /usr/lib/gcc/x86_64-redhat-linux/4.4.7 /usr/lib/gcc/x86_64-redhat-linux/4.4.7/../../../../lib64 /lib/../lib64 /usr/lib/../lib64 /usr/lib/gcc/x86_64-redhat-linux/4.4.7/../../..'
642 predep_objects_CXX='/usr/lib/gcc/x86_64-redhat-linux/4.4.7/../../../../lib64/crti.o /usr/lib/gcc/x86_64-redhat-linux/4.4.7/crtbeginS.o'
643 postdep_objects_CXX='/usr/lib/gcc/x86_64-redhat-linux/4.4.7/crtendS.o /usr/lib/gcc/x86_64-redhat-linux/4.4.7/../../../../lib64/crtn.o'
644 predeps_CXX=''
645 postdeps_CXX='-lstdc++ -lm -lgcc_s -lc -lgcc_s'
646 compiler_lib_search_path_CXX='-L/usr/lib/gcc/x86_64-redhat-linux/4.4.7 -L/usr/lib/gcc/x86_64-redhat-linux/4.4.7 -L/usr/lib/gcc/x86_64-redhat-linux/4.4.7/../../../../lib64 -L/lib/../lib64 -L/usr/lib/../lib64 -L/usr/lib/gcc/x86_64-redhat-linux/4.4.7/../../..'
647
648 LTCC='gcc'
649 LTCFLAGS='-g -O2'
650 compiler='gcc'
651
652 # Quote evaled strings.
653 for var in SED GREP EGREP FGREP LD NM LN_S lt_SP2NL lt_NL2SP reload_flag OBJDUMP deplibs_check_method file_magic_cmd AR AR_FLAGS STRIP RANLIB CC CFLAGS compiler lt_cv_sys_global_symbol_pipe lt_cv_sys_global_symbol_to_cdecl lt_cv_sys_global_symbol_to_c_name_address lt_cv_sys_global_symbol_to_c_name_address_lib_prefix SHELL ECHO lt_prog_compiler_no_builtin_flag lt_prog_compiler_wl lt_prog_compiler_pic lt_prog_compiler_static lt_cv_prog_compiler_c_o need_locks DSYMUTIL NMEDIT LIPO OTOOL OTOOL64 shrext_cmds export_dynamic_flag_spec whole_archive_flag_spec compiler_needs_object with_gnu_ld allow_undefined_flag no_undefined_flag hardcode_libdir_flag_spec hardcode_libdir_flag_spec_ld hardcode_libdir_separator fix_srcfile_path exclude_expsyms include_expsyms file_list_spec variables_saved_for_relink libname_spec library_names_spec soname_spec finish_eval old_striplib striplib compiler_lib_search_dirs predep_objects postdep_objects predeps postdeps compiler_lib_search_path LD_CXX compiler_CXX lt_prog_compiler_no_builtin_flag_CXX lt_prog_compiler_wl_CXX lt_prog_compiler_pic_CXX lt_prog_compiler_static_CXX lt_cv_prog_compiler_c_o_CXX export_dynamic_flag_spec_CXX whole_archive_flag_spec_CXX compiler_needs_object_CXX with_gnu_ld_CXX allow_undefined_flag_CXX no_undefined_flag_CXX hardcode_libdir_flag_spec_CXX hardcode_libdir_flag_spec_ld_CXX hardcode_libdir_separator_CXX fix_srcfile_path_CXX exclude_expsyms_CXX include_expsyms_CXX file_list_spec_CXX compiler_lib_search_dirs_CXX predep_objects_CXX postdep_objects_CXX predeps_CXX postdeps_CXX compiler_lib_search_path_CXX; do
654     case `eval \\$ECHO "X\\$$var"` in
655     *[\\\`\"\$]*)
656       eval "lt_$var=\\\"\`\$ECHO \"X\$$var\" | \$Xsed -e \"\$sed_quote_subst\"\`\\\""
657       ;;
658     *)
659       eval "lt_$var=\\\"\$$var\\\""
660       ;;
661     esac
662 done
663
664 # Double-quote double-evaled strings.
665 for var in reload_cmds old_postinstall_cmds old_postuninstall_cmds old_archive_cmds extract_expsyms_cmds old_archive_from_new_cmds old_archive_from_expsyms_cmds archive_cmds archive_expsym_cmds module_cmds module_expsym_cmds export_symbols_cmds prelink_cmds postinstall_cmds postuninstall_cmds finish_cmds sys_lib_search_path_spec sys_lib_dlsearch_path_spec old_archive_cmds_CXX old_archive_from_new_cmds_CXX old_archive_from_expsyms_cmds_CXX archive_cmds_CXX archive_expsym_cmds_CXX module_cmds_CXX module_expsym_cmds_CXX export_symbols_cmds_CXX prelink_cmds_CXX; do
666     case `eval \\$ECHO "X\\$$var"` in
667     *[\\\`\"\$]*)
668       eval "lt_$var=\\\"\`\$ECHO \"X\$$var\" | \$Xsed -e \"\$double_quote_subst\" -e \"\$sed_quote_subst\" -e \"\$delay_variable_subst\"\`\\\""
669       ;;
670     *)
671       eval "lt_$var=\\\"\$$var\\\""
672       ;;
673     esac
674 done
675
676 # Fix-up fallback echo if it was mangled by the above quoting rules.
677 case $lt_ECHO in
678 *'\$0 --fallback-echo"')  lt_ECHO=`$ECHO "X$lt_ECHO" | $Xsed -e 's/\\\\\\\$0 --fallback-echo"$/$0 --fallback-echo"/'`
679   ;;
680 esac
681
682 ac_aux_dir='.'
683 xsi_shell='yes'
684 lt_shell_append='yes'
685
686 # See if we are running on zsh, and set the options which allow our
687 # commands through without removal of \ escapes INIT.
688 if test -n "${ZSH_VERSION+set}" ; then
689    setopt NO_GLOB_SUBST
690 fi
691
692
693     PACKAGE='clustal-omega'
694     VERSION='1.2.4'
695     TIMESTAMP=''
696     RM='rm -f'
697     ofile='libtool'
698
699
700
701
702
703
704
705 # Handling of arguments.
706 for ac_config_target in $ac_config_targets
707 do
708   case $ac_config_target in
709     "src/config.h") CONFIG_HEADERS="$CONFIG_HEADERS src/config.h" ;;
710     "src/clustal-omega-config.h") CONFIG_COMMANDS="$CONFIG_COMMANDS src/clustal-omega-config.h" ;;
711     "depfiles") CONFIG_COMMANDS="$CONFIG_COMMANDS depfiles" ;;
712     "libtool") CONFIG_COMMANDS="$CONFIG_COMMANDS libtool" ;;
713     "Makefile") CONFIG_FILES="$CONFIG_FILES Makefile" ;;
714     "src/Makefile") CONFIG_FILES="$CONFIG_FILES src/Makefile" ;;
715     "clustalo.pc") CONFIG_FILES="$CONFIG_FILES clustalo.pc" ;;
716     "Doxyfile") CONFIG_FILES="$CONFIG_FILES Doxyfile" ;;
717     "src/clustal/Makefile") CONFIG_FILES="$CONFIG_FILES src/clustal/Makefile" ;;
718     "src/hhalign/Makefile") CONFIG_FILES="$CONFIG_FILES src/hhalign/Makefile" ;;
719     "src/kmpp/Makefile") CONFIG_FILES="$CONFIG_FILES src/kmpp/Makefile" ;;
720     "src/squid/Makefile") CONFIG_FILES="$CONFIG_FILES src/squid/Makefile" ;;
721
722   *) { { $as_echo "$as_me:$LINENO: error: invalid argument: $ac_config_target" >&5
723 $as_echo "$as_me: error: invalid argument: $ac_config_target" >&2;}
724    { (exit 1); exit 1; }; };;
725   esac
726 done
727
728
729 # If the user did not use the arguments to specify the items to instantiate,
730 # then the envvar interface is used.  Set only those that are not.
731 # We use the long form for the default assignment because of an extremely
732 # bizarre bug on SunOS 4.1.3.
733 if $ac_need_defaults; then
734   test "${CONFIG_FILES+set}" = set || CONFIG_FILES=$config_files
735   test "${CONFIG_HEADERS+set}" = set || CONFIG_HEADERS=$config_headers
736   test "${CONFIG_COMMANDS+set}" = set || CONFIG_COMMANDS=$config_commands
737 fi
738
739 # Have a temporary directory for convenience.  Make it in the build tree
740 # simply because there is no reason against having it here, and in addition,
741 # creating and moving files from /tmp can sometimes cause problems.
742 # Hook for its removal unless debugging.
743 # Note that there is a small window in which the directory will not be cleaned:
744 # after its creation but before its name has been assigned to `$tmp'.
745 $debug ||
746 {
747   tmp=
748   trap 'exit_status=$?
749   { test -z "$tmp" || test ! -d "$tmp" || rm -fr "$tmp"; } && exit $exit_status
750 ' 0
751   trap '{ (exit 1); exit 1; }' 1 2 13 15
752 }
753 # Create a (secure) tmp directory for tmp files.
754
755 {
756   tmp=`(umask 077 && mktemp -d "./confXXXXXX") 2>/dev/null` &&
757   test -n "$tmp" && test -d "$tmp"
758 }  ||
759 {
760   tmp=./conf$$-$RANDOM
761   (umask 077 && mkdir "$tmp")
762 } ||
763 {
764    $as_echo "$as_me: cannot create a temporary directory in ." >&2
765    { (exit 1); exit 1; }
766 }
767
768 # Set up the scripts for CONFIG_FILES section.
769 # No need to generate them if there are no CONFIG_FILES.
770 # This happens for instance with `./config.status config.h'.
