fixes JAL-778 - flag to indicate binding between an alignment panel and Jmol view...
[jalview.git] / src / jalview / schemabinding / version2 / SequenceType.java
index 4c60f87..0d07812 100755 (executable)
 /*\r
- * This class was automatically generated with\r
- * <a href="http://www.castor.org">Castor 0.9.6</a>, using an XML\r
+ * This class was automatically generated with \r
+ * <a href="http://www.castor.org">Castor 1.1</a>, using an XML\r
  * Schema.\r
  * $Id$\r
  */\r
 \r
 package jalview.schemabinding.version2;\r
 \r
-//---------------------------------/\r
-//- Imported classes and packages -/\r
+  //---------------------------------/\r
+ //- Imported classes and packages -/\r
 //---------------------------------/\r
 \r
-import org.exolab.castor.xml.*;\r
+import org.exolab.castor.xml.Marshaller;\r
+import org.exolab.castor.xml.Unmarshaller;\r
 \r
 /**\r
  * Class SequenceType.\r
- *\r
+ * \r
  * @version $Revision$ $Date$\r
  */\r
-public class SequenceType\r
-    implements java.io.Serializable\r
-{\r
-\r
-  //--------------------------/\r
-  //- Class/Member Variables -/\r
-  //--------------------------/\r
-\r
-  /**\r
-   * Field _id\r
-   */\r
-  private java.lang.String _id;\r
-\r
-  /**\r
-   * Field _description\r
-   */\r
-  private java.lang.String _description;\r
-\r
-  /**\r
-   * Field _sequence\r
-   */\r
-  private java.lang.String _sequence;\r
-\r
-  /**\r
-   * Field _name\r
-   */\r
-  private java.lang.String _name;\r
-\r
-  //----------------/\r
-  //- Constructors -/\r
-  //----------------/\r
-\r
-  public SequenceType()\r
-  {\r
-    super();\r
-  } //-- jalview.schemabinding.version2.SequenceType()\r
-\r
-  //-----------/\r
-  //- Methods -/\r
-  //-----------/\r
-\r
-  /**\r
-   * Returns the value of field 'description'.\r
-   *\r
-   * @return String\r
-   * @return the value of field 'description'.\r
-   */\r
-  public java.lang.String getDescription()\r
-  {\r
-    return this._description;\r
-  } //-- java.lang.String getDescription()\r
-\r
-  /**\r
-   * Returns the value of field 'id'.\r
-   *\r
-   * @return String\r
-   * @return the value of field 'id'.\r
-   */\r
-  public java.lang.String getId()\r
-  {\r
-    return this._id;\r
-  } //-- java.lang.String getId()\r
-\r
-  /**\r
-   * Returns the value of field 'name'.\r
-   *\r
-   * @return String\r
-   * @return the value of field 'name'.\r
-   */\r
-  public java.lang.String getName()\r
-  {\r
-    return this._name;\r
-  } //-- java.lang.String getName()\r
-\r
-  /**\r
-   * Returns the value of field 'sequence'.\r
-   *\r
-   * @return String\r
-   * @return the value of field 'sequence'.\r
-   */\r
-  public java.lang.String getSequence()\r
-  {\r
-    return this._sequence;\r
-  } //-- java.lang.String getSequence()\r
-\r
-  /**\r
-   * Method isValid\r
-   *\r
-   *\r
-   *\r
-   * @return boolean\r
-   */\r
-  public boolean isValid()\r
-  {\r
-    try\r
-    {\r
-      validate();\r
+public class SequenceType implements java.io.Serializable {\r
+\r
+\r
+      //--------------------------/\r
+     //- Class/Member Variables -/\r
+    //--------------------------/\r
+\r
+    /**\r
+     * Field _id.\r
+     */\r
+    private java.lang.String _id;\r
+\r
+    /**\r
+     * Field _description.\r
+     */\r
+    private java.lang.String _description;\r
+\r
+    /**\r
+     * Field _sequence.\r
+     */\r
+    private java.lang.String _sequence;\r
+\r
+    /**\r
+     * Field _name.\r
+     */\r
+    private java.lang.String _name;\r
+\r
+\r
+      //----------------/\r
+     //- Constructors -/\r
+    //----------------/\r
+\r
+    public SequenceType() {\r
+        super();\r
     }\r
-    catch (org.exolab.castor.xml.ValidationException vex)\r
-    {\r
-      return false;\r
+\r
+\r
+      //-----------/\r
