git://source.jalview.org / jabaws.git / blobdiff
? search:
summary | shortlog | log | commit | commitdiff | tree
raw | inline | side by side
JWS-112 Bumping version of T-Coffee to version 11.00.8cbe486.
[jabaws.git] / binaries / src / tcoffee / example / test_lib.tc_lib
diff --git a/binaries/src/tcoffee/example/test_lib.tc_lib b/binaries/src/tcoffee/example/test_lib.tc_lib
new file mode 100644 (file)
index 0000000..e0fe861
--- /dev/null
+++ b/binaries/src/tcoffee/example/test_lib.tc_lib
@@ -0,0 +1,410 @@
+! TC_LIB_FORMAT_01
+4
+hmgb_chite 74 adkpkrplsaymlwlnsaresikrenpdfkvtevakkggelwrglkdkseweakaatakqnyiralqeyerngg
+hmgl_trybr 67 kkdsnapkramtsfmffssdfrskhsdlsivemskaagaawkelgpeerkvyeemaekdkerykrem
+hmgl_wheat 79 dpnkpkrapsaffvfmgefreefkqknpknksvaavgkaagerwkslsesekapyvakanklkgeynkaiaaynkgesa
+hmgt_mouse 71 kpkrprsayniyvsesfqeakddsaqgklklvneawknlspeekqayiqlakddrirydnemksweeqmae
+#1 2
+    1     4    65     1     0 
+    2     5    65     1     0 
+    3     6    65     1     0 
+    4     7    65     1     0 
+    5     8    65     1     0 
+    6     9    65     1     0 
+    7    10    65     1     0 
+    8    11    65     1     0 
+    9    12    65     1     0 
+   10    13    65     1     0 
+   11    14    65     1     0 
+   12    15    65     1     0 
+   13    16    65     1     0 
+   14    17    65     1     0 
+   15    18    65     1     0 
+   16    19    65     1     0 
+   17    20    65     1     0 
+   18    21    65     1     0 
+   19    22    65     1     0 
+   20    23    65     1     0 
+   21    24    65     1     0 
+   22    25    65     1     0 
+   23    26    65     1     0 
+   29    27    65     1     0 
+   30    28    65     1     0 
+   31    30    65     1     0 
+   32    31    65     1     0 
+   33    32    65     1     0 
+   34    33    65     1     0 
+   35    34    65     1     0 
+   36    35    65     1     0 
+   37    36    65     1     0 
+   38    37    65     1     0 
+   39    38    65     1     0 
+   40    39    65     1     0 
+   41    40    65     1     0 
+   42    41    65     1     0 
+   43    42    65     1     0 
+   44    43    65     1     0 
+   45    44    65     1     0 
+   46    45    65     1     0 
+   47    46    65     1     0 
+   48    49    65     1     0 
+   49    50    65     1     0 
+   50    51    65     1     0 
+   51    52    65     1     0 
+   52    53    65     1     0 
+   53    54    65     1     0 
+   54    55    65     1     0 
+   55    56    65     1     0 
+   56    57    65     1     0 
+   57    58    65     1     0 
+   58    59    65     1     0 
+   59    60    65     1     0 
+   60    61    65     1     0 
+   61    62    65     1     0 
+   62    63    65     1     0 
+   63    64    65     1     0 
+   64    65    65     1     0 
+   65    66    65     1     0 
+   66    67    65     1     0 
+#1 3
+    1     2    79     1     0 
+    2     3    79     1     0 
+    3     4    79     1     0 
+    4     5    79     1     0 
+    5     6    79     1     0 
+    6     7    79     1     0 
+    7     8    79     1     0 
+    8     9    79     1     0 
+    9    10    79     1     0 
+   10    11    79     1     0 
+   11    12    79     1     0 
+   12    13    79     1     0 
+   13    14    79     1     0 
+   14    15    79     1     0 
+   15    16    79     1     0 
+   16    17    79     1     0 
+   17    18    79     1     0 
+   18    19    79     1     0 
+   19    20    79     1     0 
+   20    21    79     1     0 
+   21    22    79     1     0 
+   22    23    79     1     0 
+   23    24    79     1     0 
+   24    25    79     1     0 
+   25    26    79     1     0 
+   26    27    79     1     0 
+   27    28    79     1     0 
+   28    29    79     1     0 
+   29    30    79     1     0 
+   30    31    79     1     0 
+   31    33    79     1     0 
+   32    34    79     1     0 
+   33    35    79     1     0 
+   34    36    79     1     0 
+   35    37    79     1     0 
+   36    38    79     1     0 
+   37    39    79     1     0 
+   38    40    79     1     0 
+   39    41    79     1     0 
+   40    42    79     1     0 
+   41    43    79     1     0 
+   42    44    79     1     0 
+   43    45    79     1     0 
+   44    46    79     1     0 
+   45    47    79     1     0 
+   46    48    79     1     0 
+   47    49    79     1     0 
+   48    52    79     1     0 
+   49    53    79     1     0 
+   50    54    79     1     0 
+   51    55    79     1     0 
+   52    56    79     1     0 
+   53    57    79     1     0 
