conf/settings/IUPredParameters.xml

   1 <?xml version="1.0" encoding="US-ASCII" standalone="yes"?>\r
   2 <runnerConfig>\r
   3     <runnerClassName>compbio.runner.disorder.IUPred</runnerClassName>\r
   4 \r
   5     <options isRequired="true">\r
   6         <name>Disorder type</name>\r
   7         <description>\r
   8             "Long" - for prediction of long disordered regions, "short" - for \r
   9             prediction of short disordered regions ( e.g. missing residues in\r
  10             X-ray structures) and "glob" for predicting globular domains.\r
  11             "All" for all methods\r
  12         </description>\r
  13         <optionNames>short</optionNames>\r
  14         <optionNames>long</optionNames>\r
  15         <optionNames>glob</optionNames>\r
  16         <optionNames>all</optionNames>\r
  17         <furtherDetails>prog_docs/iupred.txt</furtherDetails>\r
  18         <defaultValue>long</defaultValue>\r
  19     </options>\r
  20 </runnerConfig>\r