new mafft v 6.857 with extensions
[jabaws.git] / binaries / src / mafft / extensions / mxscarna_src / probconsRNA / MakeGnuPlot.cc
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2 // MakeGnuPlot.cc
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5 #include <iostream>
6 #include <fstream>
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8 using namespace std;
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10 int main (int argc, char **argv){
11   
12   if (argc == 1 || argc > 3){
13     cerr << "Usage: makegnuplot annotscores [refscores]" << endl;
14     exit (1);
15   }
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17   ifstream data (argv[1]);
18
19   if (data.fail()){
20     cerr << "ERROR: Could not open file " << argv[1] << endl;
21     exit (1);
22   }
23   
24   int x, ct = 0;
25   while (data >> x) ct++;
26   data.close();
27   
28   ofstream out ("temporary_gnuplot_script");
29   
30   if (out.fail()){
31     cerr << "ERROR: Could not create temporary file." << endl;
32     exit (1);
33   }
34
35   out << "set title \"Column Reliability Scores\"" << endl
36       << "set xlabel \"Alignment Position\"" << endl
37       << "set ylabel \"Column Reliability\"" << endl
38       << "set xr [1:" << ct << "]" << endl
39       << "set term postscript enhanced color" << endl
40       << "set output \"reliability.ps\"" << endl;
41   
42   if (argc == 3){
43     out << "set style fill solid 0.5 noborder" << endl
44         << "plot \"" << argv[2] << "\" title \"actual\" with boxes lt 2, \\" << endl
45         << "     \"" << argv[1] << "\" title \"predicted\" with histeps lt 1 lw 3" << endl;
46   }
47   else 
48     out << "plot \"" << argv[1] << "\" title \"predicted\" with histeps lt 1 lw 3" << endl;
49
50   out.close();
51
52   if (system ("gnuplot temporary_gnuplot_script") == -1){
53     cerr << "ERROR: Could not run Gnuplot correctly." << endl;
54     exit (1);
55   }
56   
57   //system ("rm temporary_gnuplot_script");
58 }