+   54    58    79     1     0 
+   55    59    79     1     0 
+   56    60    79     1     0 
+   57    61    79     1     0 
+   58    62    79     1     0 
+   59    63    79     1     0 
+   60    64    79     1     0 
+   61    65    79     1     0 
+   62    66    79     1     0 
+   63    67    79     1     0 
+   64    68    79     1     0 
+   65    69    79     1     0 
+   66    70    79     1     0 
+   67    71    79     1     0 
+   68    72    79     1     0 
+   69    73    79     1     0 
+   70    74    79     1     0 
+   71    75    79     1     0 
+   72    76    79     1     0 
+   73    77    79     1     0 
+   74    78    79     1     0 
+#1 4
+    3     1    66     1    81 
+    4     2    66     1     0 
+    5     3    66     1     0 
+    6     4    66     1     0 
+    7     5    66     1     0 
+    8     6    66     1     0 
+    9     7    66     1     0 
+   10     8    66     1     0 
+   11     9    66     1     0 
+   12    10    66     1     0 
+   13    11    66     1     0 
+   14    12    66     1     0 
+   15    13    66     1     0 
+   16    14    66     1     0 
+   17    15    66     1     0 
+   18    16    66     1     0 
+   19    17    66     1     0 
+   20    18    66     1     0 
+   21    19    66     1     0 
+   22    20    66     1     0 
+   23    21    66     1     0 
+   24    22    66     1     0 
+   25    23    66     1     0 
+   26    24    66     1     0 
+   27    25    66     1     0 
+   28    26    66     1     0 
+   29    27    66     1     0 
+   30    28    66     1     0 
+   35    29    66     1     0 
+   36    30    66     1     0 
+   37    31    66     1     0 
+   38    32    66     1     0 
+   39    33    66     1     0 
+   40    34    66     1     0 
+   41    35    66     1     0 
+   42    36    66     1     0 
+   43    37    66     1     0 
+   44    38    66     1     0 
+   45    39    66     1     0 
+   46    40    66     1     0 
+   47    41    66     1     0 
+   48    44    66     1     0 
+   49    45    66     1     0 
+   50    46    66     1     0 
+   51    47    66     1     0 
+   52    48    66     1     0 
+   53    49    66     1     0 
+   54    50    66     1     0 
+   55    51    66     1     0 
+   56    52    66     1     0 
+   57    53    66     1     0 
+   58    54    66     1     0 
+   59    55    66     1     0 
+   60    56    66     1     0 
+   61    57    66     1     0 
+   62    58    66     1     0 
+   63    59    66     1     0 
+   64    60    66     1     0 
+   65    61    66     1     0 
+   66    62    66     1     0 
+   67    63    66     1     0 
+   68    64    66     1     0 
+   69    65    66     1     0 
+   70    66    66     1     0 
+   71    67    66     1     0 
+   72    68    66     1     0 
+   73    69    66     1     0 
+   74    70    66     1     0 
+#2 3
+    3     1    73     1    81 
+    4     2    73     1     0 
+    5     3    73     1     0 
+    6     4    73     1     0 
+    7     5    73     1     0 
+    8     6    73     1     0 
+    9     7    73     1     0 
+   10     8    73     1     0 
+   11     9    73     1     0 
+   12    10    73     1     0 
+   13    11    73     1     0 
+   14    12    73     1     0 
+   15    13    73     1     0 
+   16    14    73     1     0 
+   17    15    73     1     0 
+   18    16    73     1     0 
+   19    17    73     1     0 
+   20    18    73     1     0 
+   21    19    73     1     0 
+   22    20    73     1     0 
+   23    21    73     1     0 
+   24    22    73     1     0 
+   25    23    73     1     0 
+   26    24    73     1     0 
+   27    30    73     1     0 
+   28    31    73     1     0 
+   29    32    73     1     0 
+   30    33    73     1     0 
+   31    34    73     1     0 
+   32    35    73     1     0 
+   33    36    73     1     0 
+   34    37    73     1     0 
+   35    38    73     1     0 
+   36    39    73     1     0 
+   37    40    73     1     0 
+   38    41    73     1     0 
+   39    42    73     1     0 
+   40    43    73     1     0 
+   41    44    73     1     0 
+   42    45    73     1     0 
+   43    46    73     1     0 
+   44    47    73     1     0 
+   45    48    73     1     0 
+   46    49    73     1     0 
+   47    50    73     1     0 
+   48    51    73     1     0 
+   49    52    73     1     0 
+   50    53    73     1     0 
+   51    54    73     1     0 
+   52    55    73     1     0 
+   53    56    73     1     0 
+   54    57    73     1     0 
