git://source.jalview.org / jabaws.git / blobdiff
? search:
summary | shortlog | log | commit | commitdiff | tree
raw | inline | side by side
JWS-112 Bumping version of T-Coffee to version 11.00.8cbe486.
[jabaws.git] / binaries / src / tcoffee / example / test.lib
diff --git a/binaries/src/tcoffee/example/test.lib b/binaries/src/tcoffee/example/test.lib
new file mode 100644 (file)
index 0000000..0f088d5
--- /dev/null
+++ b/binaries/src/tcoffee/example/test.lib
@@ -0,0 +1,414 @@
+! TC_LIB_FORMAT_01
+4
+hmgb_chite 74 adkpkrplsaymlwlnsaresikrenpdfkvtevakkggelwrglkdkseweakaatakqnyiralqeyerngg
+hmgl_trybr 67 kkdsnapkramtsfmffssdfrskhsdlsivemskaagaawkelgpeerkvyeemaekdkerykrem
+hmgl_wheat 79 dpnkpkrapsaffvfmgefreefkqknpknksvaavgkaagerwkslsesekapyvakanklkgeynkaiaaynkgesa
+hmgt_mouse 71 kpkrprsayniyvsesfqeakddsaqgklklvneawknlspeekqayiqlakddrirydnemksweeqmae
+#1 2
+    1     2    72     1     0 
+    2     3    72     1     0 
+    3     6    72     1     0 
+    4     7    72     1     0 
+    5     8    72     1     0 
+    6     9    72     1     0 
+    7    10    72     1     0 
+    8    11    72     1     0 
+    9    12    72     1     0 
+   10    13    72     1     0 
+   11    14    72     1     0 
+   13    15    72     1     0 
+   14    16    72     1     0 
+   15    17    72     1     0 
+   16    18    72     1     0 
+   20    19    72     1     0 
+   21    20    72     1     0 
+   22    21    72     1     0 
+   23    22    72     1     0 
+   24    23    72     1     0 
+   25    24    72     1     0 
+   26    25    72     1     0 
+   27    26    72     1     0 
+   28    27    72     1     0 
+   29    28    72     1     0 
+   30    29    72     1     0 
+   31    30    72     1     0 
+   32    31    72     1     0 
+   33    32    72     1     0 
+   34    33    72     1     0 
+   35    34    72     1     0 
+   36    35    72     1     0 
+   37    36    72     1     0 
+   38    37    72     1     0 
+   39    38    72     1     0 
+   40    39    72     1     0 
+   41    40    72     1     0 
+   42    41    72     1     0 
+   43    42    72     1     0 
+   44    43    72     1     0 
+   45    44    72     1     0 
+   46    45    72     1     0 
+   47    48    72     1     0 
+   48    49    72     1     0 
+   49    50    72     1     0 
+   50    51    72     1     0 
+   51    52    72     1     0 
+   52    53    72     1     0 
+   53    54    72     1     0 
+   54    55    72     1     0 
+   55    56    72     1     0 
+   56    57    72     1     0 
+   57    58    72     1     0 
+   58    59    72     1     0 
+   59    60    72     1     0 
+   60    61    72     1     0 
+   61    62    72     1     0 
+   62    63    72     1     0 
+   63    64    72     1     0 
+   64    65    72     1     0 
+   70    66    72     1     0 
+   73    67    72     1     0 
+#1 3
+    1     2    79     1    82 
+    2     3    79     1     0 
+    3     4    79     1     0 
+    4     5    79     1     0 
+    5     6    79     1     0 
+    6     7    79     1     0 
+    7     8    79     1     0 
+    8     9    79     1     0 
+    9    10    79     1     0 
+   10    11    79     1     0 
+   11    12    79     1     0 
+   12    13    79     1     0 
+   13    14    79     1     0 
+   14    15    79     1     0 
+   15    16    79     1     0 
+   16    17    79     1     0 
+   17    18    79     1     0 
+   18    19    79     1     0 
+   19    20    79     1     0 
+   20    21    79     1     0 
+   21    22    79     1     0 
+   22    23    79     1     0 
+   23    24    79     1     0 
+   24    25    79     1     0 
+   25    26    79     1     0 
+   26    27    79     1     0 
+   27    28    79     1     0 
+   28    29    79     1     0 
+   29    30    79     1     0 
+   30    31    79     1     0 
+   31    33    79     1     0 
+   32    34    79     1     0 
+   33    35    79     1     0 
+   34    36    79     1     0 
+   35    37    79     1     0 
+   36    38    79     1     0 
+   37    39    79     1     0 
+   38    40    79     1     0 
+   39    41    79     1     0 
+   40    42    79     1     0 
+   41    43    79     1     0 
+   42    44    79     1     0 
+   43    45    79     1     0 
+   44    46    79     1     0 
+   45    47    79     1     0 
+   46    48    79     1     0 
+   47    51    79     1     0 
+   48    52    79     1     0 
+   49    53    79     1     0 
+   50    54    79     1     0 
+   51    55    79     1     0 
+   52    56    79     1     0 
+   53    57    79     1     0 
+   54    58    79     1     0 
