Delete unneeded directory
[jabaws.git] / website / archive / binaries / mac / src / disembl / Tisean_3.0.1 / source_c / polynomp.c
diff --git a/website/archive/binaries/mac/src/disembl/Tisean_3.0.1/source_c/polynomp.c b/website/archive/binaries/mac/src/disembl/Tisean_3.0.1/source_c/polynomp.c
deleted file mode 100644 (file)
index 6021e19..0000000
+++ /dev/null
@@ -1,299 +0,0 @@
-/*
- *   This file is part of TISEAN
- *
- *   Copyright (c) 1998-2007 Rainer Hegger, Holger Kantz, Thomas Schreiber
- *
- *   TISEAN is free software; you can redistribute it and/or modify
- *   it under the terms of the GNU General Public License as published by
- *   the Free Software Foundation; either version 2 of the License, or
- *   (at your option) any later version.
- *
- *   TISEAN is distributed in the hope that it will be useful,
- *   but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
- *   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
- *   GNU General Public License for more details.
- *
- *   You should have received a copy of the GNU General Public License
- *   along with TISEAN; if not, write to the Free Software
- *   Foundation, Inc., 51 Franklin St, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA
- */
-/*Author: Rainer Hegger. Last modified Sep 5, 2004 */
-#include <stdio.h>
-#include <stdlib.h>
-#include <string.h>
-#include <math.h>
-#include <limits.h>
-#include <time.h>
-#include "routines/tsa.h"
-
-#define WID_STR "Fits a polynomial to the data."
-
-char *outfile=NULL,stdo=1;
-char *parin=NULL,*infile=NULL;
-unsigned long length=ULONG_MAX,insample=ULONG_MAX,exclude=0;
-unsigned long plength=UINT_MAX;
-unsigned long step=1000;
-unsigned int column=1,dim=2,delay=1,down_to=1;
-unsigned int **order;
-unsigned int verbosity=0xff;
-double *series,*param;
-
-void show_options(char *progname)
-{
-  what_i_do(progname,WID_STR);
-  fprintf(stderr,"Usage: %s [Options]\n",progname);
-  fprintf(stderr,"Options:\n");
-  fprintf(stderr,"Everything not being a valid option will be interpreted"
-          " as a possible"
-          " datafile.\nIf no datafile is given stdin is read. Just - also"
-          " means stdin\n");
-  fprintf(stderr,"\t-l # of data to use [default: whole file]\n");
-  fprintf(stderr,"\t-x # of lines to ignore [default: %lu]\n",exclude);
-  fprintf(stderr,"\t-c column to read [default: %u]\n",column);
-  fprintf(stderr,"\t-m embedding dimension [default: %u]\n",dim);
-  fprintf(stderr,"\t-d delay [default: %u]\n",delay);
-  fprintf(stderr,"\t-n insample data [default: all]\n");
-  fprintf(stderr,"\t-L length of forecasted series [default: %lu]\n",step);
-  fprintf(stderr,"\t-p name of parameter file [default: parameter.pol]\n");
-  fprintf(stderr,"\t-o output file name [default: 'datafile'.pbf]\n");
-  fprintf(stderr,"\t-V verbosity level [default: 1]\n\t\t"
-          "0='only panic messages'\n\t\t"
-          "1='+ input/output messages'\n");
-  fprintf(stderr,"\t-h show these options\n");
-  exit(0);
-}
-
-void scan_options(int n,char **in)
-{
-  char *out;
-
-  if ((out=check_option(in,n,'l','u')) != NULL)
-    sscanf(out,"%lu",&length);
-  if ((out=check_option(in,n,'x','u')) != NULL)
-    sscanf(out,"%lu",&exclude);
-  if ((out=check_option(in,n,'c','u')) != NULL)
-    sscanf(out,"%u",&column);
-  if ((out=check_option(in,n,'m','u')) != NULL)
-    sscanf(out,"%u",&dim);
-  if ((out=check_option(in,n,'d','u')) != NULL)
-    sscanf(out,"%u",&delay);
-  if ((out=check_option(in,n,'V','u')) != NULL)
-    sscanf(out,"%u",&verbosity);
-  if ((out=check_option(in,n,'n','u')) != NULL)
-    sscanf(out,"%lu",&insample);
-  if ((out=check_option(in,n,'L','u')) != NULL)
-    sscanf(out,"%lu",&step);
-  if ((out=check_option(in,n,'p','s')) != NULL)
-    parin=out;
-  if ((out=check_option(in,n,'o','o')) != NULL) {
-    stdo=0;
-    if (strlen(out) > 0)
-      outfile=out;
-  } 
-}
-
-double polynom(unsigned long act,unsigned int which)
-{
-  unsigned int i,j;
-  double ret=1.0,h;
-  
-  for (i=0;i<dim;i++) {
-    h=series[act-i*delay];
-    for (j=0;j<order[which][i];j++)
-      ret *= h;
-  }
-  
-  return ret;
-}
-
-void make_fit(void)
-{
-  double **mat,*vec;
-  double h;
-  unsigned long n,hn;
-  unsigned int i,j;
-
-  check_alloc(vec=(double*)malloc(sizeof(double)*plength));
-  check_alloc(mat=(double**)malloc(sizeof(double*)*plength));
