--- /dev/null
+# Sample dna matrix
+ A C G T U R Y M W S K D H V B N X
+A 5 -4 -4 -4 -4 2 -1 2 2 -1 -1 1 1 1 -2 -1 -1
+C -4 5 -4 -4 -4 -1 2 2 -1 2 -1 -2 1 1 1 -1 -1
+G -4 -4 5 -4 -4 2 -1 -1 -1 2 2 1 -2 1 1 -1 -1
+T -4 -4 -4 5 5 -1 2 -1 2 -1 2 1 1 -2 1 -1 -1
+U -4 -4 -4 5 5 -1 2 -1 2 -1 2 1 1 -2 1 -1 -1
+R 2 -1 2 -1 -1 2 -2 -1 1 1 1 1 -1 1 -1 -1 -1
+Y -1 2 -1 2 2 -2 2 -1 1 1 1 -1 1 -1 1 -1 -1
+M 2 2 -1 -1 -1 -1 -1 2 1 1 -1 -1 1 1 -1 -1 -1
+W 2 -1 -1 2 2 1 1 1 2 -1 1 1 1 -1 -1 -1 -1
+S -1 2 2 -1 -1 1 1 1 -1 2 1 -1 -1 1 1 -1 -1
+K -1 -1 2 2 2 1 1 -1 1 1 2 1 -1 -1 1 -1 -1
+D 1 -2 1 1 1 1 -1 -1 1 -1 1 1 -1 -1 -1 -1 -1
+H 1 1 -2 1 1 -1 1 1 1 -1 -1 -1 1 -1 -1 -1 -1
+V 1 1 1 -2 -2 1 -1 1 -1 1 -1 -1 -1 1 -1 -1 -1
+B -2 1 1 1 1 -1 1 -1 -1 1 1 -1 -1 -1 1 -1 -1
+N -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1
+X -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1