+   55    59    79     1     0 
+   56    60    79     1     0 
+   57    61    79     1     0 
+   58    62    79     1     0 
+   59    63    79     1     0 
+   60    64    79     1     0 
+   61    65    79     1     0 
+   62    66    79     1     0 
+   63    67    79     1     0 
+   64    68    79     1     0 
+   65    69    79     1     0 
+   66    70    79     1     0 
+   67    71    79     1     0 
+   68    72    79     1     0 
+   69    73    79     1     0 
+   70    74    79     1     0 
+   71    75    79     1     0 
+   72    77    79     1     0 
+   73    78    79     1     0 
+   74    79    79     1     0 
+#1 4
+    1     1    64     1     0 
+    4     2    64     1     0 
+    5     3    64     1     0 
+    6     4    64     1     0 
+    7     5    64     1     0 
+    8     6    64     1     0 
+    9     7    64     1     0 
+   10     8    64     1     0 
+   11     9    64     1     0 
+   12    10    64     1     0 
+   13    11    64     1     0 
+   14    12    64     1     0 
+   15    13    64     1     0 
+   16    14    64     1     0 
+   20    15    64     1     0 
+   21    16    64     1     0 
+   22    17    64     1     0 
+   23    18    64     1     0 
+   24    19    64     1     0 
+   25    20    64     1     0 
+   26    21    64     1     0 
+   27    22    64     1     0 
+   28    23    64     1     0 
+   29    24    64     1     0 
+   30    25    64     1     0 
+   31    26    64     1     0 
+   32    27    64     1     0 
+   33    28    64     1     0 
+   34    29    64     1     0 
+   36    30    64     1     0 
+   37    31    64     1     0 
+   38    32    64     1     0 
+   39    33    64     1     0 
+   40    34    64     1     0 
+   41    35    64     1     0 
+   42    36    64     1     0 
+   43    37    64     1     0 
+   44    38    64     1     0 
+   45    39    64     1     0 
+   46    40    64     1     0 
+   47    43    64     1     0 
+   48    44    64     1     0 
+   49    45    64     1     0 
+   50    46    64     1     0 
+   51    47    64     1     0 
+   52    48    64     1     0 
+   53    49    64     1     0 
+   54    50    64     1     0 
+   55    51    64     1     0 
+   56    52    64     1     0 
+   57    53    64     1     0 
+   58    54    64     1     0 
+   59    55    64     1     0 
+   60    56    64     1     0 
+   61    57    64     1     0 
+   62    58    64     1     0 
+   63    59    64     1     0 
+   64    60    64     1     0 
+   65    61    64     1     0 
+   66    62    64     1     0 
+   67    63    64     1     0 
+   68    64    64     1     0 
+   69    65    64     1     0 
+   70    66    64     1     0 
+   71    67    64     1     0 
+   72    68    64     1     0 
+   73    69    64     1     0 
+   74    70    64     1     0 
+#2 3
+    1     1    75     1     0 
+    2     2    75     1     0 
+    3     3    75     1     0 
+    6     4    75     1     0 
+    7     5    75     1     0 
+    8     6    75     1     0 
+    9     7    75     1     0 
+   10     8    75     1     0 
+   11     9    75     1     0 
+   12    10    75     1     0 
+   13    11    75     1     0 
+   14    12    75     1     0 
+   15    14    75     1     0 
+   16    15    75     1     0 
+   17    16    75     1     0 
+   18    17    75     1     0 
+   19    21    75     1     0 
+   20    22    75     1     0 
+   21    23    75     1     0 
+   22    24    75     1     0 
+   23    25    75     1     0 
+   24    26    75     1     0 
+   25    27    75     1     0 
+   26    28    75     1     0 
+   27    29    75     1     0 
+   28    30    75     1     0 
+   29    31    75     1     0 
+   30    33    75     1     0 
+   31    34    75     1     0 
+   32    35    75     1     0 
+   33    36    75     1     0 
+   34    37    75     1     0 
+   35    38    75     1     0 
+   36    39    75     1     0 
+   37    40    75     1     0 
+   38    41    75     1     0 
+   39    42    75     1     0 
+   40    43    75     1     0 
+   41    44    75     1     0 
+   42    45    75     1     0 
+   43    46    75     1     0 
+   44    47    75     1     0 
+   45    48    75     1     0 
+   46    49    75     1     0 
+   47    50    75     1     0 
+   48    51    75     1     0 
+   49    52    75     1     0 
+   50    53    75     1     0 
+   51    54    75     1     0 
+   52    55    75     1     0 
+   53    56    75     1     0 
+   54    57    75     1     0 
+   55    58    75     1     0 
+   56    59    75     1     0 
