conf/settings/IUPredParameters.xml

   1 <?xml version="1.0" encoding="US-ASCII" standalone="yes"?>\r
   2 <runnerConfig>\r
   3         <runnerClassName>compbio.runner.disorder.IUPred</runnerClassName>\r
   4         <options isRequired="true">\r
   5         <name>Disorder type</name>\r
   6         <description> "Long" - for prediction of long disordered regions, "short" - for \r
   7         prediction of short disordered regions ( e.g. missing residues in\r
   8   X-ray structures) and "glob" for predicting globular domains. "All" for all methods</description>\r
   9         <optionNames>short</optionNames>\r
  10         <optionNames>long</optionNames>\r
  11         <optionNames>glob</optionNames>\r
  12         <optionNames>all</optionNames>\r
  13         <furtherDetails>prog_docs/iupred.txt</furtherDetails>\r
  14         <defaultValue>long</defaultValue>\r
  15     </options>\r
  16 </runnerConfig>\r