JWS-117 Compiled all tools with ./compilebin.sh and some were missing related files.
[jabaws.git] / binaries / src / ViennaRNA / doc / latex / structTwoDpfold__vars__coll__graph.eps
diff --git a/binaries/src/ViennaRNA/doc/latex/structTwoDpfold__vars__coll__graph.eps b/binaries/src/ViennaRNA/doc/latex/structTwoDpfold__vars__coll__graph.eps
new file mode 100644 (file)
index 0000000..9515c34
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,301 @@
+%!PS-Adobe-3.0
+%%Creator: graphviz version 2.26.0 (20091210.2329)
+%%Title: G
+%%Pages: (atend)
+%%BoundingBox: (atend)
+%%EndComments
+save
+%%BeginProlog
+/DotDict 200 dict def
+DotDict begin
+
+/setupLatin1 {
+mark
+/EncodingVector 256 array def
+ EncodingVector 0
+
+ISOLatin1Encoding 0 255 getinterval putinterval
+EncodingVector 45 /hyphen put
+
+% Set up ISO Latin 1 character encoding
+/starnetISO {
+        dup dup findfont dup length dict begin
+        { 1 index /FID ne { def }{ pop pop } ifelse
+        } forall
+        /Encoding EncodingVector def
+        currentdict end definefont
+} def
+/Times-Roman starnetISO def
+/Times-Italic starnetISO def
+/Times-Bold starnetISO def
+/Times-BoldItalic starnetISO def
+/Helvetica starnetISO def
+/Helvetica-Oblique starnetISO def
+/Helvetica-Bold starnetISO def
+/Helvetica-BoldOblique starnetISO def
+/Courier starnetISO def
+/Courier-Oblique starnetISO def
+/Courier-Bold starnetISO def
+/Courier-BoldOblique starnetISO def
+cleartomark
+} bind def
+
+%%BeginResource: procset graphviz 0 0
+/coord-font-family /Times-Roman def
+/default-font-family /Times-Roman def
+/coordfont coord-font-family findfont 8 scalefont def
+
+/InvScaleFactor 1.0 def
+/set_scale {
+       dup 1 exch div /InvScaleFactor exch def
+       scale
+} bind def
+
+% styles
+/solid { [] 0 setdash } bind def
+/dashed { [9 InvScaleFactor mul dup ] 0 setdash } bind def
+/dotted { [1 InvScaleFactor mul 6 InvScaleFactor mul] 0 setdash } bind def
+/invis {/fill {newpath} def /stroke {newpath} def /show {pop newpath} def} bind def
+/bold { 2 setlinewidth } bind def
+/filled { } bind def
+/unfilled { } bind def
+/rounded { } bind def
+/diagonals { } bind def
+
+% hooks for setting color 
+/nodecolor { sethsbcolor } bind def
+/edgecolor { sethsbcolor } bind def
+/graphcolor { sethsbcolor } bind def
+/nopcolor {pop pop pop} bind def
+
+/beginpage {   % i j npages
+       /npages exch def
+       /j exch def
+       /i exch def
+       /str 10 string def
+       npages 1 gt {
+               gsave
+                       coordfont setfont
+                       0 0 moveto
+                       (\() show i str cvs show (,) show j str cvs show (\)) show
+               grestore
+       } if
+} bind def
+
+/set_font {
+       findfont exch
+       scalefont setfont
+} def
+
+% draw text fitted to its expected width
+/alignedtext {                 % width text
+       /text exch def
+       /width exch def
+       gsave
+               width 0 gt {
+                       [] 0 setdash
+                       text stringwidth pop width exch sub text length div 0 text ashow
+               } if
+       grestore
+} def
+
+/boxprim {                             % xcorner ycorner xsize ysize
+               4 2 roll
+               moveto
+               2 copy
+               exch 0 rlineto
+               0 exch rlineto
+               pop neg 0 rlineto
+               closepath
+} bind def
+
+/ellipse_path {
+       /ry exch def
+       /rx exch def
+       /y exch def
+       /x exch def
+       matrix currentmatrix
+       newpath
+       x y translate
+       rx ry scale
+       0 0 1 0 360 arc
+       setmatrix
+} bind def
+
+/endpage { showpage } bind def