+   57    60    75     1     0 
+   58    61    75     1     0 
+   59    62    75     1     0 
+   60    63    75     1     0 
+   61    64    75     1     0 
+   62    65    75     1     0 
+   63    66    75     1     0 
+   64    67    75     1     0 
+   65    68    75     1     0 
+   66    74    75     1     0 
+   67    78    75     1     0 
+#2 4
+    2     1    81     1    82 
+    7     2    81     1     0 
+    8     3    81     1     0 
+    9     4    81     1     0 
+   10     5    81     1     0 
+   11     6    81     1     0 
+   12     7    81     1     0 
+   13     8    81     1     0 
+   14     9    81     1     0 
+   15    11    81     1     0 
+   16    12    81     1     0 
+   17    13    81     1     0 
+   18    14    81     1     0 
+   19    15    81     1     0 
+   20    16    81     1     0 
+   21    17    81     1     0 
+   22    18    81     1     0 
+   23    19    81     1     0 
+   24    20    81     1     0 
+   25    21    81     1     0 
+   26    22    81     1     0 
+   27    23    81     1     0 
+   28    24    81     1     0 
+   29    25    81     1     0 
+   30    26    81     1     0 
+   31    27    81     1     0 
+   32    28    81     1     0 
+   33    29    81     1     0 
+   35    30    81     1     0 
+   36    31    81     1     0 
+   37    32    81     1     0 
+   38    33    81     1     0 
+   39    34    81     1     0 
+   40    35    81     1     0 
+   41    36    81     1     0 
+   42    37    81     1     0 
+   43    38    81     1     0 
+   44    39    81     1     0 
+   45    40    81     1     0 
+   46    41    81     1     0 
+   47    42    81     1     0 
+   48    43    81     1     0 
+   49    44    81     1     0 
+   50    45    81     1     0 
+   51    46    81     1     0 
+   52    47    81     1     0 
+   53    48    81     1     0 
+   54    49    81     1     0 
+   55    50    81     1     0 
+   56    51    81     1     0 
+   57    52    81     1     0 
+   58    53    81     1     0 
+   59    54    81     1     0 
+   60    55    81     1     0 
+   61    56    81     1     0 
+   62    57    81     1     0 
+   63    58    81     1     0 
+   64    59    81     1     0 
+   65    60    81     1     0 
+   66    66    81     1     0 
+   67    69    81     1     0 
+#3 4
+    2     1    70     1    82 
+    5     2    70     1     0 
+    6     3    70     1     0 
+    7     4    70     1     0 
+    8     5    70     1     0 
+    9     6    70     1     0 
+   10     7    70     1     0 
+   11     8    70     1     0 
+   12     9    70     1     0 
+   13    10    70     1     0 
+   14    11    70     1     0 
+   15    12    70     1     0 
+   16    13    70     1     0 
+   17    14    70     1     0 
+   21    15    70     1     0 
+   22    16    70     1     0 
+   23    17    70     1     0 
+   24    18    70     1     0 
+   25    19    70     1     0 
+   26    20    70     1     0 
+   27    21    70     1     0 
+   28    22    70     1     0 
+   29    23    70     1     0 
+   30    24    70     1     0 
+   31    25    70     1     0 
+   33    26    70     1     0 
+   34    27    70     1     0 
+   35    28    70     1     0 
+   36    29    70     1     0 
+   38    30    70     1     0 
+   39    31    70     1     0 
+   40    32    70     1     0 
+   41    33    70     1     0 
+   42    34    70     1     0 
+   43    35    70     1     0 
+   44    36    70     1     0 
+   45    37    70     1     0 
+   46    38    70     1     0 
+   47    39    70     1     0 
+   48    40    70     1     0 
+   49    41    70     1     0 
+   50    42    70     1     0 
+   51    43    70     1     0 
+   52    44    70     1     0 
+   53    45    70     1     0 
+   54    46    70     1     0 
+   55    47    70     1     0 
+   56    48    70     1     0 
+   57    49    70     1     0 
+   58    50    70     1     0 
+   59    51    70     1     0 
+   60    52    70     1     0 
+   61    53    70     1     0 
+   62    54    70     1     0 
+   63    55    70     1     0 
+   64    56    70     1     0 
+   65    57    70     1     0 
+   66    58    70     1     0 
+   67    59    70     1     0 
+   68    60    70     1     0 
+   69    61    70     1     0 
+   70    62    70     1     0 
+   71    63    70     1     0 
+   72    64    70     1     0 
+   73    65    70     1     0 
+   74    66    70     1     0 
+   75    67    70     1     0 
+   77    68    70     1     0 
+   78    69    70     1     0 
+   79    70    70     1     0 
+! CPU 120
+! SEQ_1_TO_N