771 if test -n "$CONFIG_FILES"; then
772
773
774 ac_cr='\r'
775 ac_cs_awk_cr=`$AWK 'BEGIN { print "a\rb" }' </dev/null 2>/dev/null`
776 if test "$ac_cs_awk_cr" = "a${ac_cr}b"; then
777   ac_cs_awk_cr='\\r'
778 else
779   ac_cs_awk_cr=$ac_cr
780 fi
781
782 echo 'BEGIN {' >"$tmp/subs1.awk" &&
783 cat >>"$tmp/subs1.awk" <<\_ACAWK &&
784 S["LTLIBOBJS"]=""
785 S["LIBOBJS"]=""
786 S["AM_LDFLAGS"]=""
787 S["AM_CFLAGS"]=" -O3"
788 S["AM_CXXFLAGS"]=" -O3"
789 S["OPENMP_CXXFLAGS"]="-fopenmp"
790 S["OPENMP_CFLAGS"]="-fopenmp"
791 S["CXXCPP"]="g++ -E"
792 S["am__fastdepCXX_FALSE"]="#"
793 S["am__fastdepCXX_TRUE"]=""
794 S["CXXDEPMODE"]="depmode=gcc3"
795 S["ac_ct_CXX"]="g++"
796 S["CXXFLAGS"]="-g -O2"
797 S["CXX"]="g++"
798 S["OTOOL64"]=""
799 S["OTOOL"]=""
800 S["LIPO"]=""
801 S["NMEDIT"]=""
802 S["DSYMUTIL"]=""
803 S["lt_ECHO"]="echo"
804 S["RANLIB"]="ranlib"
805 S["AR"]="ar"
806 S["OBJDUMP"]="objdump"
807 S["LN_S"]="ln -s"
808 S["NM"]="/usr/bin/nm -B"
809 S["ac_ct_DUMPBIN"]=""
810 S["DUMPBIN"]=""
811 S["LD"]="/usr/bin/ld -m elf_x86_64"
812 S["FGREP"]="/bin/grep -F"
813 S["SED"]="/bin/sed"
814 S["LIBTOOL"]="$(SHELL) $(top_builddir)/libtool"
815 S["host_os"]="linux-gnu"
816 S["host_vendor"]="unknown"
817 S["host_cpu"]="x86_64"
818 S["host"]="x86_64-unknown-linux-gnu"
819 S["build_os"]="linux-gnu"
820 S["build_vendor"]="unknown"
821 S["build_cpu"]="x86_64"
822 S["build"]="x86_64-unknown-linux-gnu"
823 S["EGREP"]="/bin/grep -E"
824 S["GREP"]="/bin/grep"
825 S["CPP"]="gcc -E"
826 S["am__fastdepCC_FALSE"]="#"
827 S["am__fastdepCC_TRUE"]=""
828 S["CCDEPMODE"]="depmode=gcc3"
829 S["AMDEPBACKSLASH"]="\\"
830 S["AMDEP_FALSE"]="#"
831 S["AMDEP_TRUE"]=""
832 S["am__quote"]=""
833 S["am__include"]="include"
834 S["DEPDIR"]=".deps"
835 S["OBJEXT"]="o"
836 S["EXEEXT"]=""
837 S["ac_ct_CC"]="gcc"
838 S["CPPFLAGS"]=""
839 S["LDFLAGS"]=""
840 S["CFLAGS"]="-g -O2"
841 S["CC"]="gcc"
842 S["am__untar"]="${AMTAR} xf -"
843 S["am__tar"]="${AMTAR} chof - \"$$tardir\""
844 S["AMTAR"]="${SHELL} /homes/fmmarquesmadeira/Projects/jabaws/binaries/src/clustalo/missing --run tar"
845 S["am__leading_dot"]="."
846 S["SET_MAKE"]=""
847 S["AWK"]="gawk"
848 S["mkdir_p"]="/bin/mkdir -p"
849 S["MKDIR_P"]="/bin/mkdir -p"
850 S["INSTALL_STRIP_PROGRAM"]="$(install_sh) -c -s"
851 S["STRIP"]="strip"
852 S["install_sh"]="$(SHELL) /homes/fmmarquesmadeira/Projects/jabaws/binaries/src/clustalo/install-sh"
853 S["MAKEINFO"]="${SHELL} /homes/fmmarquesmadeira/Projects/jabaws/binaries/src/clustalo/missing --run makeinfo"
854 S["AUTOHEADER"]="${SHELL} /homes/fmmarquesmadeira/Projects/jabaws/binaries/src/clustalo/missing --run autoheader"
855 S["AUTOMAKE"]="${SHELL} /homes/fmmarquesmadeira/Projects/jabaws/binaries/src/clustalo/missing --run automake-1.10"
856 S["AUTOCONF"]="${SHELL} /homes/fmmarquesmadeira/Projects/jabaws/binaries/src/clustalo/missing --run autoconf"
857 S["ACLOCAL"]="${SHELL} /homes/fmmarquesmadeira/Projects/jabaws/binaries/src/clustalo/missing --run aclocal-1.10"
858 S["VERSION"]="1.2.4"
859 S["PACKAGE"]="clustal-omega"
860 S["CYGPATH_W"]="echo"
861 S["am__isrc"]=""
862 S["INSTALL_DATA"]="${INSTALL} -m 644"
863 S["INSTALL_SCRIPT"]="${INSTALL}"
864 S["INSTALL_PROGRAM"]="${INSTALL}"
865 S["PACKAGE_CODENAME"]="AndreaGiacomo"
866 S["target_alias"]=""
867 S["host_alias"]=""
868 S["build_alias"]=""
869 S["LIBS"]="-largtable2 -lm "
870 S["ECHO_T"]=""
871 S["ECHO_N"]="-n"
872 S["ECHO_C"]=""
873 S["DEFS"]="-DHAVE_CONFIG_H"
874 S["mandir"]="${datarootdir}/man"
875 S["localedir"]="${datarootdir}/locale"
876 S["libdir"]="${exec_prefix}/lib"
877 S["psdir"]="${docdir}"
878 S["pdfdir"]="${docdir}"
879 S["dvidir"]="${docdir}"
880 S["htmldir"]="${docdir}"
881 S["infodir"]="${datarootdir}/info"
882 S["docdir"]="${datarootdir}/doc/${PACKAGE_TARNAME}"
883 S["oldincludedir"]="/usr/include"
884 S["includedir"]="${prefix}/include"
885 S["localstatedir"]="${prefix}/var"
886 S["sharedstatedir"]="${prefix}/com"
887 S["sysconfdir"]="${prefix}/etc"
888 S["datadir"]="${datarootdir}"
889 S["datarootdir"]="${prefix}/share"
890 S["libexecdir"]="${exec_prefix}/libexec"
891 S["sbindir"]="${exec_prefix}/sbin"
892 S["bindir"]="${exec_prefix}/bin"
893 S["program_transform_name"]="s,x,x,"
894 S["prefix"]="/usr/local"
895 S["exec_prefix"]="${prefix}"
896 S["PACKAGE_BUGREPORT"]="clustalw@ucd.ie"
897 S["PACKAGE_STRING"]="Clustal Omega 1.2.4"
898 S["PACKAGE_VERSION"]="1.2.4"
899 S["PACKAGE_TARNAME"]="clustal-omega"
900 S["PACKAGE_NAME"]="Clustal Omega"
901 S["PATH_SEPARATOR"]=":"
902 S["SHELL"]="/bin/sh"
903 _ACAWK
904 cat >>"$tmp/subs1.awk" <<_ACAWK &&
905   for (key in S) S_is_set[key] = 1
906   FS = "\a"
907
908 }
909 {
910   line = $ 0
911   nfields = split(line, field, "@")
912   substed = 0
913   len = length(field[1])
914   for (i = 2; i < nfields; i++) {
915     key = field[i]
916     keylen = length(key)
917     if (S_is_set[key]) {
918       value = S[key]
919       line = substr(line, 1, len) "" value "" substr(line, len + keylen + 3)
920       len += length(value) + length(field[++i])
921       substed = 1
922     } else
923       len += 1 + keylen
924   }
925
926   print line
927 }
928
929 _ACAWK
930 if sed "s/$ac_cr//" < /dev/null > /dev/null 2>&1; then
931   sed "s/$ac_cr\$//; s/$ac_cr/$ac_cs_awk_cr/g"
932 else
933   cat
934 fi < "$tmp/subs1.awk" > "$tmp/subs.awk" \
935   || { { $as_echo "$as_me:$LINENO: error: could not setup config files machinery" >&5
936 $as_echo "$as_me: error: could not setup config files machinery" >&2;}
937    { (exit 1); exit 1; }; }
938 fi # test -n "$CONFIG_FILES"
939
940 # Set up the scripts for CONFIG_HEADERS section.
941 # No need to generate them if there are no CONFIG_HEADERS.
942 # This happens for instance with `./config.status Makefile'.
943 if test -n "$CONFIG_HEADERS"; then
944 cat >"$tmp/defines.awk" <<\_ACAWK ||
945 BEGIN {
946 D["PACKAGE_NAME"]=" \"Clustal Omega\""
947 D["PACKAGE_TARNAME"]=" \"clustal-omega\""
948 D["PACKAGE_VERSION"]=" \"1.2.4\""
949 D["PACKAGE_STRING"]=" \"Clustal Omega 1.2.4\""
950 D["PACKAGE_BUGREPORT"]=" \"clustalw@ucd.ie\""
951 D["PACKAGE"]=" \"clustal-omega\""
952 D["VERSION"]=" \"1.2.4\""
953 D["STDC_HEADERS"]=" 1"
954 D["HAVE_SYS_TYPES_H"]=" 1"
955 D["HAVE_SYS_STAT_H"]=" 1"
956 D["HAVE_STDLIB_H"]=" 1"
957 D["HAVE_STRING_H"]=" 1"
958 D["HAVE_MEMORY_H"]=" 1"
959 D["HAVE_STRINGS_H"]=" 1"
960 D["HAVE_INTTYPES_H"]=" 1"
961 D["HAVE_STDINT_H"]=" 1"
962 D["HAVE_UNISTD_H"]=" 1"
963 D["__EXTENSIONS__"]=" 1"
964 D["_ALL_SOURCE"]=" 1"
965 D["_GNU_SOURCE"]=" 1"
966 D["_POSIX_PTHREAD_SEMANTICS"]=" 1"
967 D["_TANDEM_SOURCE"]=" 1"
968 D["HAVE_DLFCN_H"]=" 1"
969 D["LT_OBJDIR"]=" \".libs/\""
970 D["CLUSTALO"]=" 1"
971 D["PACKAGE_CODENAME"]=" \"AndreaGiacomo\""
972 D["LINUX"]=" 1"
973 D["STDC_HEADERS"]=" 1"
974 D["HAVE_ASSERT_H"]=" 1"
975 D["HAVE_CTYPE_H"]=" 1"
976 D["HAVE_FLOAT_H"]=" 1"
977 D["HAVE_LIMITS_H"]=" 1"
978 D["HAVE_MATH_H"]=" 1"
979 D["HAVE_MEMORY_H"]=" 1"
980 D["HAVE_STDARG_H"]=" 1"
981 D["HAVE_STDIO_H"]=" 1"
982 D["HAVE_STDLIB_H"]=" 1"
983 D["HAVE_STRING_H"]=" 1"
984 D["HAVE_TIME_H"]=" 1"
985 D["HAVE_UNISTD_H"]=" 1"
986 D["HAVE_LIBM"]=" 1"
987 D["HAVE_LOG2"]=" 1"
988 D["HAVE_ARGTABLE2_H"]=" 1"
989 D["HAVE_LIBARGTABLE2"]=" 1"
990 D["HAVE_OPENMP"]=" 1"
991 D["HAVE_NTOHS"]=" 1"
992 D["HAVE_NTOHL"]=" 1"
993 D["SIZEOF_UNSIGNED_SHORT"]=" 2"
994 D["SIZEOF_UNSIGNED_INT"]=" 4"
995 D["SIZEOF_UNSIGNED_LONG"]=" 8"
996 D["SIZEOF_UNSIGNED_LONG_LONG"]=" 8"
997 D["HAVE_STRTOULL"]=" 1"
998 D["HAVE_FTELLO"]=" 1"
999 D["HAVE_FSEEKO"]=" 1"
1000 D["HAVE_FTELLO64"]=" 1"
1001 D["HAVE_FSEEKO64"]=" 1"
1002 D["SIZEOF_FPOS_T"]=" 16"
1003 D["NDEBUG"]=" /**/"
1004   for (key in D) D_is_set[key] = 1
1005   FS = "\a"
1006 }
1007 /^[\t ]*#[\t ]*(define|undef)[\t ]+[_abcdefghijklmnopqrstuvwxyzABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ][_abcdefghijklmnopqrstuvwxyzABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ0123456789]*([\t (]|$)/ {
1008   line = $ 0
1009   split(line, arg, " ")
1010   if (arg[1] == "#") {
1011     defundef = arg[2]
1012     mac1 = arg[3]
1013   } else {
1014     defundef = substr(arg[1], 2)
1015     mac1 = arg[2]
1016   }
1017   split(mac1, mac2, "(") #)
1018   macro = mac2[1]
1019   prefix = substr(line, 1, index(line, defundef) - 1)
1020   if (D_is_set[macro]) {
1021     # Preserve the white space surrounding the "#".
