Change JABAWS version: 2.0.1 -> 2.5
[jabaws.git] / website / index.html
index 48de3e7..c2ae888 100644 (file)
@@ -19,7 +19,7 @@
 <table>\r
   <tr>\r
     <td style="width:158px;"><a href="http://www.dundee.ac.uk"><img src="images/uod_lt_long.gif" width="158" height="90" alt="University of Dundee" class="logo" title="University of Dundee" longdesc="http://www.dundee.ac.uk"/></a></td>\r
-    <td class="bg"><img src="images/jabaws3.png" width="263" height="60" alt="JABAWS-2.0.1" title="Java Bioinformatics Analysis Web Services version 2.0.1"/></td>\r
+    <td class="bg"><img src="images/jabaws25.png" width="263" height="60" alt="JABAWS-2.5.0" title="Java Bioinformatics Analysis Web Services version 2.5"/></td>\r
     <td class="bg"><img src="images/banner_right.png" alt="Disorder" width="200" height="80"/></td>\r
   </tr>\r
 </table>\r
@@ -41,7 +41,7 @@
 \r
 <!-- panel end-->\r
 <div id="content">\r
-<h2 id="headtitle">JABAWS 3 (alpha)</h2>\r
+<h2 id="headtitle">JABAWS 2.5</h2>\r
 <p style="color:black; font-weight:normal; text-align:left;"><span style="border-bottom:dotted 1px #666" title="JAva Bioinformatics Analysis Web Services">JABAWS</span> \r
 is free software which provides <a href="http://en.wikipedia.org/wiki/Web_service">web services</a> conveniently packaged to run on your local computer, server, cluster or Amazon EC2 instance. Services for multiple sequence alignment \r
 include <a href="http://www.clustal.org/omega">Clustal Omega</a>, <a href="http://www.clustal.org/clustal2">Clustal W</a>, \r
@@ -52,7 +52,7 @@ prediction of protein disorder with <a href="http://dis.embl.de/">DisEMBL</a>, <
 and calculation of amino acid alignment conservation with <a href="http://www.compbio.dundee.ac.uk/aacon">AACon</a>.  \r
 </p><p> \r
 <span style="color:black; font-weight:normal; text-align:left;">\r
-JABA 2.0.1 Web Services installations can be accessed from the <strong><a href="http://www.jalview.org">Jalview</a> desktop application</strong> (version 2.8 onwards) and the <strong>JABAWS command-line client</strong>, and provide multiple alignment \r
+JABA 2.5 Web Services installations can be accessed from the <strong><a href="http://www.jalview.org">Jalview</a> desktop application</strong> (version 2.8 onwards) and the <strong>JABAWS command-line client</strong>, and provide multiple alignment \r
 and sequence analysis calculations limited only by your own computing resources.<br />\r
 </span></p>\r
 <div id="mainpagefeatures">\r
@@ -87,8 +87,8 @@ and sequence analysis calculations limited only by your own computing resources.
 <strong>The Server: </strong><a href="http://www.compbio.dundee.ac.uk/download/get?id=jabaws.war">JABAWS Web Application aRchive</a>  (55M)\r
   <br/>\r
   <strong>The Client: </strong>\r
-      Command Line Client <a href="http://www.compbio.dundee.ac.uk/download/get?id=min-jaba-client-2.0.1.jar">binary</a> | <a href=\r
-"http://www.compbio.dundee.ac.uk/download/get?id=jaba-client-src-2.0.1.jar">source</a> \r
+      Command Line Client <a href="http://www.compbio.dundee.ac.uk/download/get?id=min-jaba-client-2.5.jar">binary</a> | <a href=\r
+"http://www.compbio.dundee.ac.uk/download/get?id=jaba-client-src-2.5.jar">source</a> \r
 \r
 <p>\r
 You can either use the JABAWS Virtual Appliance or the JABAWS Web Application aRchive (WAR) from your own computer or a lab server. \r
@@ -103,8 +103,8 @@ Check out the <a href="manual_qs_client.html#qsc">quick start guide</a> for furt
 </div>\r
 \r
 <h3 style="margin:0;">Public JABAWS Server</h3>\r
-<p> You can access our public JABA Web Services with our <a href="http://www.compbio.dundee.ac.uk/download/get?id=min-jaba-client-2.0.1.jar">command line client</a>, \r
-    <a href="http://www.jalview.org/download.html">Jalview</a>, or with your own program. Jalview version 2.8 or later is fully compatible with JABAWS 2.0.1.\r
+<p> You can access our public JABA Web Services with our <a href="http://www.compbio.dundee.ac.uk/download/get?id=min-jaba-client-2.5.jar">command line client</a>, \r
+    <a href="http://www.jalview.org/download.html">Jalview</a>, or with your own program. Jalview version 2.8 or later is fully compatible with JABAWS 2.5.\r
     The latest versions of Jalview are configured to use public JABAWS server by default.</p>\r
 <ul>\r
   <li>The JABAWS public web services address is <strong>http://www.compbio.dundee.ac.uk/jabaws</strong> </li>\r
@@ -116,8 +116,8 @@ title="http://www.compbio.dundee.ac.uk/jabaws/ClustalWS?" rel=
    or if you are concerned about privacy or on an unreliable network connection, then you can \r
    <a href="http://www.compbio.dundee.ac.uk/download">download</a> and run the JABAWS Server on your own hardware.</p>\r
 <h3>Previous versions of JABAWS </h3>\r
-<p>We advise you to update to JABAWS 2.0.1 as this version is fully backward compatible with JABAWS v1.0 and v2.0 and \r
-  contains <a href="man_about.html#jaba2.0.1">some important bug fixes</a>. Please consult the <a href="man_about.html#jalviewsup">manual</a> for more information \r
+<p>We advise you to update to JABAWS 2.5 as this version is fully backward compatible with JABAWS v1.0 and v2.0 and \r
+  contains <a href="man_about.html#jaba2.5">some important bug fixes</a>. Please consult the <a href="man_about.html#jalviewsup">manual</a> for more information \r
   on compatibility between versions.</p><p>Should you require them, however, old versions of JABAWS are available here:</p><ul><li>\r
   <strong><a href="http://www.compbio.dundee.ac.uk/jabaws1">http://www.compbio.dundee.ac.uk/jabaws1</a></strong></li> \r
   <li><strong><a href="http://www.compbio.dundee.ac.uk/jabaws2">http://www.compbio.dundee.ac.uk/jabaws2</a></strong></li></ul> \r