Mac binaries
[jabaws.git] / website / archive / binaries / mac / src / fasta34 / blosum50.mat
diff --git a/website/archive/binaries/mac/src/fasta34/blosum50.mat b/website/archive/binaries/mac/src/fasta34/blosum50.mat
new file mode 100644 (file)
index 0000000..513e4f2
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,29 @@
+#  Matrix made by matblas from blosum50.iij
+#  BLOSUM Clustered Scoring Matrix in 1/3 Bit Units
+#  Blocks Database = /data/blocks_5.0/blocks.dat
+#  Cluster Percentage: >= 50
+#  Entropy =   0.4808, Expected =  -0.3573
+   A  R  N  D  C  Q  E  G  H  I  L  K  M  F  P  S  T  W  Y  V  B  Z  X
+A  5 -2 -1 -2 -1 -1 -1  0 -2 -1 -2 -1 -1 -3 -1  1  0 -3 -2  0 -2 -1 -1
+R -2  7 -1 -2 -4  1  0 -3  0 -4 -3  3 -2 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -3 -1  0 -1
+N -1 -1  7  2 -2  0  0  0  1 -3 -4  0 -2 -4 -2  1  0 -4 -2 -3  4  0 -1
+D -2 -2  2  8 -4  0  2 -1 -1 -4 -4 -1 -4 -5 -1  0 -1 -5 -3 -4  5  1 -1
+C -1 -4 -2 -4 13 -3 -3 -3 -3 -2 -2 -3 -2 -2 -4 -1 -1 -5 -3 -1 -3 -3 -2
+Q -1  1  0  0 -3  7  2 -2  1 -3 -2  2  0 -4 -1  0 -1 -1 -1 -3  0  4 -1
+E -1  0  0  2 -3  2  6 -3  0 -4 -3  1 -2 -3 -1 -1 -1 -3 -2 -3  1  5 -1
+G  0 -3  0 -1 -3 -2 -3  8 -2 -4 -4 -2 -3 -4 -2  0 -2 -3 -3 -4 -1 -2 -2
+H -2  0  1 -1 -3  1  0 -2 10 -4 -3  0 -1 -1 -2 -1 -2 -3  2 -4  0  0 -1
+I -1 -4 -3 -4 -2 -3 -4 -4 -4  5  2 -3  2  0 -3 -3 -1 -3 -1  4 -4 -3 -1
+L -2 -3 -4 -4 -2 -2 -3 -4 -3  2  5 -3  3  1 -4 -3 -1 -2 -1  1 -4 -3 -1
+K -1  3  0 -1 -3  2  1 -2  0 -3 -3  6 -2 -4 -1  0 -1 -3 -2 -3  0  1 -1
+M -1 -2 -2 -4 -2  0 -2 -3 -1  2  3 -2  7  0 -3 -2 -1 -1  0  1 -3 -1 -1
+F -3 -3 -4 -5 -2 -4 -3 -4 -1  0  1 -4  0  8 -4 -3 -2  1  4 -1 -4 -4 -2
+P -1 -3 -2 -1 -4 -1 -1 -2 -2 -3 -4 -1 -3 -4 10 -1 -1 -4 -3 -3 -2 -1 -2
+S  1 -1  1  0 -1  0 -1  0 -1 -3 -3  0 -2 -3 -1  5  2 -4 -2 -2  0  0 -1
+T  0 -1  0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1  2  5 -3 -2  0  0 -1  0
+W -3 -3 -4 -5 -5 -1 -3 -3 -3 -3 -2 -3 -1  1 -4 -4 -3 15  2 -3 -5 -2 -3
+Y -2 -1 -2 -3 -3 -1 -2 -3  2 -1 -1 -2  0  4 -3 -2 -2  2  8 -1 -3 -2 -1
+V  0 -3 -3 -4 -1 -3 -3 -4 -4  4  1 -3  1 -1 -3 -2  0 -3 -1  5 -4 -3 -1
+B -2 -1  4  5 -3  0  1 -1  0 -4 -4  0 -3 -4 -2  0  0 -5 -3 -4  5  2 -1
+Z -1  0  0  1 -3  4  5 -2  0 -3 -3  1 -1 -4 -1  0 -1 -2 -2 -3  2  5 -1
+X -1 -1 -1 -1 -2 -1 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1  0 -3 -1 -1 -1 -1 -1