-  for (i=0;i<plength;i++)
-    check_alloc(mat[i]=(double*)malloc(sizeof(double)*plength));
-
-  for (i=0;i<plength;i++) {
-    vec[i]=0.0;
-    for (j=0;j<plength;j++)
-      mat[i][j]=0.0;
-  }
-  
-  for (n=(dim-1)*delay;n<insample-1;n++) {
-    hn=n+1;
-    for (i=0;i<plength;i++) {
-      vec[i] += series[hn]*(h=polynom(n,i));
-      for (j=i;j<plength;j++)
-       mat[i][j] += polynom(n,j)*h;
-    }
-  }
-  for (i=0;i<plength;i++) {
-    vec[i] /= (insample-(dim-1)*delay-1);
-    for (j=i;j<plength;j++)
-      mat[j][i]=(mat[i][j]/=(insample-(dim-1)*delay)-1);
-  }
-  
-  solvele(mat,vec,plength);
-
-  for (i=0;i<plength;i++)
-    param[i]=vec[i];
-
-  free(vec);
-  for (i=0;i<plength;i++)
-    free(mat[i]);
-  free(mat);
-}
-
-double forecast_error(unsigned long i0,unsigned long i1)
-{
-  unsigned int i;
-  unsigned long n;
-  double h,error=0.0;
-
-  for (n=i0+(dim-1)*delay;n<i1-1;n++) {
-    h=0.0;
-    for (i=0;i<plength;i++)
-      h += param[i]*polynom(n,i);
-    error += (series[n+1]-h)*(series[n+1]-h);
-  }
-
-  return sqrt(error/(i1-i0-(dim-1)*delay-1));
-}
-
-void make_cast(FILE *fcast)
-{
-  int i,j,hi;
-  unsigned int k;
-  double casted;
-  
-  for (i=0;i<=(dim-1)*delay;i++)
-    series[i]=series[length-(dim-1)*delay+i-1];
-
-  hi=(dim-1)*delay;
-  for (i=1;i<=step;i++) {
-    casted=0.0;
-    for (k=0;k<plength;k++)
-      casted += param[k]*polynom((unsigned long)((dim-1)*delay),k);
-    if (!stdo) {
-      fprintf(fcast,"%e\n",casted);
-      fflush(fcast);
-    }
-    else {
-      fprintf(stdout,"%e\n",casted);
-      fflush(stdout);
-    }
-    for (j=0;j<(dim-1)*delay;j++)
-      series[j]=series[j+1];
-    series[hi]=casted;
-  }
-}
-
-int main(int argc,char **argv)
-{
-  int i,j;
-  char stdi=0,oose=1;
-  double **dummy,withalli,withallo;
-  double av,varianz;
-  FILE *file;
-
-  if (scan_help(argc,argv))
-    show_options(argv[0]);
-
-  scan_options(argc,argv);
-#ifndef OMIT_WHAT_I_DO
-  if (verbosity&VER_INPUT)
-    what_i_do(argv[0],WID_STR);
-#endif
-
-  infile=search_datafile(argc,argv,&column,verbosity);
-  if (infile == NULL)
-    stdi=1;
-  
-  if (outfile == NULL) {
-    if (!stdi) {
-      check_alloc(outfile=(char*)calloc(strlen(infile)+5,(size_t)1));
-      sprintf(outfile,"%s.pbf",infile);
-    }
-    else {
-      check_alloc(outfile=(char*)calloc((size_t)10,(size_t)1));
-      sprintf(outfile,"stdin.pbf");
-    }
-  }
-  if (!stdo)
-    test_outfile(outfile);
-
-  if (parin == NULL) {
-    check_alloc(parin=(char*)calloc((size_t)14,(size_t)1));
-    sprintf(parin,"parameter.pol");
-  }
-  file=fopen(parin,"r");
-  if (file == NULL) {
-    fprintf(stderr,"File %s does not exist. Exiting!\n",parin);
-    exit(POLYNOMP__WRONG_PARAMETER_FILE);
-  }
-  fclose(file);
-
-  dummy=(double**)get_multi_series(parin,&plength,0LU,
-                                  &dim,"",(char)"1",verbosity);
-  
-  check_alloc(order=(unsigned int**)malloc(sizeof(int*)*plength));
-  for (i=0;i<plength;i++) {
-    check_alloc(order[i]=(unsigned int*)malloc(sizeof(int)*dim));
-    for (j=0;j<dim;j++)
-      order[i][j]=(unsigned int)dummy[j][i];
-  }
-
-  series=(double*)get_series(infile,&length,exclude,column,verbosity);
-  variance(series,length,&av,&varianz);
-
-  if (insample >= length) {
-    insample=length;
-    oose=0;
-  }
-
-  check_alloc(param=(double*)malloc(sizeof(double)*plength));
-
-  make_fit();
-  withalli=forecast_error(0LU,insample);
-  withallo=0.0;
-  if (oose)
-    withallo=forecast_error(insample+1,length);
-
-  if (stdo) {
-    if (verbosity&VER_INPUT)
-      fprintf(stderr,"Writing to stdout\n");
-    fprintf(stdout,"#FCE: %e %e\n",withalli/varianz,withallo/varianz);
-    for (i=0;i<plength;i++) {
-      fprintf(stdout,"# ");
-      for (j=0;j<dim;j++)
-       fprintf(stdout,"%u ",order[i][j]);
-      fprintf(stdout,"%e\n",param[i]);
-    }
-    fflush(stdout);
-  }
-  else {
-    file=fopen(outfile,"w");
-    if (verbosity&VER_INPUT)
-      fprintf(stderr,"Opened %s for writing\n",outfile);
-    fprintf(file,"#FCE: %e %e\n",withalli/varianz,withallo/varianz);
-    for (i=0;i<plength;i++) {
-      fprintf(file,"# ");
-      for (j=0;j<dim;j++)
-       fprintf(file,"%u ",order[i][j]);
-      fprintf(file,"%e\n",param[i]);
-    }
-    fflush(file);
-  }
-  
-  make_cast(file);
-
-  if (!stdo)
-    fclose(file);
-
-  return 0;
-}