+   55    58    73     1     0 
+   56    59    73     1     0 
+   57    60    73     1     0 
+   58    61    73     1     0 
+   59    62    73     1     0 
+   60    63    73     1     0 
+   61    64    73     1     0 
+   62    65    73     1     0 
+   63    66    73     1     0 
+   64    67    73     1     0 
+   65    68    73     1     0 
+   66    69    73     1     0 
+   67    70    73     1     0 
+#2 4
+    6     1    73     1     0 
+    7     2    73     1     0 
+    8     3    73     1     0 
+    9     4    73     1     0 
+   10     5    73     1     0 
+   11     6    73     1     0 
+   12     7    73     1     0 
+   13     8    73     1     0 
+   14     9    73     1     0 
+   15    10    73     1     0 
+   16    11    73     1     0 
+   17    12    73     1     0 
+   18    13    73     1     0 
+   19    14    73     1     0 
+   20    15    73     1     0 
+   21    16    73     1     0 
+   22    17    73     1     0 
+   23    18    73     1     0 
+   24    19    73     1     0 
+   25    20    73     1     0 
+   26    21    73     1     0 
+   27    27    73     1     0 
+   28    28    73     1     0 
+   34    29    73     1     0 
+   35    30    73     1     0 
+   36    31    73     1     0 
+   37    32    73     1     0 
+   38    33    73     1     0 
+   39    34    73     1     0 
+   40    35    73     1     0 
+   41    36    73     1     0 
+   42    37    73     1     0 
+   43    38    73     1     0 
+   44    39    73     1     0 
+   45    40    73     1     0 
+   46    41    73     1     0 
+   47    42    73     1     0 
+   48    43    73     1     0 
+   49    44    73     1     0 
+   50    45    73     1     0 
+   51    46    73     1     0 
+   52    47    73     1     0 
+   53    48    73     1     0 
+   54    49    73     1     0 
+   55    50    73     1     0 
+   56    51    73     1     0 
+   57    52    73     1     0 
+   58    53    73     1     0 
+   59    54    73     1     0 
+   60    55    73     1     0 
+   61    56    73     1     0 
+   62    57    73     1     0 
+   63    58    73     1     0 
+   64    59    73     1     0 
+   65    60    73     1     0 
+   66    61    73     1     0 
+   67    62    73     1     0 
+#3 4
+    4     1    71     1    81 
+    5     2    71     1     0 
+    6     3    71     1     0 
+    7     4    71     1     0 
+    8     5    71     1     0 
+    9     6    71     1     0 
+   10     7    71     1     0 
+   11     8    71     1     0 
+   12     9    71     1     0 
+   13    10    71     1     0 
+   14    11    71     1     0 
+   15    12    71     1     0 
+   16    13    71     1     0 
+   17    14    71     1     0 
+   18    15    71     1     0 
+   19    16    71     1     0 
+   20    17    71     1     0 
+   21    18    71     1     0 
+   22    19    71     1     0 
+   23    20    71     1     0 
+   24    21    71     1     0 
+   25    22    71     1     0 
+   26    23    71     1     0 
+   27    24    71     1     0 
+   28    25    71     1     0 
+   29    26    71     1     0 
+   30    27    71     1     0 
+   31    28    71     1     0 
+   37    29    71     1     0 
+   38    30    71     1     0 
+   39    31    71     1     0 
+   40    32    71     1     0 
+   41    33    71     1     0 
+   42    34    71     1     0 
+   43    35    71     1     0 
+   44    36    71     1     0 
+   45    37    71     1     0 
+   46    38    71     1     0 
+   47    39    71     1     0 
+   48    40    71     1     0 
+   49    41    71     1     0 
+   50    42    71     1     0 
+   51    43    71     1     0 
+   52    44    71     1     0 
+   53    45    71     1     0 
+   54    46    71     1     0 
+   55    47    71     1     0 
+   56    48    71     1     0 
+   57    49    71     1     0 
+   58    50    71     1     0 
+   59    51    71     1     0 
+   60    52    71     1     0 
+   61    53    71     1     0 
+   62    54    71     1     0 
+   63    55    71     1     0 
+   64    56    71     1     0 
+   65    57    71     1     0 
+   66    58    71     1     0 
+   67    59    71     1     0 
+   68    60    71     1     0 
+   69    61    71     1     0 
+   70    62    71     1     0 
+   71    63    71     1     0 
+   72    64    71     1     0 
+   73    65    71     1     0 
+   74    66    71     1     0 
+   75    67    71     1     0 
+   76    68    71     1     0 
+   77    69    71     1     0 
+   78    70    71     1     0 
+   79    71    71     1     0 
+! CPU 100
+! SEQ_1_TO_N