+     //- Methods -/\r
+    //-----------/\r
+\r
+    /**\r
+     * Returns the value of field 'description'.\r
+     * \r
+     * @return the value of field 'Description'.\r
+     */\r
+    public java.lang.String getDescription(\r
+    ) {\r
+        return this._description;\r
+    }\r
+\r
+    /**\r
+     * Returns the value of field 'id'.\r
+     * \r
+     * @return the value of field 'Id'.\r
+     */\r
+    public java.lang.String getId(\r
+    ) {\r
+        return this._id;\r
+    }\r
+\r
+    /**\r
+     * Returns the value of field 'name'.\r
+     * \r
+     * @return the value of field 'Name'.\r
+     */\r
+    public java.lang.String getName(\r
+    ) {\r
+        return this._name;\r
+    }\r
+\r
+    /**\r
+     * Returns the value of field 'sequence'.\r
+     * \r
+     * @return the value of field 'Sequence'.\r
+     */\r
+    public java.lang.String getSequence(\r
+    ) {\r
+        return this._sequence;\r
+    }\r
+\r
+    /**\r
+     * Method isValid.\r
+     * \r
+     * @return true if this object is valid according to the schema\r
+     */\r
+    public boolean isValid(\r
+    ) {\r
+        try {\r
+            validate();\r
+        } catch (org.exolab.castor.xml.ValidationException vex) {\r
+            return false;\r
+        }\r
+        return true;\r
+    }\r
+\r
+    /**\r
+     * \r
+     * \r
+     * @param out\r
+     * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException if object is\r
+     * null or if any SAXException is thrown during marshaling\r
+     * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException if this\r
+     * object is an invalid instance according to the schema\r
+     */\r
+    public void marshal(\r
+            final java.io.Writer out)\r
+    throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException {\r
+        Marshaller.marshal(this, out);\r
+    }\r
+\r
+    /**\r
+     * \r
+     * \r
+     * @param handler\r
+     * @throws java.io.IOException if an IOException occurs during\r
+     * marshaling\r
+     * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException if this\r
+     * object is an invalid instance according to the schema\r
+     * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException if object is\r
+     * null or if any SAXException is thrown during marshaling\r
+     */\r
+    public void marshal(\r
+            final org.xml.sax.ContentHandler handler)\r
+    throws java.io.IOException, org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException {\r
+        Marshaller.marshal(this, handler);\r
+    }\r
+\r
+    /**\r
+     * Sets the value of field 'description'.\r
+     * \r
+     * @param description the value of field 'description'.\r
+     */\r
+    public void setDescription(\r
+            final java.lang.String description) {\r
+        this._description = description;\r
+    }\r
+\r
+    /**\r
+     * Sets the value of field 'id'.\r
+     * \r
+     * @param id the value of field 'id'.\r
+     */\r
+    public void setId(\r
+            final java.lang.String id) {\r
+        this._id = id;\r
+    }\r
+\r
+    /**\r
+     * Sets the value of field 'name'.\r
+     * \r
+     * @param name the value of field 'name'.\r
+     */\r
+    public void setName(\r
+            final java.lang.String name) {\r
+        this._name = name;\r
+    }\r
+\r
+    /**\r
+     * Sets the value of field 'sequence'.\r
+     * \r
+     * @param sequence the value of field 'sequence'.\r
+     */\r
+    public void setSequence(\r
+            final java.lang.String sequence) {\r
+        this._sequence = sequence;\r
+    }\r
+\r
+    /**\r
+     * Method unmarshal.\r
+     * \r
+     * @param reader\r
+     * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException if object is\r
