Delete unneeded directory
[jabaws.git] / website / archive / binaries / mac / src / clustalo / src / squid / types.c
diff --git a/website/archive/binaries/mac/src/clustalo/src/squid/types.c b/website/archive/binaries/mac/src/clustalo/src/squid/types.c
deleted file mode 100644 (file)
index 67ba409..0000000
+++ /dev/null
@@ -1,227 +0,0 @@
-/*****************************************************************
- * SQUID - a library of functions for biological sequence analysis
- * Copyright (C) 1992-2002 Washington University School of Medicine
- * 
- *     This source code is freely distributed under the terms of the
- *     GNU General Public License. See the files COPYRIGHT and LICENSE
- *     for details.
- *****************************************************************/
-
-/* file: types.c
- * 
- * Finicky type checkers for strings. Return 1 (TRUE) if ok, 0 elsewise.
- * Also, finicky type converters (sre_ntoh32() and friends)
- *
- * CVS $Id: types.c,v 1.5 2001/01/08 22:58:12 eddy Exp)
- */
-
-#include <string.h>
-#include <ctype.h>
-#include "squid.h"
-
-/* Function: IsInt()
- * 
- * Returns TRUE if s points to something that atoi() will parse
- * completely and convert to an integer.
- */
-int
-IsInt(char *s)
-{
-  int hex = 0;
-
-  if (s == NULL) {squid_errno = SQERR_PARAMETER; return 0; }
-
-                               /* skip whitespace */
-  while (isspace((int) (*s))) s++;      
-                               /* skip leading sign */
-  if (*s == '-' || *s == '+') s++;
-                               /* skip leading conversion signals */
-  if ((strncmp(s, "0x", 2) == 0 && (int) strlen(s) > 2) ||
-      (strncmp(s, "0X", 2) == 0 && (int) strlen(s) > 2))
-    {
-      s += 2;
-      hex = 1;
-    }
-  else if (*s == '0' && (int) strlen(s) > 1)
-    s++;
-                               /* examine remainder for garbage chars */
-  if (!hex)
-    while (*s != '\0')
-      {
-       if (!isdigit((int) (*s))) return 0;
-       s++;
-      }
-  else
-    while (*s != '\0')
-      {
-       if (!isxdigit((int) (*s))) return 0;
-       s++;
-      }
-
-  return 1;
-}
-
-
-/* Function: IsReal()
- * 
- * Purpose:  Returns TRUE if s is a string representation
- *           of a valid floating point number.
- */
-int
-IsReal(char *s)
-{
-  int gotdecimal = 0;
-  int gotexp     = 0;
-  int gotreal    = 0;
-
-  if (s == NULL) return 0;
-
-  while (isspace((int) (*s))) s++;         /* skip leading whitespace */
-  if (*s == '-' || *s == '+') s++; /* skip leading sign */
-
-  /* Examine remainder for garbage. Allowed one '.' and
-   * one 'e' or 'E'; if both '.' and e/E occur, '.'
-   * must be first.
-   */
-  while (*s != '\0')
-    {
-      if (isdigit((int) (*s))) 
-       gotreal++;
-      else if (*s == '.')
-       {
-         if (gotdecimal) return 0; /* can't have two */
-         if (gotexp) return 0; /* e/E preceded . */
-         else gotdecimal++;
-       }
-      else if (*s == 'e' || *s == 'E')
-       {
-         if (gotexp) return 0; /* can't have two */
-         else gotexp++;
-       }
-      else if (isspace((int) (*s)))
-       break;
-
-      s++;
-    }
-
-  while (isspace((int) (*s))) s++;         /* skip trailing whitespace */
-  if (*s == '\0' && gotreal) return 1;
-  else return 0;
-}
-
-
-/* Function: Byteswap()
- * 
- * Purpose:  Swap between big-endian and little-endian.
- *           For example:
- *               int foo = 0x12345678;
- *               byteswap((char *) &foo, sizeof(int));
- *               printf("%x\n", foo)
- *           gives 78563412.
- *           
- *           I don't fully understand byte-swapping issues.
- *           However, I have tested this on chars through floats,
- *           on various machines:
- *               SGI IRIX 4.0.5, SunOS 4.1.3, DEC Alpha OSF/1, Alliant
- *
- * Date: Sun Feb 12 10:26:22 1995              
- */
-void
-Byteswap(char *swap, int nbytes)
-{
-  int  x;
-  char byte;
-  
-  for (x = 0; x < nbytes / 2; x++)
-    {
-      byte = swap[nbytes - x - 1];
-      swap[nbytes - x - 1] = swap[x];
-      swap[x] = byte;
-    }
-}
-
-
-
-/* Functions: sre_ntoh16(), etc.
- * Date:      SRE, Sun Dec 31 11:26:53 2000 [St. Louis]
- *
- * Purpose:   Provide functionality of ntohs(), etc; extended
- *            to 64-bit unsigned ints, and explicitly provided
- *            in case a machine doesn't have the ntohs()
- *            family. 
- *            
- *            If we're using the host functions, 
- *            USE_HOST_BYTESWAP_FUNCTIONS was set to 1 in
- *            squidconf.h, and we #define'd sre_hton16(x)=hton(x), etc.
- *            in squid.h. In doing this, we assumed that the
- *            host functions work on 16- and 32-bit unsigned quantities.
- *            If for some reason that's not true, set 
- *            USE_HOST_BYTESWAP_FUNCTIONS to 0.
- */
-#ifndef USE_HOST_BYTESWAP_FUNCTIONS
-sqd_uint16
-sre_ntoh16(sqd_uint16 netshort)
-{
-#ifdef WORDS_BIGENDIAN
-  return netshort;
-#else
-  Byteswap((char *) &netshort, 2);
-  return netshort;
-#endif
-}
-sqd_uint32
-sre_ntoh32(sqd_uint32 netlong)
-{
-#ifdef WORDS_BIGENDIAN
-  return netlong;
-#else
-  Byteswap((char *) &netlong, 4);
-  return netlong;
-#endif
-}
-sqd_uint16
-sre_hton16(sqd_uint16 hostshort)
-{
-#ifdef WORDS_BIGENDIAN
-  return hostshort;
-#else
-  Byteswap((char *) &hostshort, 2);
-  return hostshort;
-#endif
-}
-sqd_uint32
-sre_hton32(sqd_uint32 hostlong)
-{
-#ifdef WORDS_BIGENDIAN
-  return hostlong;
-#else
-  Byteswap((char *) &hostlong, 4);
-  return hostlong;
-#endif
-}
-#endif /*USE_HOST_BYTESWAP_FUNCTIONS*/
-
-sqd_uint64
-sre_ntoh64(sqd_uint64 net_int64)
-{
-#ifdef WORDS_BIGENDIAN
-  return net_int64;
-#else
-  Byteswap((char *) &net_int64, 8);
-  return net_int64;
-#endif
-}
-sqd_uint64
-sre_hton64(sqd_uint64 host_int64)
-{
-#ifdef WORDS_BIGENDIAN
-  return host_int64;
-#else
-  Byteswap((char *) &host_int64, 8);
-  return host_int64;
-#endif
-}
-
-
-
-