Delete unneeded directory

[jabaws.git] / website / archive / binaries / mac / src / muscle / blosum62.cpp

diff --git a/website/archive/binaries/mac/src/muscle/blosum62.cpp b/website/archive/binaries/mac/src/muscle/blosum62.cpp
deleted file mode 100644 (file)
index 64124b9..0000000
--- a/website/archive/binaries/mac/src/muscle/blosum62.cpp
+++ /dev/null
@@ -1,28 +0,0 @@
-#include "muscle.h"\r
-\r
-int BLOSUM62[20][20] =\r
-    {\r
-//    A   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y \r
-    { 4,  0, -2, -1, -2,  0, -2, -1, -1, -1, -1, -2, -1, -1, -1,  1,  0,  0, -3, -2},  // A\r
-    { 0,  9, -3, -4, -2, -3, -3, -1, -3, -1, -1, -3, -3, -3, -3, -1, -1, -1, -2, -2},  // C\r
-    {-2, -3,  6,  2, -3, -1, -1, -3, -1, -4, -3,  1, -1,  0, -2,  0, -1, -3, -4, -3},  // D\r
-    {-1, -4,  2,  5, -3, -2,  0, -3,  1, -3, -2,  0, -1,  2,  0,  0, -1, -2, -3, -2},  // E\r
-    {-2, -2, -3, -3,  6, -3, -1,  0, -3,  0,  0, -3, -4, -3, -3, -2, -2, -1,  1,  3},  // F\r
-    { 0, -3, -1, -2, -3,  6, -2, -4, -2, -4, -3,  0, -2, -2, -2,  0, -2, -3, -2, -3},  // G\r
-    {-2, -3, -1,  0, -1, -2,  8, -3, -1, -3, -2,  1, -2,  0,  0, -1, -2, -3, -2,  2},  // H\r
-    {-1, -1, -3, -3,  0, -4, -3,  4, -3,  2,  1, -3, -3, -3, -3, -2, -1,  3, -3, -1},  // I\r
-    {-1, -3, -1,  1, -3, -2, -1, -3,  5, -2, -1,  0, -1,  1,  2,  0, -1, -2, -3, -2},  // K\r
-    {-1, -1, -4, -3,  0, -4, -3,  2, -2,  4,  2, -3, -3, -2, -2, -2, -1,  1, -2, -1},  // L\r
-    {-1, -1, -3, -2,  0, -3, -2,  1, -1,  2,  5, -2, -2,  0, -1, -1, -1,  1, -1, -1},  // M\r
-    {-2, -3,  1,  0, -3,  0,  1, -3,  0, -3, -2,  6, -2,  0,  0,  1,  0, -3, -4, -2},  // N\r
-    {-1, -3, -1, -1, -4, -2, -2, -3, -1, -3, -2, -2,  7, -1, -2, -1, -1, -2, -4, -3},  // P\r
-    {-1, -3,  0,  2, -3, -2,  0, -3,  1, -2,  0,  0, -1,  5,  1,  0, -1, -2, -2, -1},  // Q\r
-    {-1, -3, -2,  0, -3, -2,  0, -3,  2, -2, -1,  0, -2,  1,  5, -1, -1, -3, -3, -2},  // R\r
-    { 1, -1,  0,  0, -2,  0, -1, -2,  0, -2, -1,  1, -1,  0, -1,  4,  1, -2, -3, -2},  // S\r
-    { 0, -1, -1, -1, -2, -2, -2, -1, -1, -1, -1,  0, -1, -1, -1,  1,  5,  0, -2, -2},  // T\r
-    { 0, -1, -3, -2, -1, -3, -3,  3, -2,  1,  1, -3, -2, -2, -3, -2,  0,  4, -3, -1},  // V\r
-    {-3, -2, -4, -3,  1, -2, -2, -3, -3, -2, -1, -4, -4, -2, -3, -3, -2, -3, 11,  2},  // W\r
-    {-2, -2, -3, -2,  3, -3,  2, -1, -2, -1, -1, -2, -3, -1, -2, -2, -2, -1,  2,  7},  // Y\r
-    };\r
-\r
-double BLOSUM62_Expected = -0.5209;\r