Delete unneeded directory
[jabaws.git] / website / archive / binaries / mac / src / clustalw / src / general / Utility.h
diff --git a/website/archive/binaries/mac/src/clustalw/src/general/Utility.h b/website/archive/binaries/mac/src/clustalw/src/general/Utility.h
deleted file mode 100644 (file)
index b3371e6..0000000
+++ /dev/null
@@ -1,73 +0,0 @@
-/**
- * Author: Mark Larkin
- * 
- * Copyright (c) 2007 Des Higgins, Julie Thompson and Toby Gibson.  
- */
-#ifndef UTILITY_H
-#define UTILITY_H
-
-#include <cstdlib>
-#include <stdio.h>
-#include <string.h>
-#include <errno.h>
-#include <stdarg.h>
-#include <ctype.h>
-#include "clustalw.h"
-class QLabel;
-using namespace std;
-
-namespace clustalw
-{
-class Utility
-{
-    public:
-        Utility();
-       virtual ~Utility(){};
-
-        char* rTrim(char *str);
-        void rTrim(string *str);
-        char* blankToUnderscore(char *str);
-        string blankToUnderscore(string str);
-        void getStr(string instr, string& outstr);
-        char getChoice(string instr);
-        double getReal(const char *instr, double minx, double maxx, double def);
-        int getInt(const char *instr,int minx,int maxx, int def);
-        unsigned long getUniqueSequenceIdentifier();
-        bool lineType(char *line, const char *code);
-
-        bool blankLine(char *line);
-        
-        void getPath(string str, string *path);
-        
-        virtual char promptForYesNo(char *title, const char *prompt);
-        virtual char promptForYesNo(const char *title, const char *prompt);
-        virtual void error( char *msg,...);
-        virtual void error( const char *msg,...);
-        virtual void warning( char *msg,...);
-        virtual void warning( const char *msg,...);
-        virtual void info( char *msg,...);
-        virtual void info( const char *msg,...);
-        virtual void myname( char *myname );
-        template <class T> T MIN(T x, T y){if (x <= y){return x;}return y;}
-        template <class T> T MAX(T x, T y){if (x >= y){return x;}return y;}
-        // Note the following function will never be used from this class. It is for the
-        // QT version. I need it here so that I can add the function to QTUtility.
-        virtual void setInfoLabelPtr(QLabel* ptrToLabelObj);
-        bool isNumeric(char ch);
-        double average(std::vector<double>& v);
-        double stdDev(std::vector<double>& v);
-        double median(std::vector<double> v);
-        /* Attributes */
-        void beQuiet(bool b) {quiet=b;};
-        
-    private:
-        /* Functions */
-
-
-        /* Attributes */
-        bool quiet;
-
-};
-}
-#endif
-