Mac binaries

[jabaws.git] / website / archive / binaries / mac / src / fasta34 / uascii.h

diff --git a/website/archive/binaries/mac/src/fasta34/uascii.h b/website/archive/binaries/mac/src/fasta34/uascii.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..896f323
--- /dev/null
+++ b/website/archive/binaries/mac/src/fasta34/uascii.h
@@ -0,0 +1,57 @@
+/* Concurrent read version */
+/*     ascii.gbl       ascii translation to amino acids */
+/*     modified 10-Mar-1987 for B, Z   */
+
+/* $Name: fa_34_26_5 $ - $Id: uascii.h,v 1.6 2004/12/30 16:45:01 wrp Exp $ */
+
+#define NA 123
+#define NANN 50
+#define ESS 49 /* code for ',' in FASTS,FASTF, FASTM */
+#define EL 125
+#define ES 126
+#define AAMASK 127
+
+#ifndef XTERNAL
+/*       0  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10 11 12 13 14 15       */
+/* 32      !  "  #  $  %  &  '  (  )  *  +  ,  -  .  /         */
+/* 48   0  1  2  3  4  5  6  7  8  9  :  ;  <  =  >  ?         */
+/* 64   @  A  B  C  D  E  F  G  H  I  J  K  L  M  N  O         */ 
+/* 80   P  Q  R  S  T  U  V  W  X  Y  Z  [  \  ]  ^  _         */ 
+/* 96   `  a  b  c  d  e  f  g  h  i  j  k  l  m  n  o         */
+/*112   p  q  r  s  t  u  v  w  x  y  z  {  |  }  ~  ^?        */ 
+
+int aascii[128]={
+       EL,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,EL,NA,NA,EL,NA,NA,        /* 15 */
+       NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,        /* 31 */
+       NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,24,NA,NA,NA,NA,NA,        /* 47 */
+       NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,        /* 63 */
+       NA, 1,21, 5, 4, 7,14, 8, 9,10,NA,12,11,13, 3,NA,        /* 79 */
+       15, 6, 2,16,17,23,20,18,23,19,22,NA,NA,NA,NA,NA,        /* 95 */
+       NA, 1,21, 5, 4, 7,14, 8, 9,10,NA,12,11,13, 3,NA,        /*111 */
+       15, 6, 2,16,17,23,20,18,23,19,22,NA,NA,NA,NA,NA};       /*127 */
+
+int nascii[128]={
+/*      0  1  2  3  5  6  7  8  9 10 11 12 13 14 15 15
+        @  A  B  C  D  E  F  G  H  I  J  K  L  M  N  O
+        P  Q  R  S  T  U  V  W  X  Y  Z                */
+       EL,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,EL,NA,NA,EL,NA,NA,
+       NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,
+       NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,ES,NA,NA,16,NA,NA,
+       NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,ES,NA,NA,ES,NA,
+       NA, 1,15, 2,12,NA,NA, 3,13,NA,NA,11,NA, 8,16,NA,
+        6, 7, 6,10, 4, 5,14, 9,17, 7,NA,NA,NA,NA,NA,NA,
+       NA, 1,15, 2,12,NA,NA, 3,13,NA,NA,11,NA, 8,16,NA,
+        6, 7, 6,10, 4, 5,14, 9,17, 7,NA,NA,NA,NA,NA,NA};
+
+int *pascii;
+int qascii[128];
+int lascii[128];
+#else
+#define AAMASK 127
+extern int aascii[128];
+extern int nascii[128];
+
+extern int *pascii;
+extern int qascii[128];
+extern int lascii[128];
+#endif