+/showpage { } def
+
+/layercolorseq
+       [       % layer color sequence - darkest to lightest
+               [0 0 0]
+               [.2 .8 .8]
+               [.4 .8 .8]
+               [.6 .8 .8]
+               [.8 .8 .8]
+       ]
+def
+
+/layerlen layercolorseq length def
+
+/setlayer {/maxlayer exch def /curlayer exch def
+       layercolorseq curlayer 1 sub layerlen mod get
+       aload pop sethsbcolor
+       /nodecolor {nopcolor} def
+       /edgecolor {nopcolor} def
+       /graphcolor {nopcolor} def
+} bind def
+
+/onlayer { curlayer ne {invis} if } def
+
+/onlayers {
+       /myupper exch def
+       /mylower exch def
+       curlayer mylower lt
+       curlayer myupper gt
+       or
+       {invis} if
+} def
+
+/curlayer 0 def
+
+%%EndResource
+%%EndProlog
+%%BeginSetup
+14 default-font-family set_font
+1 setmiterlimit
+% /arrowlength 10 def
+% /arrowwidth 5 def
+
+% make sure pdfmark is harmless for PS-interpreters other than Distiller
+/pdfmark where {pop} {userdict /pdfmark /cleartomark load put} ifelse
+% make '<<' and '>>' safe on PS Level 1 devices
+/languagelevel where {pop languagelevel}{1} ifelse
+2 lt {
+    userdict (<<) cvn ([) cvn load put
+    userdict (>>) cvn ([) cvn load put
+} if
+
+%%EndSetup
+setupLatin1
+%%Page: 1 1
+%%PageBoundingBox: 36 36 154 216
+%%PageOrientation: Portrait
+0 0 1 beginpage
+gsave
+36 36 118 180 boxprim clip newpath
+1 1 set_scale 0 rotate 40 41 translate
+% Node1
+gsave
+0 0 0.74902 nodecolor
+newpath 0 1 moveto
+0 23 lineto
+92 23 lineto
+92 1 lineto
+closepath fill
+1 setlinewidth
+filled
+0 0 0 nodecolor
+newpath 0 1 moveto
+0 23 lineto
+92 23 lineto
+92 1 lineto
+closepath stroke
+0 0 0 nodecolor
+10 /FreeSans set_font
+8 10 moveto 76 (TwoDpfold_vars) alignedtext
+grestore
+% Node2
+gsave
+[ /Rect [ 14 74.5 78 97.5 ]
+  /Border [ 0 0 0 ]
+  /Action << /Subtype /URI /URI ($structpf__paramT.html) >>
+  /Subtype /Link
+/ANN pdfmark
+1 setlinewidth
+0 0 0 nodecolor
+newpath 13.5 75 moveto
+13.5 97 lineto
+78.5 97 lineto
+78.5 75 lineto
+closepath stroke
+0 0 0 nodecolor
+10 /FreeSans set_font
+21.5 84 moveto 49 (pf_paramT) alignedtext
+grestore
+% Node2->Node1
+gsave
+1 setlinewidth
+dashed
+0.77647 0.75294 0.80392 edgecolor
+newpath 46 64.45 moveto
+46 51.01 46 34.25 46 23.34 curveto
+stroke
+0.77647 0.75294 0.80392 edgecolor
+newpath 42.5 64.76 moveto
+46 74.76 lineto
+49.5 64.76 lineto
+closepath fill
+1 setlinewidth
+solid
+0.77647 0.75294 0.80392 edgecolor
+newpath 42.5 64.76 moveto
+46 74.76 lineto
+49.5 64.76 lineto
+closepath stroke
+0 0 0 edgecolor
+10 /FreeSans set_font
+46 47 moveto 47 (pf_params) alignedtext
+grestore
+% Node3
+gsave
+[ /Rect [ 2 148.5 90 171.5 ]
+  /Border [ 0 0 0 ]
+  /Action << /Subtype /URI /URI ($structmodel__detailsT.html) >>
+  /Subtype /Link
+/ANN pdfmark
+1 setlinewidth
+0 0 0 nodecolor
+newpath 2 149 moveto
+2 171 lineto
+90 171 lineto
+90 149 lineto
+closepath stroke
+0 0 0 nodecolor
+10 /FreeSans set_font
+10 158 moveto 72 (model_detailsT) alignedtext
+grestore
+% Node3->Node2
+gsave
+1 setlinewidth
+dashed
+0.77647 0.75294 0.80392 edgecolor
+newpath 46 138.45 moveto
+46 125.01 46 108.25 46 97.34 curveto
+stroke
+0.77647 0.75294 0.80392 edgecolor
+newpath 42.5 138.76 moveto
+46 148.76 lineto
+49.5 138.76 lineto
+closepath fill
+1 setlinewidth
+solid
+0.77647 0.75294 0.80392 edgecolor
+newpath 42.5 138.76 moveto
+46 148.76 lineto
+49.5 138.76 lineto
+closepath stroke
+0 0 0 edgecolor
+10 /FreeSans set_font
+46 121 moveto 64 (model_details) alignedtext
+grestore
+endpage
+showpage
+grestore
+%%PageTrailer
+%%EndPage: 1
+%%Trailer
+%%Pages: 1
+%%BoundingBox: 36 36 154 216
+end
+restore
+%%EOF