conf/settings/DisemblParameters.xml

   1 <?xml version="1.0" encoding="US-ASCII" standalone="yes"?>\r
   2 <runnerConfig>\r
   3         <runnerClassName>compbio.runner.disorder.Disembl</runnerClassName>\r
   4         <prmSeparator>=</prmSeparator>\r
   5         <parameters>\r
   6                 <name>Default parameters should not be changed!</name>\r
   7                 <description>Normally the default parameters should not be changed. \r
   8                 If the query protein sequence is very long, >1000 residues, you can download the predictions and \r
   9                 use a local graph/plotting tool such as Grace or OpenOffice.org to plot and zoom the data. \r
  10                 Having identified the potential disordered regions, you should now have a good basis for setting \r
  11                 up expression vectors and/or comparing the data with obtained structural data. \r
  12                 </description>\r
  13                 <optionNames>-sg</optionNames>\r
  14                 <furtherDetails>prog_docs/disembl.html</furtherDetails>\r
  15                 <defaultValue>1</defaultValue>\r
  16         </parameters>\r
  17 </runnerConfig>\r
  18  \r
  19