binaries/src/mafft/extensions/mxscarna_src/probconsRNA/SafeVector.h

   1 /////////////////////////////////////////////////////////////////
   2 // SafeVector.h
   3 //
   4 // STL vector with array bounds checking.  To enable bounds
   5 // checking, #define ENABLE_CHECKS.
   6 /////////////////////////////////////////////////////////////////
   7
   8 #ifndef SAFEVECTOR_H
   9 #define SAFEVECTOR_H
  10
  11 #include <cassert>
  12 #include <vector>
  13
  14 /////////////////////////////////////////////////////////////////
  15 // SafeVector
  16 //
  17 // Class derived from the STL std::vector for bounds checking.
  18 /////////////////////////////////////////////////////////////////
  19 namespace MXSCARNA {
  20 template<class TYPE>
  21 class SafeVector : public std::vector<TYPE>{
  22  public:
  23
  24   // miscellaneous constructors
  25   SafeVector() : std::vector<TYPE>() {}
  26   SafeVector (size_t size) : std::vector<TYPE>(size) {}
  27   SafeVector (size_t size, const TYPE &value) : std::vector<TYPE>(size, value) {}
  28   SafeVector (const SafeVector &source) : std::vector<TYPE>(source) {}
  29
  30 #ifdef ENABLE_CHECKS
  31
  32   // [] array bounds checking
  33   TYPE &operator[](int index){
  34     assert (index >= 0 && index < (int) size());
  35     return std::vector<TYPE>::operator[] ((size_t) index);
  36   }
  37
  38   // [] const array bounds checking
  39   const TYPE &operator[] (int index) const {
  40     assert (index >= 0 && index < (int) size());
  41     return std::vector<TYPE>::operator[] ((size_t) index) ;
  42   }
  43
  44 #endif
  45
  46 };
  47
  48 // some commonly used vector types
  49 typedef SafeVector<int> VI;
  50 typedef SafeVector<VI> VVI;
  51 typedef SafeVector<VVI> VVVI;
  52 typedef SafeVector<float> VF;
  53 typedef SafeVector<VF> VVF;
  54 typedef SafeVector<VVF> VVVF;
  55 }
  56 #endif