1022     print prefix "define", macro P[macro] D[macro]
1023     next
1024   } else {
1025     # Replace #undef with comments.  This is necessary, for example,
1026     # in the case of _POSIX_SOURCE, which is predefined and required
1027     # on some systems where configure will not decide to define it.
1028     if (defundef == "undef") {
1029       print "/*", prefix defundef, macro, "*/"
1030       next
1031     }
1032   }
1033 }
1034 { print }
1035 _ACAWK
1036   { { $as_echo "$as_me:$LINENO: error: could not setup config headers machinery" >&5
1037 $as_echo "$as_me: error: could not setup config headers machinery" >&2;}
1038    { (exit 1); exit 1; }; }
1039 fi # test -n "$CONFIG_HEADERS"
1040
1041
1042 eval set X "  :F $CONFIG_FILES  :H $CONFIG_HEADERS    :C $CONFIG_COMMANDS"
1043 shift
1044 for ac_tag
1045 do
1046   case $ac_tag in
1047   :[FHLC]) ac_mode=$ac_tag; continue;;
1048   esac
1049   case $ac_mode$ac_tag in
1050   :[FHL]*:*);;
1051   :L* | :C*:*) { { $as_echo "$as_me:$LINENO: error: invalid tag $ac_tag" >&5
1052 $as_echo "$as_me: error: invalid tag $ac_tag" >&2;}
1053    { (exit 1); exit 1; }; };;
1054   :[FH]-) ac_tag=-:-;;
1055   :[FH]*) ac_tag=$ac_tag:$ac_tag.in;;
1056   esac
1057   ac_save_IFS=$IFS
1058   IFS=:
1059   set x $ac_tag
1060   IFS=$ac_save_IFS
1061   shift
1062   ac_file=$1
1063   shift
1064
1065   case $ac_mode in
1066   :L) ac_source=$1;;
1067   :[FH])
1068     ac_file_inputs=
1069     for ac_f
1070     do
1071       case $ac_f in
1072       -) ac_f="$tmp/stdin";;
1073       *) # Look for the file first in the build tree, then in the source tree
1074          # (if the path is not absolute).  The absolute path cannot be DOS-style,
1075          # because $ac_f cannot contain `:'.
1076          test -f "$ac_f" ||
1077            case $ac_f in
1078            [\\/$]*) false;;
1079            *) test -f "$srcdir/$ac_f" && ac_f="$srcdir/$ac_f";;
1080            esac ||
1081            { { $as_echo "$as_me:$LINENO: error: cannot find input file: $ac_f" >&5
1082 $as_echo "$as_me: error: cannot find input file: $ac_f" >&2;}
1083    { (exit 1); exit 1; }; };;
1084       esac
1085       case $ac_f in *\'*) ac_f=`$as_echo "$ac_f" | sed "s/'/'\\\\\\\\''/g"`;; esac
1086       ac_file_inputs="$ac_file_inputs '$ac_f'"
1087     done
1088
1089     # Let's still pretend it is `configure' which instantiates (i.e., don't
1090     # use $as_me), people would be surprised to read:
1091     #    /* config.h.  Generated by config.status.  */
1092     configure_input='Generated from '`
1093           $as_echo "$*" | sed 's|^[^:]*/||;s|:[^:]*/|, |g'
1094         `' by configure.'
1095     if test x"$ac_file" != x-; then
1096       configure_input="$ac_file.  $configure_input"
1097       { $as_echo "$as_me:$LINENO: creating $ac_file" >&5
1098 $as_echo "$as_me: creating $ac_file" >&6;}
1099     fi
1100     # Neutralize special characters interpreted by sed in replacement strings.
1101     case $configure_input in #(
1102     *\&* | *\|* | *\\* )
1103        ac_sed_conf_input=`$as_echo "$configure_input" |
1104        sed 's/[\\\\&|]/\\\\&/g'`;; #(
1105     *) ac_sed_conf_input=$configure_input;;
1106     esac
1107
1108     case $ac_tag in
1109     *:-:* | *:-) cat >"$tmp/stdin" \
1110       || { { $as_echo "$as_me:$LINENO: error: could not create $ac_file" >&5
1111 $as_echo "$as_me: error: could not create $ac_file" >&2;}
1112    { (exit 1); exit 1; }; } ;;
1113     esac
1114     ;;
1115   esac
1116
1117   ac_dir=`$as_dirname -- "$ac_file" ||
1118 $as_expr X"$ac_file" : 'X\(.*[^/]\)//*[^/][^/]*/*$' \| \
1119          X"$ac_file" : 'X\(//\)[^/]' \| \
1120          X"$ac_file" : 'X\(//\)$' \| \
1121          X"$ac_file" : 'X\(/\)' \| . 2>/dev/null ||
1122 $as_echo X"$ac_file" |
1123     sed '/^X\(.*[^/]\)\/\/*[^/][^/]*\/*$/{
1124             s//\1/
1125             q
1126           }
1127           /^X\(\/\/\)[^/].*/{
1128             s//\1/
1129             q
1130           }
1131           /^X\(\/\/\)$/{
1132             s//\1/
1133             q
1134           }
1135           /^X\(\/\).*/{
1136             s//\1/
1137             q
1138           }
1139           s/.*/./; q'`
1140   { as_dir="$ac_dir"
1141   case $as_dir in #(
1142   -*) as_dir=./$as_dir;;
1143   esac
1144   test -d "$as_dir" || { $as_mkdir_p && mkdir -p "$as_dir"; } || {
1145     as_dirs=
1146     while :; do
1147       case $as_dir in #(
1148       *\'*) as_qdir=`$as_echo "$as_dir" | sed "s/'/'\\\\\\\\''/g"`;; #'(
1149       *) as_qdir=$as_dir;;
1150       esac
1151       as_dirs="'$as_qdir' $as_dirs"
1152       as_dir=`$as_dirname -- "$as_dir" ||
1153 $as_expr X"$as_dir" : 'X\(.*[^/]\)//*[^/][^/]*/*$' \| \
1154          X"$as_dir" : 'X\(//\)[^/]' \| \
1155          X"$as_dir" : 'X\(//\)$' \| \
1156          X"$as_dir" : 'X\(/\)' \| . 2>/dev/null ||
1157 $as_echo X"$as_dir" |
1158     sed '/^X\(.*[^/]\)\/\/*[^/][^/]*\/*$/{
1159             s//\1/
1160             q
1161           }
1162           /^X\(\/\/\)[^/].*/{
1163             s//\1/
1164             q
1165           }
1166           /^X\(\/\/\)$/{
1167             s//\1/
1168             q
1169           }
1170           /^X\(\/\).*/{
1171             s//\1/
1172             q
1173           }
1174           s/.*/./; q'`
1175       test -d "$as_dir" && break
1176     done
1177     test -z "$as_dirs" || eval "mkdir $as_dirs"
1178   } || test -d "$as_dir" || { { $as_echo "$as_me:$LINENO: error: cannot create directory $as_dir" >&5
1179 $as_echo "$as_me: error: cannot create directory $as_dir" >&2;}
1180    { (exit 1); exit 1; }; }; }
1181   ac_builddir=.
1182
1183 case "$ac_dir" in
1184 .) ac_dir_suffix= ac_top_builddir_sub=. ac_top_build_prefix= ;;
1185 *)
1186   ac_dir_suffix=/`$as_echo "$ac_dir" | sed 's|^\.[\\/]||'`
1187   # A ".." for each directory in $ac_dir_suffix.
1188   ac_top_builddir_sub=`$as_echo "$ac_dir_suffix" | sed 's|/[^\\/]*|/..|g;s|/||'`
1189   case $ac_top_builddir_sub in
1190   "") ac_top_builddir_sub=. ac_top_build_prefix= ;;
1191   *)  ac_top_build_prefix=$ac_top_builddir_sub/ ;;
1192   esac ;;
1193 esac
1194 ac_abs_top_builddir=$ac_pwd
1195 ac_abs_builddir=$ac_pwd$ac_dir_suffix
1196 # for backward compatibility:
1197 ac_top_builddir=$ac_top_build_prefix
1198
1199 case $srcdir in
1200   .)  # We are building in place.
1201     ac_srcdir=.
1202     ac_top_srcdir=$ac_top_builddir_sub
1203     ac_abs_top_srcdir=$ac_pwd ;;
1204   [\\/]* | ?:[\\/]* )  # Absolute name.
1205     ac_srcdir=$srcdir$ac_dir_suffix;
1206     ac_top_srcdir=$srcdir
1207     ac_abs_top_srcdir=$srcdir ;;
1208   *) # Relative name.
1209     ac_srcdir=$ac_top_build_prefix$srcdir$ac_dir_suffix
1210     ac_top_srcdir=$ac_top_build_prefix$srcdir
1211     ac_abs_top_srcdir=$ac_pwd/$srcdir ;;
1212 esac
1213 ac_abs_srcdir=$ac_abs_top_srcdir$ac_dir_suffix
1214
1215
1216   case $ac_mode in
1217   :F)
1218   #
1219   # CONFIG_FILE
1220   #
1221
1222   case $INSTALL in
1223   [\\/$]* | ?:[\\/]* ) ac_INSTALL=$INSTALL ;;
1224   *) ac_INSTALL=$ac_top_build_prefix$INSTALL ;;
1225   esac
1226   ac_MKDIR_P=$MKDIR_P
1227   case $MKDIR_P in
1228   [\\/$]* | ?:[\\/]* ) ;;
1229   */*) ac_MKDIR_P=$ac_top_build_prefix$MKDIR_P ;;
1230   esac
1231 # If the template does not know about datarootdir, expand it.
