Mac binaries
[jabaws.git] / website / archive / binaries / mac / src / fasta34 / fasta.defaults
diff --git a/website/archive/binaries/mac/src/fasta34/fasta.defaults b/website/archive/binaries/mac/src/fasta34/fasta.defaults
new file mode 100644 (file)
index 0000000..9ade2ca
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,16 @@
+#pgm   mol     matrix  g_open  g_ext   fr_shft e_cut   ktup
+#      -n/-p   -s      -e      -f      -h/-j   -E      argv[3]
+fasta  prot    bl50    -10     -2      -       10.0    2
+fasta  dna     +5/-4   -14     -4      -       2.0     6
+ssearch        prot    bl50    -10     -2      -       10.0    -
+ssearch        dna     +5/-4   -14     -4      -       2.0     -
+fastx  prot    BL50    -12     -2      -20     5.0     2
+fasty  prot    BL50    -12     -2      -20/-24 5.0     2
+tfastx dna     BL50    -14     -2      -20     5.0     2
+tfasty dna     BL50    -14     -2      -20/-24 5.0     2
+fasts  prot    MD20-MS -       -       -       5.0     -
+tfasts prot    MD10-MS -       -       -       2.0     -
+fastf  prot    MD20    -       -       -       5.0     -
+tfastf prot    MD10    -       -       -       2.0     -
+fastm  prot    MD20    -       -       -       5.0     -
+tfastm prot    MD10    -       -       -       2.0     -