fixes JAL-778 - flag to indicate binding between an alignment panel and Jmol view...
[jalview.git] / src / jalview / schemabinding / version2 / JalviewModel.java
index fe8deef..f7e049a 100755 (executable)
@@ -1,6 +1,6 @@
 /*\r
  * This class was automatically generated with \r
- * <a href="http://www.castor.org">Castor 0.9.6</a>, using an XML\r
+ * <a href="http://www.castor.org">Castor 1.1</a>, using an XML\r
  * Schema.\r
  * $Id$\r
  */\r
@@ -11,16 +11,8 @@ package jalview.schemabinding.version2;
  //- Imported classes and packages -/\r
 //---------------------------------/\r
 \r
-import java.io.IOException;\r
-import java.io.Reader;\r
-import java.io.Serializable;\r
-import java.io.Writer;\r
-import java.util.Date;\r
-import org.exolab.castor.xml.MarshalException;\r
 import org.exolab.castor.xml.Marshaller;\r
 import org.exolab.castor.xml.Unmarshaller;\r
-import org.exolab.castor.xml.ValidationException;\r
-import org.xml.sax.ContentHandler;\r
 \r
 /**\r
  * Class JalviewModel.\r
@@ -35,22 +27,22 @@ public class JalviewModel implements java.io.Serializable {
     //--------------------------/\r
 \r
     /**\r
-     * Field _creationDate\r
+     * Field _creationDate.\r
      */\r
     private java.util.Date _creationDate;\r
 \r
     /**\r
-     * Field _version\r
+     * Field _version.\r
      */\r
     private java.lang.String _version;\r
 \r
     /**\r
-     * Field _vamsasModel\r
+     * Field _vamsasModel.\r
      */\r
     private jalview.schemabinding.version2.VamsasModel _vamsasModel;\r
 \r
     /**\r
-     * Field _jalviewModelSequence\r
+     * Field _jalviewModelSequence.\r
      */\r
     private jalview.schemabinding.version2.JalviewModelSequence _jalviewModelSequence;\r
 \r
@@ -61,7 +53,7 @@ public class JalviewModel implements java.io.Serializable {
 \r
     public JalviewModel() {\r
         super();\r
-    } //-- jalview.schemabinding.version2.JalviewModel()\r
+    }\r
 \r
 \r
       //-----------/\r
@@ -71,102 +63,99 @@ public class JalviewModel implements java.io.Serializable {
     /**\r
      * Returns the value of field 'creationDate'.\r
      * \r
-     * @return Date\r
-     * @return the value of field 'creationDate'.\r
+     * @return the value of field 'CreationDate'.\r
      */\r
-    public java.util.Date getCreationDate()\r
-    {\r
+    public java.util.Date getCreationDate(\r
+    ) {\r
         return this._creationDate;\r
-    } //-- java.util.Date getCreationDate() \r
+    }\r
 \r
     /**\r
      * Returns the value of field 'jalviewModelSequence'.\r
      * \r
-     * @return JalviewModelSequence\r
-     * @return the value of field 'jalviewModelSequence'.\r
+     * @return the value of field 'JalviewModelSequence'.\r
      */\r
-    public jalview.schemabinding.version2.JalviewModelSequence getJalviewModelSequence()\r
-    {\r
+    public jalview.schemabinding.version2.JalviewModelSequence getJalviewModelSequence(\r
+    ) {\r
         return this._jalviewModelSequence;\r
-    } //-- jalview.schemabinding.version2.JalviewModelSequence getJalviewModelSequence() \r
+    }\r
 \r
     /**\r
      * Returns the value of field 'vamsasModel'.\r
      * \r
-     * @return VamsasModel\r
-     * @return the value of field 'vamsasModel'.\r
+     * @return the value of field 'VamsasModel'.\r
      */\r
-    public jalview.schemabinding.version2.VamsasModel getVamsasModel()\r
-    {\r
+    public jalview.schemabinding.version2.VamsasModel getVamsasModel(\r
+    ) {\r
         return this._vamsasModel;\r
-    } //-- jalview.schemabinding.version2.VamsasModel getVamsasModel() \r
+    }\r
 \r
     /**\r
      * Returns the value of field 'version'.\r
      * \r
-     * @return String\r
-     * @return the value of field 'version'.\r
+     * @return the value of field 'Version'.\r
      */\r
-    public java.lang.String getVersion()\r
-    {\r
+    public java.lang.String getVersion(\r
+    ) {\r
         return this._version;\r
-    } //-- java.lang.String getVersion() \r
+    }\r
 \r
     /**\r
-     * Method isValid\r
+     * Method isValid.\r
      * \r
-     * \r
-     * \r
-     * @return boolean\r
+     * @return true if this object is valid according to the schema\r
      */\r
-    public boolean isValid()\r
-    {\r
+    public boolean isValid(\r
+    ) {\r
         try {\r
             validate();\r
-        }\r
-        catch (org.exolab.castor.xml.ValidationException vex) {\r
+        } catch (org.exolab.castor.xml.ValidationException vex) {\r
             return false;\r
         }\r
         return true;\r
-    } //-- boolean isValid() \r
+    }\r
 \r
     /**\r
-     * Method marshal\r
-     * \r
      * \r
      * \r
      * @param out\r
-     */\r
-    public void marshal(java.io.Writer out)\r
-        throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
-    {\r
-        \r
+     * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException if object is\r
+     * null or if any SAXException is thrown during marshaling\r
+     * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException if this\r