1232 # FIXME: This hack should be removed a few years after 2.60.
1233 ac_datarootdir_hack=; ac_datarootdir_seen=
1234
1235 ac_sed_dataroot='
1236 /datarootdir/ {
1237   p
1238   q
1239 }
1240 /@datadir@/p
1241 /@docdir@/p
1242 /@infodir@/p
1243 /@localedir@/p
1244 /@mandir@/p
1245 '
1246 case `eval "sed -n \"\$ac_sed_dataroot\" $ac_file_inputs"` in
1247 *datarootdir*) ac_datarootdir_seen=yes;;
1248 *@datadir@*|*@docdir@*|*@infodir@*|*@localedir@*|*@mandir@*)
1249   { $as_echo "$as_me:$LINENO: WARNING: $ac_file_inputs seems to ignore the --datarootdir setting" >&5
1250 $as_echo "$as_me: WARNING: $ac_file_inputs seems to ignore the --datarootdir setting" >&2;}
1251   ac_datarootdir_hack='
1252   s&@datadir@&${datarootdir}&g
1253   s&@docdir@&${datarootdir}/doc/${PACKAGE_TARNAME}&g
1254   s&@infodir@&${datarootdir}/info&g
1255   s&@localedir@&${datarootdir}/locale&g
1256   s&@mandir@&${datarootdir}/man&g
1257     s&\${datarootdir}&${prefix}/share&g' ;;
1258 esac
1259 ac_sed_extra="/^[        ]*VPATH[        ]*=/{
1260 s/:*\$(srcdir):*/:/
1261 s/:*\${srcdir}:*/:/
1262 s/:*@srcdir@:*/:/
1263 s/^\([^=]*=[     ]*\):*/\1/
1264 s/:*$//
1265 s/^[^=]*=[       ]*$//
1266 }
1267
1268 :t
1269 /@[a-zA-Z_][a-zA-Z_0-9]*@/!b
1270 s|@configure_input@|$ac_sed_conf_input|;t t
1271 s&@top_builddir@&$ac_top_builddir_sub&;t t
1272 s&@top_build_prefix@&$ac_top_build_prefix&;t t
1273 s&@srcdir@&$ac_srcdir&;t t
1274 s&@abs_srcdir@&$ac_abs_srcdir&;t t
1275 s&@top_srcdir@&$ac_top_srcdir&;t t
1276 s&@abs_top_srcdir@&$ac_abs_top_srcdir&;t t
1277 s&@builddir@&$ac_builddir&;t t
1278 s&@abs_builddir@&$ac_abs_builddir&;t t
1279 s&@abs_top_builddir@&$ac_abs_top_builddir&;t t
1280 s&@INSTALL@&$ac_INSTALL&;t t
1281 s&@MKDIR_P@&$ac_MKDIR_P&;t t
1282 $ac_datarootdir_hack
1283 "
1284 eval sed \"\$ac_sed_extra\" "$ac_file_inputs" | $AWK -f "$tmp/subs.awk" >$tmp/out \
1285   || { { $as_echo "$as_me:$LINENO: error: could not create $ac_file" >&5
1286 $as_echo "$as_me: error: could not create $ac_file" >&2;}
1287    { (exit 1); exit 1; }; }
1288
1289 test -z "$ac_datarootdir_hack$ac_datarootdir_seen" &&
1290   { ac_out=`sed -n '/\${datarootdir}/p' "$tmp/out"`; test -n "$ac_out"; } &&
1291   { ac_out=`sed -n '/^[  ]*datarootdir[  ]*:*=/p' "$tmp/out"`; test -z "$ac_out"; } &&
1292   { $as_echo "$as_me:$LINENO: WARNING: $ac_file contains a reference to the variable \`datarootdir'
1293 which seems to be undefined.  Please make sure it is defined." >&5
1294 $as_echo "$as_me: WARNING: $ac_file contains a reference to the variable \`datarootdir'
1295 which seems to be undefined.  Please make sure it is defined." >&2;}
1296
1297   rm -f "$tmp/stdin"
1298   case $ac_file in
1299   -) cat "$tmp/out" && rm -f "$tmp/out";;
1300   *) rm -f "$ac_file" && mv "$tmp/out" "$ac_file";;
1301   esac \
1302   || { { $as_echo "$as_me:$LINENO: error: could not create $ac_file" >&5
1303 $as_echo "$as_me: error: could not create $ac_file" >&2;}
1304    { (exit 1); exit 1; }; }
1305  ;;
1306   :H)
1307   #
1308   # CONFIG_HEADER
1309   #
1310   if test x"$ac_file" != x-; then
1311     {
1312       $as_echo "/* $configure_input  */" \
1313       && eval '$AWK -f "$tmp/defines.awk"' "$ac_file_inputs"
1314     } >"$tmp/config.h" \
1315       || { { $as_echo "$as_me:$LINENO: error: could not create $ac_file" >&5
1316 $as_echo "$as_me: error: could not create $ac_file" >&2;}
1317    { (exit 1); exit 1; }; }
1318     if diff "$ac_file" "$tmp/config.h" >/dev/null 2>&1; then
1319       { $as_echo "$as_me:$LINENO: $ac_file is unchanged" >&5
1320 $as_echo "$as_me: $ac_file is unchanged" >&6;}
1321     else
1322       rm -f "$ac_file"
1323       mv "$tmp/config.h" "$ac_file" \
1324         || { { $as_echo "$as_me:$LINENO: error: could not create $ac_file" >&5
1325 $as_echo "$as_me: error: could not create $ac_file" >&2;}
1326    { (exit 1); exit 1; }; }
1327     fi
1328   else
1329     $as_echo "/* $configure_input  */" \
1330       && eval '$AWK -f "$tmp/defines.awk"' "$ac_file_inputs" \
1331       || { { $as_echo "$as_me:$LINENO: error: could not create -" >&5
1332 $as_echo "$as_me: error: could not create -" >&2;}
1333    { (exit 1); exit 1; }; }
1334   fi
1335 # Compute "$ac_file"'s index in $config_headers.
1336 _am_arg="$ac_file"
1337 _am_stamp_count=1
1338 for _am_header in $config_headers :; do
1339   case $_am_header in
1340     $_am_arg | $_am_arg:* )
1341       break ;;
1342     * )
1343       _am_stamp_count=`expr $_am_stamp_count + 1` ;;
1344   esac
1345 done
1346 echo "timestamp for $_am_arg" >`$as_dirname -- "$_am_arg" ||
1347 $as_expr X"$_am_arg" : 'X\(.*[^/]\)//*[^/][^/]*/*$' \| \
1348          X"$_am_arg" : 'X\(//\)[^/]' \| \
1349          X"$_am_arg" : 'X\(//\)$' \| \
1350          X"$_am_arg" : 'X\(/\)' \| . 2>/dev/null ||
1351 $as_echo X"$_am_arg" |
1352     sed '/^X\(.*[^/]\)\/\/*[^/][^/]*\/*$/{
1353             s//\1/
1354             q
1355           }
1356           /^X\(\/\/\)[^/].*/{
1357             s//\1/
1358             q
1359           }
1360           /^X\(\/\/\)$/{
1361             s//\1/
1362             q
1363           }
1364           /^X\(\/\).*/{
1365             s//\1/
1366             q
1367           }
1368           s/.*/./; q'`/stamp-h$_am_stamp_count
1369  ;;
1370
1371   :C)  { $as_echo "$as_me:$LINENO: executing $ac_file commands" >&5
1372 $as_echo "$as_me: executing $ac_file commands" >&6;}
1373  ;;
1374   esac
1375
1376
1377   case $ac_file$ac_mode in
1378     "src/clustal-omega-config.h":C) ac_prefix_conf_OUT=`echo src/clustal-omega-config.h`
1379 ac_prefix_conf_DEF=`echo _$ac_prefix_conf_OUT | sed -e "y:abcdefghijklmnopqrstuvwxyz:ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ:" -e "s/[^abcdefghijklmnopqrstuvwxyzABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ]/_/g"`
1380 ac_prefix_conf_PKG=`echo $PACKAGE`
1381 ac_prefix_conf_LOW=`echo _$ac_prefix_conf_PKG | sed -e "y:ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ-:abcdefghijklmnopqrstuvwxyz_:"`
1382 ac_prefix_conf_UPP=`echo $ac_prefix_conf_PKG | sed -e "y:abcdefghijklmnopqrstuvwxyz-:ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ_:"  -e "/^[0123456789]/s/^/_/"`
1383 ac_prefix_conf_INP=`echo "" | sed -e 's/ *//'`
1384 if test ".$ac_prefix_conf_INP" = "."; then
1385    for ac_file in : $CONFIG_HEADERS; do test "_$ac_file" = _: && continue
1386      case "$ac_file" in
1387         *.h) ac_prefix_conf_INP=$ac_file ;;
1388         *)
1389      esac
1390      test ".$ac_prefix_conf_INP" != "." && break
1391    done
1392 fi
1393 if test ".$ac_prefix_conf_INP" = "."; then
1394    case "$ac_prefix_conf_OUT" in
1395       */*) ac_prefix_conf_INP=`basename "$ac_prefix_conf_OUT"`
1396       ;;
1397       *-*) ac_prefix_conf_INP=`echo "$ac_prefix_conf_OUT" | sed -e "s/[abcdefghijklmnopqrstuvwxyzABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ0123456789_]*-//"`
1398       ;;
1399       *) ac_prefix_conf_INP=config.h
1400       ;;
1401    esac
1402 fi
1403 if test -z "$ac_prefix_conf_PKG" ; then
1404    { { $as_echo "$as_me:$LINENO: error: no prefix for _PREFIX_PKG_CONFIG_H" >&5
1405 $as_echo "$as_me: error: no prefix for _PREFIX_PKG_CONFIG_H" >&2;}
1406    { (exit 1); exit 1; }; }
1407 else
1408   if test ! -f "$ac_prefix_conf_INP" ; then if test -f "$srcdir/$ac_prefix_conf_INP" ; then
1409      ac_prefix_conf_INP="$srcdir/$ac_prefix_conf_INP"
1410   fi fi
1411   { $as_echo "$as_me:$LINENO: creating $ac_prefix_conf_OUT - prefix $ac_prefix_conf_UPP for $ac_prefix_conf_INP defines" >&5
1412 $as_echo "$as_me: creating $ac_prefix_conf_OUT - prefix $ac_prefix_conf_UPP for $ac_prefix_conf_INP defines" >&6;}
1413   if test -f $ac_prefix_conf_INP ; then
1414     $as_echo "s/^#undef  *\\([ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ_]\\)/#undef $ac_prefix_conf_UPP""_\\1/" > conftest.prefix
1415     $as_echo "s/^#undef  *\\([abcdefghijklmnopqrstuvwxyz]\\)/#undef $ac_prefix_conf_LOW""_\\1/" >> conftest.prefix
1416     $as_echo "s/^#define  *\\([ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ_][abcdefghijklmnopqrstuvwxyzABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ0123456789_]*\\)\\(.*\\)/#ifndef $ac_prefix_conf_UPP""_\\1\\" >> conftest.prefix
1417     $as_echo "#define $ac_prefix_conf_UPP""_\\1\\2\\" >> conftest.prefix
1418     $as_echo "#endif/" >> conftest.prefix
1419     $as_echo "s/^#define  *\\([abcdefghijklmnopqrstuvwxyz][abcdefghijklmnopqrstuvwxyzABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ0123456789_]*\\)\\(.*\\)/#ifndef $ac_prefix_conf_LOW""_\\1\\" >> conftest.prefix
1420     $as_echo "#define $ac_prefix_conf_LOW""_\\1\\2\\" >> conftest.prefix
1421     $as_echo "#endif/" >> conftest.prefix
