git://source.jalview.org / jabaws.git / blobdiff
? search:
summary | shortlog | log | commit | commitdiff | tree
raw | inline | side by side
Adding changes from JWS2 branch. Fixes for Limit in particular
[jabaws.git] / website / dm_javadoc / index-files / index-16.html
diff --git a/website/dm_javadoc/index-files/index-16.html b/website/dm_javadoc/index-files/index-16.html
index c9d75cf..05abbb3 100644 (file)
--- a/website/dm_javadoc/index-files/index-16.html
+++ b/website/dm_javadoc/index-files/index-16.html
@@ -2,12 +2,12 @@
 <!--NewPage-->\r
 <HTML>\r
 <HEAD>\r
-<!-- Generated by javadoc (build 1.6.0_14) on Wed Feb 17 16:46:28 GMT 2010 -->\r
+<!-- Generated by javadoc (build 1.6.0_21) on Thu Nov 18 15:38:37 GMT 2010 -->\r
 <TITLE>\r
 S-Index\r
 </TITLE>\r
 \r
-<META NAME="date" CONTENT="2010-02-17">\r
+<META NAME="date" CONTENT="2010-11-18">\r
 \r
 <LINK REL ="stylesheet" TYPE="text/css" HREF="../stylesheet.css" TITLE="Style">\r
 \r
@@ -82,7 +82,7 @@ function windowTitle()
 <A NAME="_S_"><!-- --></A><H2>\r
 <B>S</B></H2>\r
 <DL>\r
-<DT><A HREF="../compbio/data/sequence/SequenceUtil.html" title="class in compbio.data.sequence"><B>SequenceUtil</B></A> - Class in <A HREF="../compbio/data/sequence/package-summary.html">compbio.data.sequence</A><DD>Utility class for operations on sequences<DT><A HREF="../compbio/metadata/Option.html#setDefaultValue(java.lang.String)"><B>setDefaultValue(String)</B></A> - \r
+<DT><A HREF="../compbio/data/sequence/SequenceUtil.html" title="class in compbio.data.sequence"><B>SequenceUtil</B></A> - Class in <A HREF="../compbio/data/sequence/package-summary.html">compbio.data.sequence</A><DD>Utility class for operations on sequences<DT><A HREF="../compbio/ws/client/Services.html" title="enum in compbio.ws.client"><B>Services</B></A> - Enum in <A HREF="../compbio/ws/client/package-summary.html">compbio.ws.client</A><DD>List of web services currently supported by JABAWS version 1<DT><A HREF="../compbio/metadata/Option.html#setDefaultValue(java.lang.String)"><B>setDefaultValue(String)</B></A> - \r
 Method in class compbio.metadata.<A HREF="../compbio/metadata/Option.html" title="class in compbio.metadata">Option</A>\r
 <DD>Sets one of the values defined in optionList as default.\r
 <DT><A HREF="../compbio/metadata/Parameter.html#setDefaultValue(java.lang.String)"><B>setDefaultValue(String)</B></A> - \r
@@ -123,10 +123,10 @@ Method in class compbio.metadata.<A HREF="../compbio/metadata/Preset.html" title
 <DD>&nbsp;\r
 <DT><A HREF="../compbio/metadata/RunnerConfig.html#setOptions(java.util.List)"><B>setOptions(List&lt;Option&lt;T&gt;&gt;)</B></A> - \r
 Method in class compbio.metadata.<A HREF="../compbio/metadata/RunnerConfig.html" title="class in compbio.metadata">RunnerConfig</A>\r
-<DD>&nbsp;\r
+<DD>Adds the list of options or parameters to the internal list of options\r
 <DT><A HREF="../compbio/metadata/RunnerConfig.html#setParameters(java.util.List)"><B>setParameters(List&lt;Parameter&lt;T&gt;&gt;)</B></A> - \r
 Method in class compbio.metadata.<A HREF="../compbio/metadata/RunnerConfig.html" title="class in compbio.metadata">RunnerConfig</A>\r
-<DD>&nbsp;\r
+<DD>Sets the list of parameters as internal list\r
 <DT><A HREF="../compbio/metadata/Parameter.html#setPossibleValues(java.util.Set)"><B>setPossibleValues(Set&lt;String&gt;)</B></A> - \r
 Method in class compbio.metadata.<A HREF="../compbio/metadata/Parameter.html" title="class in compbio.metadata">Parameter</A>\r
 <DD>&nbsp;\r
@@ -135,7 +135,7 @@ Method in class compbio.metadata.<A HREF="../compbio/metadata/PresetManager.html
 <DD>&nbsp;\r
 <DT><A HREF="../compbio/metadata/RunnerConfig.html#setPrmSeparator(java.lang.String)"><B>setPrmSeparator(String)</B></A> - \r
 Method in class compbio.metadata.<A HREF="../compbio/metadata/RunnerConfig.html" title="class in compbio.metadata">RunnerConfig</A>\r
-<DD>&nbsp;\r
+<DD>Sets name value separator character\r
 <DT><A HREF="../compbio/metadata/Option.html#setRequired(boolean)"><B>setRequired(boolean)</B></A> - \r
 Method in class compbio.metadata.<A HREF="../compbio/metadata/Option.html" title="class in compbio.metadata">Option</A>\r
 <DD>&nbsp;\r
@@ -144,7 +144,7 @@ Method in class compbio.metadata.<A HREF="../compbio/metadata/PresetManager.html
 <DD>&nbsp;\r
 <DT><A HREF="../compbio/metadata/RunnerConfig.html#setRunnerClassName(java.lang.String)"><B>setRunnerClassName(String)</B></A> - \r
 Method in class compbio.metadata.<A HREF="../compbio/metadata/RunnerConfig.html" title="class in compbio.metadata">RunnerConfig</A>\r
-<DD>&nbsp;\r
+<DD>Set the name of a runner class\r
 <DT><A HREF="../compbio/metadata/ValueConstrain.html#setType(compbio.metadata.ValueConstrain.Type)"><B>setType(ValueConstrain.Type)</B></A> - \r
 Method in class compbio.metadata.<A HREF="../compbio/metadata/ValueConstrain.html" title="class in compbio.metadata">ValueConstrain</A>\r
 <DD>&nbsp;\r