datamodel/compbio/data/sequence/MultiAnnotatedSequence.java

   1 package compbio.data.sequence;\r
   2 \r
   3 import java.util.EnumMap;\r
   4 import java.util.List;\r
   5 \r
   6 /**\r
   7  * TODO complete\r
   8  * \r
   9  * @author pvtroshin\r
  10  * \r
  11  * @param <T>\r
  12  *            enum type\r
  13  */\r
  14 public class MultiAnnotatedSequence<T extends Enum<T>> {\r
  15 \r
  16     private final EnumMap<T, List<Float>> annotation;\r
  17 \r
  18     private MultiAnnotatedSequence(Class<T> type) {\r
  19         this.annotation = new EnumMap<T, List<Float>>(type);\r
  20     }\r
  21 \r
  22     //    public MultiAnnotatedSequence getFloatInstance(FastaSequence fsequence) {\r
  23     //  return null;\r
  24     //}\r
  25 \r
  26     public EnumMap<T, List<Integer>> getIntegerInstance(Class<T> enumeration) {\r
  27         return new EnumMap<T, List<Integer>>(enumeration);\r
  28     }\r
  29 \r
  30     public EnumMap<T, List<Float>> getFloatInstance(Class<T> enumeration) {\r
  31         return new EnumMap<T, List<Float>>(enumeration);\r
  32     }\r
  33 }\r