1422     # now executing _script on _DEF input to create _OUT output file
1423     echo "#ifndef $ac_prefix_conf_DEF"      >$tmp/pconfig.h
1424     echo "#define $ac_prefix_conf_DEF 1" >>$tmp/pconfig.h
1425     echo ' ' >>$tmp/pconfig.h
1426     echo /'*' $ac_prefix_conf_OUT. Generated automatically at end of configure. '*'/ >>$tmp/pconfig.h
1427
1428     sed -f conftest.prefix $ac_prefix_conf_INP >>$tmp/pconfig.h
1429     echo ' ' >>$tmp/pconfig.h
1430     echo '/* once:' $ac_prefix_conf_DEF '*/' >>$tmp/pconfig.h
1431     echo "#endif" >>$tmp/pconfig.h
1432     if cmp -s $ac_prefix_conf_OUT $tmp/pconfig.h 2>/dev/null; then
1433       { $as_echo "$as_me:$LINENO: $ac_prefix_conf_OUT is unchanged" >&5
1434 $as_echo "$as_me: $ac_prefix_conf_OUT is unchanged" >&6;}
1435     else
1436       ac_dir=`$as_dirname -- "$ac_prefix_conf_OUT" ||
1437 $as_expr X"$ac_prefix_conf_OUT" : 'X\(.*[^/]\)//*[^/][^/]*/*$' \| \
1438          X"$ac_prefix_conf_OUT" : 'X\(//\)[^/]' \| \
1439          X"$ac_prefix_conf_OUT" : 'X\(//\)$' \| \
1440          X"$ac_prefix_conf_OUT" : 'X\(/\)' \| . 2>/dev/null ||
1441 $as_echo X"$ac_prefix_conf_OUT" |
1442     sed '/^X\(.*[^/]\)\/\/*[^/][^/]*\/*$/{
1443             s//\1/
1444             q
1445           }
1446           /^X\(\/\/\)[^/].*/{
1447             s//\1/
1448             q
1449           }
1450           /^X\(\/\/\)$/{
1451             s//\1/
1452             q
1453           }
1454           /^X\(\/\).*/{
1455             s//\1/
1456             q
1457           }
1458           s/.*/./; q'`
1459       { as_dir="$ac_dir"
1460   case $as_dir in #(
1461   -*) as_dir=./$as_dir;;
1462   esac
1463   test -d "$as_dir" || { $as_mkdir_p && mkdir -p "$as_dir"; } || {
1464     as_dirs=
1465     while :; do
1466       case $as_dir in #(
1467       *\'*) as_qdir=`$as_echo "$as_dir" | sed "s/'/'\\\\\\\\''/g"`;; #'(
1468       *) as_qdir=$as_dir;;
1469       esac
1470       as_dirs="'$as_qdir' $as_dirs"
1471       as_dir=`$as_dirname -- "$as_dir" ||
1472 $as_expr X"$as_dir" : 'X\(.*[^/]\)//*[^/][^/]*/*$' \| \
1473          X"$as_dir" : 'X\(//\)[^/]' \| \
1474          X"$as_dir" : 'X\(//\)$' \| \
1475          X"$as_dir" : 'X\(/\)' \| . 2>/dev/null ||
1476 $as_echo X"$as_dir" |
1477     sed '/^X\(.*[^/]\)\/\/*[^/][^/]*\/*$/{
1478             s//\1/
1479             q
1480           }
1481           /^X\(\/\/\)[^/].*/{
1482             s//\1/
1483             q
1484           }
1485           /^X\(\/\/\)$/{
1486             s//\1/
1487             q
1488           }
1489           /^X\(\/\).*/{
1490             s//\1/
1491             q
1492           }
1493           s/.*/./; q'`
1494       test -d "$as_dir" && break
1495     done
1496     test -z "$as_dirs" || eval "mkdir $as_dirs"
1497   } || test -d "$as_dir" || { { $as_echo "$as_me:$LINENO: error: cannot create directory $as_dir" >&5
1498 $as_echo "$as_me: error: cannot create directory $as_dir" >&2;}
1499    { (exit 1); exit 1; }; }; }
1500       rm -f "$ac_prefix_conf_OUT"
1501       mv $tmp/pconfig.h "$ac_prefix_conf_OUT"
1502     fi
1503     cp conftest.prefix _configs.sed
1504   else
1505     { { $as_echo "$as_me:$LINENO: error: input file $ac_prefix_conf_INP does not exist - skip generating $ac_prefix_conf_OUT" >&5
1506 $as_echo "$as_me: error: input file $ac_prefix_conf_INP does not exist - skip generating $ac_prefix_conf_OUT" >&2;}
1507    { (exit 1); exit 1; }; }
1508   fi
1509   rm -f conftest.*
1510 fi
1511  ;;
1512     "depfiles":C) test x"$AMDEP_TRUE" != x"" || {
1513   # Autoconf 2.62 quotes --file arguments for eval, but not when files
1514   # are listed without --file.  Let's play safe and only enable the eval
1515   # if we detect the quoting.
1516   case $CONFIG_FILES in
1517   *\'*) eval set x "$CONFIG_FILES" ;;
1518   *)   set x $CONFIG_FILES ;;
1519   esac
1520   shift
1521   for mf
1522   do
1523     # Strip MF so we end up with the name of the file.
1524     mf=`echo "$mf" | sed -e 's/:.*$//'`
1525     # Check whether this is an Automake generated Makefile or not.
1526     # We used to match only the files named `Makefile.in', but
1527     # some people rename them; so instead we look at the file content.
1528     # Grep'ing the first line is not enough: some people post-process
1529     # each Makefile.in and add a new line on top of each file to say so.
1530     # Grep'ing the whole file is not good either: AIX grep has a line
1531     # limit of 2048, but all sed's we know have understand at least 4000.
1532     if sed -n 's,^#.*generated by automake.*,X,p' "$mf" | grep X >/dev/null 2>&1; then
1533       dirpart=`$as_dirname -- "$mf" ||
1534 $as_expr X"$mf" : 'X\(.*[^/]\)//*[^/][^/]*/*$' \| \
1535          X"$mf" : 'X\(//\)[^/]' \| \
1536          X"$mf" : 'X\(//\)$' \| \
1537          X"$mf" : 'X\(/\)' \| . 2>/dev/null ||
1538 $as_echo X"$mf" |
1539     sed '/^X\(.*[^/]\)\/\/*[^/][^/]*\/*$/{
1540             s//\1/
1541             q
1542           }
1543           /^X\(\/\/\)[^/].*/{
1544             s//\1/
1545             q
1546           }
1547           /^X\(\/\/\)$/{
1548             s//\1/
1549             q
1550           }
1551           /^X\(\/\).*/{
1552             s//\1/
1553             q
1554           }
1555           s/.*/./; q'`
1556     else
1557       continue
1558     fi
1559     # Extract the definition of DEPDIR, am__include, and am__quote
1560     # from the Makefile without running `make'.
1561     DEPDIR=`sed -n 's/^DEPDIR = //p' < "$mf"`
1562     test -z "$DEPDIR" && continue
1563     am__include=`sed -n 's/^am__include = //p' < "$mf"`
1564     test -z "am__include" && continue
1565     am__quote=`sed -n 's/^am__quote = //p' < "$mf"`
1566     # When using ansi2knr, U may be empty or an underscore; expand it
1567     U=`sed -n 's/^U = //p' < "$mf"`
1568     # Find all dependency output files, they are included files with
1569     # $(DEPDIR) in their names.  We invoke sed twice because it is the
1570     # simplest approach to changing $(DEPDIR) to its actual value in the
1571     # expansion.
1572     for file in `sed -n "
1573       s/^$am__include $am__quote\(.*(DEPDIR).*\)$am__quote"'$/\1/p' <"$mf" | \
1574          sed -e 's/\$(DEPDIR)/'"$DEPDIR"'/g' -e 's/\$U/'"$U"'/g'`; do
1575       # Make sure the directory exists.
1576       test -f "$dirpart/$file" && continue
1577       fdir=`$as_dirname -- "$file" ||
1578 $as_expr X"$file" : 'X\(.*[^/]\)//*[^/][^/]*/*$' \| \
1579          X"$file" : 'X\(//\)[^/]' \| \
1580          X"$file" : 'X\(//\)$' \| \
1581          X"$file" : 'X\(/\)' \| . 2>/dev/null ||
1582 $as_echo X"$file" |
1583     sed '/^X\(.*[^/]\)\/\/*[^/][^/]*\/*$/{
1584             s//\1/
1585             q
1586           }
1587           /^X\(\/\/\)[^/].*/{
1588             s//\1/
1589             q
1590           }
1591           /^X\(\/\/\)$/{
1592             s//\1/
1593             q
1594           }
1595           /^X\(\/\).*/{
1596             s//\1/
1597             q
1598           }
1599           s/.*/./; q'`
1600       { as_dir=$dirpart/$fdir
1601   case $as_dir in #(
1602   -*) as_dir=./$as_dir;;
1603   esac
1604   test -d "$as_dir" || { $as_mkdir_p && mkdir -p "$as_dir"; } || {
1605     as_dirs=
1606     while :; do
1607       case $as_dir in #(
1608       *\'*) as_qdir=`$as_echo "$as_dir" | sed "s/'/'\\\\\\\\''/g"`;; #'(
1609       *) as_qdir=$as_dir;;
1610       esac
1611       as_dirs="'$as_qdir' $as_dirs"
1612       as_dir=`$as_dirname -- "$as_dir" ||
1613 $as_expr X"$as_dir" : 'X\(.*[^/]\)//*[^/][^/]*/*$' \| \
1614          X"$as_dir" : 'X\(//\)[^/]' \| \
1615          X"$as_dir" : 'X\(//\)$' \| \
1616          X"$as_dir" : 'X\(/\)' \| . 2>/dev/null ||
1617 $as_echo X"$as_dir" |
1618     sed '/^X\(.*[^/]\)\/\/*[^/][^/]*\/*$/{
1619             s//\1/
1620             q
1621           }
1622           /^X\(\/\/\)[^/].*/{
1623             s//\1/
1624             q
1625           }
1626           /^X\(\/\/\)$/{
1627             s//\1/
1628             q
1629           }
1630           /^X\(\/\).*/{
1631             s//\1/
1632             q
1633           }
1634           s/.*/./; q'`
1635       test -d "$as_dir" && break
1636     done
1637     test -z "$as_dirs" || eval "mkdir $as_dirs"
1638   } || test -d "$as_dir" || { { $as_echo "$as_me:$LINENO: error: cannot create directory $as_dir" >&5
1639 $as_echo "$as_me: error: cannot create directory $as_dir" >&2;}
1640    { (exit 1); exit 1; }; }; }
1641       # echo "creating $dirpart/$file"
1642       echo '# dummy' > "$dirpart/$file"
1643     done
1644   done
1645 }
1646  ;;
1647     "libtool":C)
1648
1649     # See if we are running on zsh, and set the options which allow our
1650     # commands through without removal of \ escapes.
