Delete unneeded directory
[jabaws.git] / website / archive / binaries / mac / src / fasta34 / readme.mpi_3.3
diff --git a/website/archive/binaries/mac/src/fasta34/readme.mpi_3.3 b/website/archive/binaries/mac/src/fasta34/readme.mpi_3.3
deleted file mode 100644 (file)
index 3590709..0000000
+++ /dev/null
@@ -1,59 +0,0 @@
-
- $Name: fa_34_26_5 $ - $Id: readme.mpi_3.3,v 1.4 2001/08/20 21:18:47 wrp Exp $
-
-20-August-2001
-
-This file is obsolete - see readme.v34t0, readme.v33t0, and
-readme.pvm_3.4 for more up-to-date information.  With version 3.4, the
-MPI programs are mp34comp*, mu34comp*, etc.
-
-================
-
-20 January 2000
-
-This distribution includes the first full-function MPI implementation of
-the libary-vs-library comparison programs.  The following programs are
-available:
-
-Programs to produce conventional scores and alignments:
-
-mp3compfa      protein vs protein, DNA vs DNA
-mp3compsw      protein vs protein, DNA vs DNA
-mp3compfx/     DNA vs protein
-mp3comptfx/y   protein vs DNA
-
-Programs to summarize the effectiveness of a search (require
-super-family-labeled databases):
-
-ms3compfa      protein vs protein, DNA vs DNA
-ms3compsw      protein vs protein, DNA vs DNA
-ms3compfx/     DNA vs protein
-ms3comptfx/y   protein vs DNA
-
-Programs to report the scores and alignments of the highest scoring
-unrelated sequence (require super-family-labeled databases). These
-programs are used to evaluate the super-family labeling.
-
-mu3compfa      protein vs protein, DNA vs DNA
-mu3compsw      protein vs protein, DNA vs DNA
-mucompfx/      DNA vs protein
-mu3comptfx/y   protein vs DNA
-
-Note that the current parallel implementations distribute the second
-database among 'N' parallel workers by approximately dividing the
-database into 'N' parts by seeking into the middle of the database and
-finding the next entry.  This strategy fails when the database is a
-single long sequence (the first worker gets the entire database, the
-others get nothing).
-
-This version has been tested using the MPICH implementation of MPI,
-which is available from:
-
-       ftp://ftp.mcs.anl.gov/mpi
-
-See readme.pvm_3.3 for other information about the development of
-these programs.  Both the PVM (pv3compfa, etc.) and MPI (mp3compfa,
-etc.) sets of programs use the same sets of source files; differences
-in the two implementations are specified with #define PVM_SRC and
-#define MPI_SRC.
-