ClustalO servlets
[jabaws.git] / binaries / src / disembl / INSTALLATION_NOTES
1 DIsEMBL depends on BioPython and Tisean sav_gol executable
2 both has to be installed
3 DisEMBL.py script changes: 
4 move import sys statement up to append Bio python libraries path
5 change path to python interpreter
6 Comment out file argument read data from stdin instead 
7 was: 
8     file = str(sys.argv[7])
9     db = open(file,'r')
10 become: 
11 # file = str(sys.argv[7])
12   db = sys.stdin
13
14 Header 
15     print ' ____  _     _____ __  __ ____  _       _  _  _'
16     print '|  _ \(_)___| ____|  \/  | __ )| |     / || || |'
17     print '| | | | / __|  _| | |\/| |  _ \| |     | || || |_'
18     print '| |_| | \__ \ |___| |  | | |_) | |___  | ||__   _|'
19     print '|____/|_|___/_____|_|  |_|____/|_____| |_(_) |_|'
20     print '# Copyright (C) 2004 - Rune Linding & Lars Juhl Jensen '
21     print '# EMBL Biocomputing Unit - Heidelberg - Germany        '
22     print ''
23 removed to facilitate parsing