1651     if test -n "${ZSH_VERSION+set}" ; then
1652       setopt NO_GLOB_SUBST
1653     fi
1654
1655     cfgfile="${ofile}T"
1656     trap "$RM \"$cfgfile\"; exit 1" 1 2 15
1657     $RM "$cfgfile"
1658
1659     cat <<_LT_EOF >> "$cfgfile"
1660 #! $SHELL
1661
1662 # `$ECHO "$ofile" | sed 's%^.*/%%'` - Provide generalized library-building support services.
1663 # Generated automatically by $as_me ($PACKAGE$TIMESTAMP) $VERSION
1664 # Libtool was configured on host `(hostname || uname -n) 2>/dev/null | sed 1q`:
1665 # NOTE: Changes made to this file will be lost: look at ltmain.sh.
1666 #
1667 #   Copyright (C) 1996, 1997, 1998, 1999, 2000, 2001, 2003, 2004, 2005,
1668 #                 2006, 2007, 2008 Free Software Foundation, Inc.
1669 #   Written by Gordon Matzigkeit, 1996
1670 #
1671 #   This file is part of GNU Libtool.
1672 #
1673 # GNU Libtool is free software; you can redistribute it and/or
1674 # modify it under the terms of the GNU General Public License as
1675 # published by the Free Software Foundation; either version 2 of
1676 # the License, or (at your option) any later version.
1677 #
1678 # As a special exception to the GNU General Public License,
1679 # if you distribute this file as part of a program or library that
1680 # is built using GNU Libtool, you may include this file under the
1681 # same distribution terms that you use for the rest of that program.
1682 #
1683 # GNU Libtool is distributed in the hope that it will be useful,
1684 # but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
1685 # MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
1686 # GNU General Public License for more details.
1687 #
1688 # You should have received a copy of the GNU General Public License
1689 # along with GNU Libtool; see the file COPYING.  If not, a copy
1690 # can be downloaded from http://www.gnu.org/licenses/gpl.html, or
1691 # obtained by writing to the Free Software Foundation, Inc.,
1692 # 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA.
1693
1694
1695 # The names of the tagged configurations supported by this script.
1696 available_tags="CXX "
1697
1698 # ### BEGIN LIBTOOL CONFIG
1699
1700 # Which release of libtool.m4 was used?
1701 macro_version=$macro_version
1702 macro_revision=$macro_revision
1703
1704 # Whether or not to build shared libraries.
1705 build_libtool_libs=$enable_shared
1706
1707 # Whether or not to build static libraries.
1708 build_old_libs=$enable_static
1709
1710 # What type of objects to build.
1711 pic_mode=$pic_mode
1712
1713 # Whether or not to optimize for fast installation.
1714 fast_install=$enable_fast_install
1715
1716 # The host system.
1717 host_alias=$host_alias
1718 host=$host
1719 host_os=$host_os
1720
1721 # The build system.
1722 build_alias=$build_alias
1723 build=$build
1724 build_os=$build_os
1725
1726 # A sed program that does not truncate output.
1727 SED=$lt_SED
1728
1729 # Sed that helps us avoid accidentally triggering echo(1) options like -n.
1730 Xsed="\$SED -e 1s/^X//"
1731
1732 # A grep program that handles long lines.
1733 GREP=$lt_GREP
1734
1735 # An ERE matcher.
1736 EGREP=$lt_EGREP
1737
1738 # A literal string matcher.
1739 FGREP=$lt_FGREP
1740
1741 # A BSD- or MS-compatible name lister.
1742 NM=$lt_NM
1743
1744 # Whether we need soft or hard links.
1745 LN_S=$lt_LN_S
1746
1747 # What is the maximum length of a command?
1748 max_cmd_len=$max_cmd_len
1749
1750 # Object file suffix (normally "o").
1751 objext=$ac_objext
1752
1753 # Executable file suffix (normally "").
1754 exeext=$exeext
1755
1756 # whether the shell understands "unset".
1757 lt_unset=$lt_unset
1758
1759 # turn spaces into newlines.
1760 SP2NL=$lt_lt_SP2NL
1761
1762 # turn newlines into spaces.
1763 NL2SP=$lt_lt_NL2SP
1764
1765 # How to create reloadable object files.
1766 reload_flag=$lt_reload_flag
1767 reload_cmds=$lt_reload_cmds
1768
1769 # An object symbol dumper.
1770 OBJDUMP=$lt_OBJDUMP
1771
1772 # Method to check whether dependent libraries are shared objects.
1773 deplibs_check_method=$lt_deplibs_check_method
1774
1775 # Command to use when deplibs_check_method == "file_magic".
1776 file_magic_cmd=$lt_file_magic_cmd
1777
1778 # The archiver.
1779 AR=$lt_AR
1780 AR_FLAGS=$lt_AR_FLAGS
1781
1782 # A symbol stripping program.
1783 STRIP=$lt_STRIP
1784
1785 # Commands used to install an old-style archive.
1786 RANLIB=$lt_RANLIB
1787 old_postinstall_cmds=$lt_old_postinstall_cmds
1788 old_postuninstall_cmds=$lt_old_postuninstall_cmds
1789
1790 # A C compiler.
1791 LTCC=$lt_CC
1792
1793 # LTCC compiler flags.
1794 LTCFLAGS=$lt_CFLAGS
1795
1796 # Take the output of nm and produce a listing of raw symbols and C names.
1797 global_symbol_pipe=$lt_lt_cv_sys_global_symbol_pipe
1798
1799 # Transform the output of nm in a proper C declaration.
1800 global_symbol_to_cdecl=$lt_lt_cv_sys_global_symbol_to_cdecl
1801
1802 # Transform the output of nm in a C name address pair.
1803 global_symbol_to_c_name_address=$lt_lt_cv_sys_global_symbol_to_c_name_address
1804
1805 # Transform the output of nm in a C name address pair when lib prefix is needed.
1806 global_symbol_to_c_name_address_lib_prefix=$lt_lt_cv_sys_global_symbol_to_c_name_address_lib_prefix
1807
1808 # The name of the directory that contains temporary libtool files.
1809 objdir=$objdir
1810
1811 # Shell to use when invoking shell scripts.
1812 SHELL=$lt_SHELL
1813
1814 # An echo program that does not interpret backslashes.
1815 ECHO=$lt_ECHO
1816
1817 # Used to examine libraries when file_magic_cmd begins with "file".
1818 MAGIC_CMD=$MAGIC_CMD
1819
1820 # Must we lock files when doing compilation?
1821 need_locks=$lt_need_locks
1822
1823 # Tool to manipulate archived DWARF debug symbol files on Mac OS X.
1824 DSYMUTIL=$lt_DSYMUTIL
1825
1826 # Tool to change global to local symbols on Mac OS X.
1827 NMEDIT=$lt_NMEDIT
1828
1829 # Tool to manipulate fat objects and archives on Mac OS X.
1830 LIPO=$lt_LIPO
1831
1832 # ldd/readelf like tool for Mach-O binaries on Mac OS X.
1833 OTOOL=$lt_OTOOL
1834
1835 # ldd/readelf like tool for 64 bit Mach-O binaries on Mac OS X 10.4.
1836 OTOOL64=$lt_OTOOL64
1837
1838 # Old archive suffix (normally "a").
1839 libext=$libext
1840
1841 # Shared library suffix (normally ".so").
1842 shrext_cmds=$lt_shrext_cmds
1843
1844 # The commands to extract the exported symbol list from a shared archive.
1845 extract_expsyms_cmds=$lt_extract_expsyms_cmds
1846
1847 # Variables whose values should be saved in libtool wrapper scripts and
1848 # restored at link time.
1849 variables_saved_for_relink=$lt_variables_saved_for_relink
1850
1851 # Do we need the "lib" prefix for modules?
1852 need_lib_prefix=$need_lib_prefix
1853
1854 # Do we need a version for libraries?
1855 need_version=$need_version
1856
1857 # Library versioning type.
1858 version_type=$version_type
1859
1860 # Shared library runtime path variable.
1861 runpath_var=$runpath_var
1862
1863 # Shared library path variable.
1864 shlibpath_var=$shlibpath_var
1865
1866 # Is shlibpath searched before the hard-coded library search path?
1867 shlibpath_overrides_runpath=$shlibpath_overrides_runpath
1868
1869 # Format of library name prefix.
1870 libname_spec=$lt_libname_spec
1871
1872 # List of archive names.  First name is the real one, the rest are links.
1873 # The last name is the one that the linker finds with -lNAME
1874 library_names_spec=$lt_library_names_spec
1875
1876 # The coded name of the library, if different from the real name.
1877 soname_spec=$lt_soname_spec
1878
1879 # Command to use after installation of a shared archive.
1880 postinstall_cmds=$lt_postinstall_cmds
1881
1882 # Command to use after uninstallation of a shared archive.
1883 postuninstall_cmds=$lt_postuninstall_cmds
1884
1885 # Commands used to finish a libtool library installation in a directory.
1886 finish_cmds=$lt_finish_cmds
1887
1888 # As "finish_cmds", except a single script fragment to be evaled but
1889 # not shown.
1890 finish_eval=$lt_finish_eval
1891
1892 # Whether we should hardcode library paths into libraries.
1893 hardcode_into_libs=$hardcode_into_libs
1894
1895 # Compile-time system search path for libraries.
1896 sys_lib_search_path_spec=$lt_sys_lib_search_path_spec
1897
1898 # Run-time system search path for libraries.
1899 sys_lib_dlsearch_path_spec=$lt_sys_lib_dlsearch_path_spec
1900
1901 # Whether dlopen is supported.
1902 dlopen_support=$enable_dlopen
1903
1904 # Whether dlopen of programs is supported.
1905 dlopen_self=$enable_dlopen_self
1906
1907 # Whether dlopen of statically linked programs is supported.
1908 dlopen_self_static=$enable_dlopen_self_static
1909
1910 # Commands to strip libraries.
1911 old_striplib=$lt_old_striplib
1912 striplib=$lt_striplib
1913
1914
1915 # The linker used to build libraries.