+     * object is an invalid instance according to the schema\r
+     */\r
+    public void marshal(\r
+            final java.io.Writer out)\r
+    throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException {\r
         Marshaller.marshal(this, out);\r
-    } //-- void marshal(java.io.Writer) \r
+    }\r
 \r
     /**\r
-     * Method marshal\r
-     * \r
      * \r
      * \r
      * @param handler\r
-     */\r
-    public void marshal(org.xml.sax.ContentHandler handler)\r
-        throws java.io.IOException, org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
-    {\r
-        \r
+     * @throws java.io.IOException if an IOException occurs during\r
+     * marshaling\r
+     * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException if this\r
+     * object is an invalid instance according to the schema\r
+     * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException if object is\r
+     * null or if any SAXException is thrown during marshaling\r
+     */\r
+    public void marshal(\r
+            final org.xml.sax.ContentHandler handler)\r
+    throws java.io.IOException, org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException {\r
         Marshaller.marshal(this, handler);\r
-    } //-- void marshal(org.xml.sax.ContentHandler) \r
+    }\r
 \r
     /**\r
      * Sets the value of field 'creationDate'.\r
      * \r
      * @param creationDate the value of field 'creationDate'.\r
      */\r
-    public void setCreationDate(java.util.Date creationDate)\r
-    {\r
+    public void setCreationDate(\r
+            final java.util.Date creationDate) {\r
         this._creationDate = creationDate;\r
-    } //-- void setCreationDate(java.util.Date) \r
+    }\r
 \r
     /**\r
      * Sets the value of field 'jalviewModelSequence'.\r
@@ -174,54 +163,59 @@ public class JalviewModel implements java.io.Serializable {
      * @param jalviewModelSequence the value of field\r
      * 'jalviewModelSequence'.\r
      */\r
-    public void setJalviewModelSequence(jalview.schemabinding.version2.JalviewModelSequence jalviewModelSequence)\r
-    {\r
+    public void setJalviewModelSequence(\r
+            final jalview.schemabinding.version2.JalviewModelSequence jalviewModelSequence) {\r
         this._jalviewModelSequence = jalviewModelSequence;\r
-    } //-- void setJalviewModelSequence(jalview.schemabinding.version2.JalviewModelSequence) \r
+    }\r
 \r
     /**\r
      * Sets the value of field 'vamsasModel'.\r
      * \r
      * @param vamsasModel the value of field 'vamsasModel'.\r
      */\r
-    public void setVamsasModel(jalview.schemabinding.version2.VamsasModel vamsasModel)\r
-    {\r
+    public void setVamsasModel(\r
+            final jalview.schemabinding.version2.VamsasModel vamsasModel) {\r
         this._vamsasModel = vamsasModel;\r
-    } //-- void setVamsasModel(jalview.schemabinding.version2.VamsasModel) \r
+    }\r
 \r
     /**\r
      * Sets the value of field 'version'.\r
      * \r
      * @param version the value of field 'version'.\r
      */\r
-    public void setVersion(java.lang.String version)\r
-    {\r
+    public void setVersion(\r
+            final java.lang.String version) {\r
         this._version = version;\r
-    } //-- void setVersion(java.lang.String) \r
+    }\r
 \r
     /**\r
-     * Method unmarshal\r
-     * \r
-     * \r
+     * Method unmarshal.\r
      * \r
      * @param reader\r
-     * @return Object\r
-     */\r
-    public static java.lang.Object unmarshal(java.io.Reader reader)\r
-        throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
-    {\r
+     * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException if object is\r
+     * null or if any SAXException is thrown during marshaling\r
+     * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException if this\r
+     * object is an invalid instance according to the schema\r
+     * @return the unmarshaled\r
+     * jalview.schemabinding.version2.JalviewModel\r
+     */\r
+    public static jalview.schemabinding.version2.JalviewModel unmarshal(\r
+            final java.io.Reader reader)\r
+    throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException {\r
         return (jalview.schemabinding.version2.JalviewModel) Unmarshaller.unmarshal(jalview.schemabinding.version2.JalviewModel.class, reader);\r
-    } //-- java.lang.Object unmarshal(java.io.Reader) \r
+    }\r
 \r
     /**\r
-     * Method validate\r
      * \r
+     * \r
+     * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException if this\r
+     * object is an invalid instance according to the schema\r
      */\r
-    public void validate()\r
-        throws org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
-    {\r
+    public void validate(\r
+    )\r
+    throws org.exolab.castor.xml.ValidationException {\r
         org.exolab.castor.xml.Validator validator = new org.exolab.castor.xml.Validator();\r
         validator.validate(this);\r
-    } //-- void validate() \r
+    }\r
 \r
 }\r