+     * null or if any SAXException is thrown during marshaling\r
+     * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException if this\r
+     * object is an invalid instance according to the schema\r
+     * @return the unmarshaled\r
+     * jalview.schemabinding.version2.SequenceType\r
+     */\r
+    public static jalview.schemabinding.version2.SequenceType unmarshal(\r
+            final java.io.Reader reader)\r
+    throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException {\r
+        return (jalview.schemabinding.version2.SequenceType) Unmarshaller.unmarshal(jalview.schemabinding.version2.SequenceType.class, reader);\r
+    }\r
+\r
+    /**\r
+     * \r
+     * \r
+     * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException if this\r
+     * object is an invalid instance according to the schema\r
+     */\r
+    public void validate(\r
+    )\r
+    throws org.exolab.castor.xml.ValidationException {\r
+        org.exolab.castor.xml.Validator validator = new org.exolab.castor.xml.Validator();\r
+        validator.validate(this);\r
     }\r
-    return true;\r
-  } //-- boolean isValid()\r
-\r
-  /**\r
-   * Method marshal\r
-   *\r
-   *\r
-   *\r
-   * @param out\r
-   */\r
-  public void marshal(java.io.Writer out)\r
-      throws org.exolab.castor.xml.MarshalException,\r
-      org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
-  {\r
-\r
-    Marshaller.marshal(this, out);\r
-  } //-- void marshal(java.io.Writer)\r
-\r
-  /**\r
-   * Method marshal\r
-   *\r
-   *\r
-   *\r
-   * @param handler\r
-   */\r
-  public void marshal(org.xml.sax.ContentHandler handler)\r
-      throws java.io.IOException, org.exolab.castor.xml.MarshalException,\r
-      org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
-  {\r
-\r
-    Marshaller.marshal(this, handler);\r
-  } //-- void marshal(org.xml.sax.ContentHandler)\r
-\r
-  /**\r
-   * Sets the value of field 'description'.\r
-   *\r
-   * @param description the value of field 'description'.\r
-   */\r
-  public void setDescription(java.lang.String description)\r
-  {\r
-    this._description = description;\r
-  } //-- void setDescription(java.lang.String)\r
-\r
-  /**\r
-   * Sets the value of field 'id'.\r
-   *\r
-   * @param id the value of field 'id'.\r
-   */\r
-  public void setId(java.lang.String id)\r
-  {\r
-    this._id = id;\r
-  } //-- void setId(java.lang.String)\r
-\r
-  /**\r
-   * Sets the value of field 'name'.\r
-   *\r
-   * @param name the value of field 'name'.\r
-   */\r
-  public void setName(java.lang.String name)\r
-  {\r
-    this._name = name;\r
-  } //-- void setName(java.lang.String)\r
-\r
-  /**\r
-   * Sets the value of field 'sequence'.\r
-   *\r
-   * @param sequence the value of field 'sequence'.\r
-   */\r
-  public void setSequence(java.lang.String sequence)\r
-  {\r
-    this._sequence = sequence;\r
-  } //-- void setSequence(java.lang.String)\r
-\r
-  /**\r
-   * Method unmarshal\r
-   *\r
-   *\r
-   *\r
-   * @param reader\r
-   * @return Object\r
-   */\r
-  public static java.lang.Object unmarshal(java.io.Reader reader)\r
-      throws org.exolab.castor.xml.MarshalException,\r
-      org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
-  {\r
-    return (jalview.schemabinding.version2.SequenceType) Unmarshaller.unmarshal(\r
-        jalview.schemabinding.version2.SequenceType.class, reader);\r
-  } //-- java.lang.Object unmarshal(java.io.Reader)\r
-\r
-  /**\r
-   * Method validate\r
-   *\r
-   */\r
-  public void validate()\r
-      throws org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
-  {\r
-    org.exolab.castor.xml.Validator validator = new org.exolab.castor.xml.\r
-        Validator();\r
-    validator.validate(this);\r
-  } //-- void validate()\r
 \r
 }\r