1916 LD=$lt_LD
1917
1918 # Commands used to build an old-style archive.
1919 old_archive_cmds=$lt_old_archive_cmds
1920
1921 # A language specific compiler.
1922 CC=$lt_compiler
1923
1924 # Is the compiler the GNU compiler?
1925 with_gcc=$GCC
1926
1927 # Compiler flag to turn off builtin functions.
1928 no_builtin_flag=$lt_lt_prog_compiler_no_builtin_flag
1929
1930 # How to pass a linker flag through the compiler.
1931 wl=$lt_lt_prog_compiler_wl
1932
1933 # Additional compiler flags for building library objects.
1934 pic_flag=$lt_lt_prog_compiler_pic
1935
1936 # Compiler flag to prevent dynamic linking.
1937 link_static_flag=$lt_lt_prog_compiler_static
1938
1939 # Does compiler simultaneously support -c and -o options?
1940 compiler_c_o=$lt_lt_cv_prog_compiler_c_o
1941
1942 # Whether or not to add -lc for building shared libraries.
1943 build_libtool_need_lc=$archive_cmds_need_lc
1944
1945 # Whether or not to disallow shared libs when runtime libs are static.
1946 allow_libtool_libs_with_static_runtimes=$enable_shared_with_static_runtimes
1947
1948 # Compiler flag to allow reflexive dlopens.
1949 export_dynamic_flag_spec=$lt_export_dynamic_flag_spec
1950
1951 # Compiler flag to generate shared objects directly from archives.
1952 whole_archive_flag_spec=$lt_whole_archive_flag_spec
1953
1954 # Whether the compiler copes with passing no objects directly.
1955 compiler_needs_object=$lt_compiler_needs_object
1956
1957 # Create an old-style archive from a shared archive.
1958 old_archive_from_new_cmds=$lt_old_archive_from_new_cmds
1959
1960 # Create a temporary old-style archive to link instead of a shared archive.
1961 old_archive_from_expsyms_cmds=$lt_old_archive_from_expsyms_cmds
1962
1963 # Commands used to build a shared archive.
1964 archive_cmds=$lt_archive_cmds
1965 archive_expsym_cmds=$lt_archive_expsym_cmds
1966
1967 # Commands used to build a loadable module if different from building
1968 # a shared archive.
1969 module_cmds=$lt_module_cmds
1970 module_expsym_cmds=$lt_module_expsym_cmds
1971
1972 # Whether we are building with GNU ld or not.
1973 with_gnu_ld=$lt_with_gnu_ld
1974
1975 # Flag that allows shared libraries with undefined symbols to be built.
1976 allow_undefined_flag=$lt_allow_undefined_flag
1977
1978 # Flag that enforces no undefined symbols.
1979 no_undefined_flag=$lt_no_undefined_flag
1980
1981 # Flag to hardcode \$libdir into a binary during linking.
1982 # This must work even if \$libdir does not exist
1983 hardcode_libdir_flag_spec=$lt_hardcode_libdir_flag_spec
1984
1985 # If ld is used when linking, flag to hardcode \$libdir into a binary
1986 # during linking.  This must work even if \$libdir does not exist.
1987 hardcode_libdir_flag_spec_ld=$lt_hardcode_libdir_flag_spec_ld
1988
1989 # Whether we need a single "-rpath" flag with a separated argument.
1990 hardcode_libdir_separator=$lt_hardcode_libdir_separator
1991
1992 # Set to "yes" if using DIR/libNAME\${shared_ext} during linking hardcodes
1993 # DIR into the resulting binary.
1994 hardcode_direct=$hardcode_direct
1995
1996 # Set to "yes" if using DIR/libNAME\${shared_ext} during linking hardcodes
1997 # DIR into the resulting binary and the resulting library dependency is
1998 # "absolute",i.e impossible to change by setting \${shlibpath_var} if the
1999 # library is relocated.
2000 hardcode_direct_absolute=$hardcode_direct_absolute
2001
2002 # Set to "yes" if using the -LDIR flag during linking hardcodes DIR
2003 # into the resulting binary.
2004 hardcode_minus_L=$hardcode_minus_L
2005
2006 # Set to "yes" if using SHLIBPATH_VAR=DIR during linking hardcodes DIR
2007 # into the resulting binary.
2008 hardcode_shlibpath_var=$hardcode_shlibpath_var
2009
2010 # Set to "yes" if building a shared library automatically hardcodes DIR
2011 # into the library and all subsequent libraries and executables linked
2012 # against it.
2013 hardcode_automatic=$hardcode_automatic
2014
2015 # Set to yes if linker adds runtime paths of dependent libraries
2016 # to runtime path list.
2017 inherit_rpath=$inherit_rpath
2018
2019 # Whether libtool must link a program against all its dependency libraries.
2020 link_all_deplibs=$link_all_deplibs
2021
2022 # Fix the shell variable \$srcfile for the compiler.
2023 fix_srcfile_path=$lt_fix_srcfile_path
2024
2025 # Set to "yes" if exported symbols are required.
2026 always_export_symbols=$always_export_symbols
2027
2028 # The commands to list exported symbols.
2029 export_symbols_cmds=$lt_export_symbols_cmds
2030
2031 # Symbols that should not be listed in the preloaded symbols.
2032 exclude_expsyms=$lt_exclude_expsyms
2033
2034 # Symbols that must always be exported.
2035 include_expsyms=$lt_include_expsyms
2036
2037 # Commands necessary for linking programs (against libraries) with templates.
2038 prelink_cmds=$lt_prelink_cmds
2039
2040 # Specify filename containing input files.
2041 file_list_spec=$lt_file_list_spec
2042
2043 # How to hardcode a shared library path into an executable.
2044 hardcode_action=$hardcode_action
2045
2046 # The directories searched by this compiler when creating a shared library.
2047 compiler_lib_search_dirs=$lt_compiler_lib_search_dirs
2048
2049 # Dependencies to place before and after the objects being linked to
2050 # create a shared library.
2051 predep_objects=$lt_predep_objects
2052 postdep_objects=$lt_postdep_objects
2053 predeps=$lt_predeps
2054 postdeps=$lt_postdeps
2055
2056 # The library search path used internally by the compiler when linking
2057 # a shared library.
2058 compiler_lib_search_path=$lt_compiler_lib_search_path
2059
2060 # ### END LIBTOOL CONFIG
2061
2062 _LT_EOF
2063
2064   case $host_os in
2065   aix3*)
2066     cat <<\_LT_EOF >> "$cfgfile"
2067 # AIX sometimes has problems with the GCC collect2 program.  For some
2068 # reason, if we set the COLLECT_NAMES environment variable, the problems
2069 # vanish in a puff of smoke.
2070 if test "X${COLLECT_NAMES+set}" != Xset; then
2071   COLLECT_NAMES=
2072   export COLLECT_NAMES
2073 fi
2074 _LT_EOF
2075     ;;
2076   esac
2077
2078
2079 ltmain="$ac_aux_dir/ltmain.sh"
2080
2081
2082   # We use sed instead of cat because bash on DJGPP gets confused if
2083   # if finds mixed CR/LF and LF-only lines.  Since sed operates in
2084   # text mode, it properly converts lines to CR/LF.  This bash problem
2085   # is reportedly fixed, but why not run on old versions too?
2086   sed '/^# Generated shell functions inserted here/q' "$ltmain" >> "$cfgfile" \
2087     || (rm -f "$cfgfile"; exit 1)
2088
2089   case $xsi_shell in
2090   yes)
2091     cat << \_LT_EOF >> "$cfgfile"
2092
2093 # func_dirname file append nondir_replacement
2094 # Compute the dirname of FILE.  If nonempty, add APPEND to the result,
2095 # otherwise set result to NONDIR_REPLACEMENT.
2096 func_dirname ()
2097 {
2098   case ${1} in
2099     */*) func_dirname_result="${1%/*}${2}" ;;
2100     *  ) func_dirname_result="${3}" ;;
2101   esac
2102 }
2103
2104 # func_basename file
2105 func_basename ()
2106 {
2107   func_basename_result="${1##*/}"
2108 }
2109
2110 # func_dirname_and_basename file append nondir_replacement
2111 # perform func_basename and func_dirname in a single function
2112 # call:
2113 #   dirname:  Compute the dirname of FILE.  If nonempty,
2114 #             add APPEND to the result, otherwise set result
2115 #             to NONDIR_REPLACEMENT.
2116 #             value returned in "$func_dirname_result"
2117 #   basename: Compute filename of FILE.
2118 #             value retuned in "$func_basename_result"
2119 # Implementation must be kept synchronized with func_dirname
2120 # and func_basename. For efficiency, we do not delegate to
2121 # those functions but instead duplicate the functionality here.
2122 func_dirname_and_basename ()
2123 {
2124   case ${1} in
2125     */*) func_dirname_result="${1%/*}${2}" ;;
2126     *  ) func_dirname_result="${3}" ;;
2127   esac
2128   func_basename_result="${1##*/}"
2129 }
2130
2131 # func_stripname prefix suffix name
2132 # strip PREFIX and SUFFIX off of NAME.
2133 # PREFIX and SUFFIX must not contain globbing or regex special
2134 # characters, hashes, percent signs, but SUFFIX may contain a leading
2135 # dot (in which case that matches only a dot).
2136 func_stripname ()
2137 {
2138   # pdksh 5.2.14 does not do ${X%$Y} correctly if both X and Y are
2139   # positional parameters, so assign one to ordinary parameter first.
2140   func_stripname_result=${3}
2141   func_stripname_result=${func_stripname_result#"${1}"}
2142   func_stripname_result=${func_stripname_result%"${2}"}
2143 }
2144
2145 # func_opt_split
2146 func_opt_split ()
2147 {
2148   func_opt_split_opt=${1%%=*}
2149   func_opt_split_arg=${1#*=}
2150 }
2151
2152 # func_lo2o object
2153 func_lo2o ()
2154 {
2155   case ${1} in
2156     *.lo) func_lo2o_result=${1%.lo}.${objext} ;;
2157     *)    func_lo2o_result=${1} ;;
2158   esac
2159 }
2160
2161 # func_xform libobj-or-source
2162 func_xform ()
2163 {
2164   func_xform_result=${1%.*}.lo
2165 }
2166
2167 # func_arith arithmetic-term...
2168 func_arith ()
2169 {
2170   func_arith_result=$(( $* ))
2171 }
2172
2173 # func_len string
2174 # STRING may not start with a hyphen.
2175 func_len ()
2176 {
2177   func_len_result=${#1}
2178 }
2179
2180 _LT_EOF
2181     ;;
2182   *) # Bourne compatible functions.
2183     cat << \_LT_EOF >> "$cfgfile"
2184
2185 # func_dirname file append nondir_replacement
2186 # Compute the dirname of FILE.  If nonempty, add APPEND to the result,
2187 # otherwise set result to NONDIR_REPLACEMENT.
2188 func_dirname ()
2189 {
2190   # Extract subdirectory from the argument.
2191   func_dirname_result=`$ECHO "X${1}" | $Xsed -e "$dirname"`
2192   if test "X$func_dirname_result" = "X${1}"; then
2193     func_dirname_result="${3}"
2194   else
2195     func_dirname_result="$func_dirname_result${2}"
2196   fi
2197 }
2198
2199 # func_basename file
2200 func_basename ()
2201 {
2202   func_basename_result=`$ECHO "X${1}" | $Xsed -e "$basename"`
2203 }
2204
2205
2206 # func_stripname prefix suffix name
2207 # strip PREFIX and SUFFIX off of NAME.
2208 # PREFIX and SUFFIX must not contain globbing or regex special
2209 # characters, hashes, percent signs, but SUFFIX may contain a leading
2210 # dot (in which case that matches only a dot).
2211 # func_strip_suffix prefix name
2212 func_stripname ()
2213 {
2214   case ${2} in
2215     .*) func_stripname_result=`$ECHO "X${3}" \
2216            | $Xsed -e "s%^${1}%%" -e "s%\\\\${2}\$%%"`;;
2217     *)  func_stripname_result=`$ECHO "X${3}" \
2218            | $Xsed -e "s%^${1}%%" -e "s%${2}\$%%"`;;
2219   esac
2220 }
2221
2222 # sed scripts:
2223 my_sed_long_opt='1s/^\(-[^=]*\)=.*/\1/;q'
2224 my_sed_long_arg='1s/^-[^=]*=//'
2225
2226 # func_opt_split
2227 func_opt_split ()
2228 {
2229   func_opt_split_opt=`$ECHO "X${1}" | $Xsed -e "$my_sed_long_opt"`
2230   func_opt_split_arg=`$ECHO "X${1}" | $Xsed -e "$my_sed_long_arg"`
2231 }
2232
2233 # func_lo2o object
2234 func_lo2o ()
2235 {
2236   func_lo2o_result=`$ECHO "X${1}" | $Xsed -e "$lo2o"`
2237 }
2238
2239 # func_xform libobj-or-source
2240 func_xform ()
2241 {
2242   func_xform_result=`$ECHO "X${1}" | $Xsed -e 's/\.[^.]*$/.lo/'`
2243 }
2244
2245 # func_arith arithmetic-term...
2246 func_arith ()
2247 {
2248   func_arith_result=`expr "$@"`
2249 }
2250
2251 # func_len string
2252 # STRING may not start with a hyphen.
2253 func_len ()
2254 {
2255   func_len_result=`expr "$1" : ".*" 2>/dev/null || echo $max_cmd_len`
2256 }
2257
2258 _LT_EOF
2259 esac
2260
2261 case $lt_shell_append in
2262   yes)
2263     cat << \_LT_EOF >> "$cfgfile"
2264
2265 # func_append var value
2266 # Append VALUE to the end of shell variable VAR.
2267 func_append ()
2268 {
2269   eval "$1+=\$2"
2270 }
2271 _LT_EOF
2272     ;;
2273   *)
2274     cat << \_LT_EOF >> "$cfgfile"
2275
2276 # func_append var value
2277 # Append VALUE to the end of shell variable VAR.
2278 func_append ()
2279 {
2280   eval "$1=\$$1\$2"
2281 }
2282
2283 _LT_EOF
2284     ;;
2285   esac
2286
2287
2288   sed -n '/^# Generated shell functions inserted here/,$p' "$ltmain" >> "$cfgfile" \
2289     || (rm -f "$cfgfile"; exit 1)
2290
2291   mv -f "$cfgfile" "$ofile" ||
2292     (rm -f "$ofile" && cp "$cfgfile" "$ofile" && rm -f "$cfgfile")
2293   chmod +x "$ofile"
2294
2295
2296     cat <<_LT_EOF >> "$ofile"
2297
2298 # ### BEGIN LIBTOOL TAG CONFIG: CXX
2299
2300 # The linker used to build libraries.
2301 LD=$lt_LD_CXX
2302
2303 # Commands used to build an old-style archive.
2304 old_archive_cmds=$lt_old_archive_cmds_CXX
2305
2306 # A language specific compiler.
2307 CC=$lt_compiler_CXX
2308
2309 # Is the compiler the GNU compiler?
2310 with_gcc=$GCC_CXX
2311
2312 # Compiler flag to turn off builtin functions.
2313 no_builtin_flag=$lt_lt_prog_compiler_no_builtin_flag_CXX
2314
2315 # How to pass a linker flag through the compiler.
2316 wl=$lt_lt_prog_compiler_wl_CXX
2317
2318 # Additional compiler flags for building library objects.
2319 pic_flag=$lt_lt_prog_compiler_pic_CXX
2320
2321 # Compiler flag to prevent dynamic linking.
2322 link_static_flag=$lt_lt_prog_compiler_static_CXX
2323
2324 # Does compiler simultaneously support -c and -o options?
2325 compiler_c_o=$lt_lt_cv_prog_compiler_c_o_CXX
2326
2327 # Whether or not to add -lc for building shared libraries.
2328 build_libtool_need_lc=$archive_cmds_need_lc_CXX
2329
2330 # Whether or not to disallow shared libs when runtime libs are static.
2331 allow_libtool_libs_with_static_runtimes=$enable_shared_with_static_runtimes_CXX
2332
2333 # Compiler flag to allow reflexive dlopens.
2334 export_dynamic_flag_spec=$lt_export_dynamic_flag_spec_CXX
2335
2336 # Compiler flag to generate shared objects directly from archives.
2337 whole_archive_flag_spec=$lt_whole_archive_flag_spec_CXX
2338
2339 # Whether the compiler copes with passing no objects directly.
2340 compiler_needs_object=$lt_compiler_needs_object_CXX
2341
2342 # Create an old-style archive from a shared archive.
2343 old_archive_from_new_cmds=$lt_old_archive_from_new_cmds_CXX
2344
2345 # Create a temporary old-style archive to link instead of a shared archive.
2346 old_archive_from_expsyms_cmds=$lt_old_archive_from_expsyms_cmds_CXX
2347
2348 # Commands used to build a shared archive.
2349 archive_cmds=$lt_archive_cmds_CXX
2350 archive_expsym_cmds=$lt_archive_expsym_cmds_CXX
2351
2352 # Commands used to build a loadable module if different from building
2353 # a shared archive.
2354 module_cmds=$lt_module_cmds_CXX
2355 module_expsym_cmds=$lt_module_expsym_cmds_CXX
2356
2357 # Whether we are building with GNU ld or not.
2358 with_gnu_ld=$lt_with_gnu_ld_CXX
2359
2360 # Flag that allows shared libraries with undefined symbols to be built.
2361 allow_undefined_flag=$lt_allow_undefined_flag_CXX
2362
2363 # Flag that enforces no undefined symbols.
2364 no_undefined_flag=$lt_no_undefined_flag_CXX
2365
2366 # Flag to hardcode \$libdir into a binary during linking.
2367 # This must work even if \$libdir does not exist
2368 hardcode_libdir_flag_spec=$lt_hardcode_libdir_flag_spec_CXX
2369
2370 # If ld is used when linking, flag to hardcode \$libdir into a binary
2371 # during linking.  This must work even if \$libdir does not exist.
2372 hardcode_libdir_flag_spec_ld=$lt_hardcode_libdir_flag_spec_ld_CXX
2373
2374 # Whether we need a single "-rpath" flag with a separated argument.
2375 hardcode_libdir_separator=$lt_hardcode_libdir_separator_CXX
2376
2377 # Set to "yes" if using DIR/libNAME\${shared_ext} during linking hardcodes
2378 # DIR into the resulting binary.
2379 hardcode_direct=$hardcode_direct_CXX
2380
2381 # Set to "yes" if using DIR/libNAME\${shared_ext} during linking hardcodes
2382 # DIR into the resulting binary and the resulting library dependency is
2383 # "absolute",i.e impossible to change by setting \${shlibpath_var} if the
2384 # library is relocated.
2385 hardcode_direct_absolute=$hardcode_direct_absolute_CXX
2386
2387 # Set to "yes" if using the -LDIR flag during linking hardcodes DIR
2388 # into the resulting binary.
2389 hardcode_minus_L=$hardcode_minus_L_CXX
2390
2391 # Set to "yes" if using SHLIBPATH_VAR=DIR during linking hardcodes DIR
2392 # into the resulting binary.
2393 hardcode_shlibpath_var=$hardcode_shlibpath_var_CXX
2394
2395 # Set to "yes" if building a shared library automatically hardcodes DIR
2396 # into the library and all subsequent libraries and executables linked
2397 # against it.
2398 hardcode_automatic=$hardcode_automatic_CXX
2399
2400 # Set to yes if linker adds runtime paths of dependent libraries
2401 # to runtime path list.
2402 inherit_rpath=$inherit_rpath_CXX
2403
2404 # Whether libtool must link a program against all its dependency libraries.
2405 link_all_deplibs=$link_all_deplibs_CXX
2406
2407 # Fix the shell variable \$srcfile for the compiler.
2408 fix_srcfile_path=$lt_fix_srcfile_path_CXX
2409
2410 # Set to "yes" if exported symbols are required.
2411 always_export_symbols=$always_export_symbols_CXX
2412
2413 # The commands to list exported symbols.
2414 export_symbols_cmds=$lt_export_symbols_cmds_CXX
2415
2416 # Symbols that should not be listed in the preloaded symbols.
2417 exclude_expsyms=$lt_exclude_expsyms_CXX
2418
2419 # Symbols that must always be exported.
2420 include_expsyms=$lt_include_expsyms_CXX
2421
2422 # Commands necessary for linking programs (against libraries) with templates.
2423 prelink_cmds=$lt_prelink_cmds_CXX
2424
2425 # Specify filename containing input files.
2426 file_list_spec=$lt_file_list_spec_CXX
2427
2428 # How to hardcode a shared library path into an executable.
2429 hardcode_action=$hardcode_action_CXX
2430
2431 # The directories searched by this compiler when creating a shared library.
2432 compiler_lib_search_dirs=$lt_compiler_lib_search_dirs_CXX
2433
2434 # Dependencies to place before and after the objects being linked to
2435 # create a shared library.
2436 predep_objects=$lt_predep_objects_CXX
2437 postdep_objects=$lt_postdep_objects_CXX
2438 predeps=$lt_predeps_CXX
2439 postdeps=$lt_postdeps_CXX
2440
2441 # The library search path used internally by the compiler when linking
2442 # a shared library.
2443 compiler_lib_search_path=$lt_compiler_lib_search_path_CXX
2444
2445 # ### END LIBTOOL TAG CONFIG: CXX
2446 _LT_EOF
2447
2448  ;;
2449
2450   esac
2451 done # for ac_tag
2452
2453
2454 { (exit 0); exit 0; }